| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 665,392 | T→G | 19.4% | L79* (TTA→TGA) | iolS → | possible acetytransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 665,392 | 0 | T | G | 19.4% | 243.9 / 64.8 | 132 | L79* (TTA→TGA) | iolS | possible acetytransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/49); new base G (14/11); total (70/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TGCGACAACAGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATGAAGAAGCA > CP000730/665252‑665531 | tGCGACAACAGTTAATCACTTGTTAGTAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTATTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAAtt < 1:722922/141‑1 (MQ=255)tGCGACAACAGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAAtt < 2:1174191/141‑1 (MQ=255) acaacaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCGTTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGatat > 1:919363/1‑141 (MQ=255) acaacaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTatat < 1:1119158/141‑1 (MQ=255) aaagcaGTTAATAACTTGTTAGAAGCTTCATCTAATGACCATCATTTAAAGAAAAGACTCCAAGAACAATTTTTCTTAATCGTTGACGAAGGTAATGACATAGTTGGCTTTGCTAACTGTATTTACGGTGATGAATTatat > 2:322714/5‑141 (MQ=255) acaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTa > 1:218292/1‑141 (MQ=255) acaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATAAACATCATTTAACGAAAAGACTTCAATAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTCATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATAAGATTTa > 2:160726/1‑141 (MQ=255) ttAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAg > 1:588460/1‑141 (MQ=255) ttAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAg > 2:403772/1‑141 (MQ=255) tAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTGTATTTATCAGc > 1:60852/1‑141 (MQ=255) cACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTAAGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCAt < 2:698939/141‑1 (MQ=255) cACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTAGATAACTTTATACACGGTGAAGAATAATAATTATCATCTCAt < 2:698972/141‑1 (MQ=255) cTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATGTACGGTGAAGAAGTATATTTCTCAGCTCAttc > 1:492958/1‑140 (MQ=255) ttGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTAt < 2:1084871/141‑1 (MQ=255) ttGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTAt < 2:1084997/141‑1 (MQ=255) tGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTCATCAAACAGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATg > 1:1176231/1‑141 (MQ=255) tGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATg > 2:725322/1‑141 (MQ=255) gTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTTTGt > 2:63656/1‑141 (MQ=255) gTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGt < 2:740777/141‑1 (MQ=255) ttAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGtt < 1:1021422/141‑1 (MQ=255) ttAGAAGCTTCATAATATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGCACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGtt < 1:1021418/141‑1 (MQ=255) aGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTaa > 1:785007/1‑141 (MQ=255) aGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTaa < 2:800025/141‑1 (MQ=255) aGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATGCTTAGTCGTGGAAGAAGGTAATGACATCGTTAGCTTTGCTAACTTTATTTACGTTGAAGAATTATCTGTATCAGATAATTATGTTaa > 2:552667/1‑141 (MQ=255) gAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTaaa > 1:856694/1‑141 (MQ=255) gAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTaaa > 1:968969/1‑141 (MQ=255) aaGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGATCAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAAc > 2:1092917/1‑141 (MQ=255) aGCTTCATATAATTAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAAcc < 1:244739/141‑1 (MQ=255) gCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCa > 1:928113/1‑141 (MQ=255) gCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCa < 1:1105594/141‑1 (MQ=255) gCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATAATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCa < 2:1029309/141‑1 (MQ=255) tCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGaa < 2:106353/141‑1 (MQ=255) cATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAAt < 2:861580/141‑1 (MQ=255) atatAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATc > 1:316469/1‑141 (MQ=255) ataATGAACATCATTTAAAGTAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGc > 1:725801/1‑141 (MQ=255) ataATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGc < 2:1055336/141‑1 (MQ=255) ataAGGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGc < 2:325158/141‑1 (MQ=255) tGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACa > 2:450666/1‑141 (MQ=255) gAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAAAATCGCAACAt > 2:156752/1‑141 (MQ=255) atcatTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAg > 2:249883/1‑141 (MQ=255) atcatTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCCAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAg < 2:1025469/141‑1 (MQ=255) tcatTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTAGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCCACAtcacgg > 2:225845/1‑136 (MQ=255) atTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGtt < 1:977184/141‑1 (MQ=255) ttAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTAt > 2:572797/1‑141 (MQ=255) ttAAAGAAAAGACTTAAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTAt > 1:885882/1‑141 (MQ=255) aagaaaagaCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGt < 1:787218/141‑1 (MQ=255) gaaaagaCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTAc > 1:368658/1‑141 (MQ=255) aaaaagaCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACCTCGTGGGCGTTGCTAACTTTATTTACGGCGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTAc < 1:928667/140‑1 (MQ=255) aaagaCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAGGAATTATATGTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAg > 2:542886/1‑141 (MQ=255) aCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGAAtt > 2:885487/1‑141 (MQ=255) tCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGtt > 1:683785/1‑141 (MQ=255) tCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGtt > 2:1144499/1‑141 (MQ=255) cAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTa > 1:358185/1‑141 (MQ=255) cAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGGACAGCATTGTTa > 1:385928/1‑141 (MQ=255) aGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATTCAGGTTATGGTGCAGCATTGTTaaa > 2:316860/1‑141 (MQ=255) aaTTATTCTTAGTCGTTGAAGTAGGGGATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAg > 2:1157294/1‑141 (MQ=255) aaTTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAg > 2:898981/1‑141 (MQ=255) aaTTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAg > 2:731070/1‑141 (MQ=255) aaTTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACAGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAAAATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAg > 2:666611/1‑141 (MQ=255) attattCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAgg < 2:94137/141‑1 (MQ=255) tattCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGAt < 2:588460/141‑1 (MQ=255) tattCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGAt < 1:403772/141‑1 (MQ=255) tattCGTAGTCCTTGAAGAAGGTAATGACACCGTTGGCTTTGCTAAATCTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTAATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGAt < 1:160172/141‑1 (MQ=255) attCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGAATTGTTAAATGAAGGAtt > 2:228525/1‑141 (MQ=255) aGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACg < 1:500277/141‑1 (MQ=255) tGAAGAAGGTAATGCCATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGa > 1:782287/1‑141 (MQ=255) gaagaaGGTAATGACATCGTTGGCTTTGGCAACGGTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGaa > 1:577271/1‑141 (MQ=255) aaagtttaTGACATCGTTGGCTTTGCTAACTGTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAAAATACCGTTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGAt < 1:743547/134‑1 (MQ=255) aagGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATa > 2:66878/1‑141 (MQ=255) ggttattgtaTCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATaaa < 2:242403/132‑1 (MQ=255) ggTAATGGCTTCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATaaa < 2:951804/141‑1 (MQ=255) ggTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATgaa > 1:1193905/1‑141 (MQ=255) ggTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATaaa < 1:187125/141‑1 (MQ=255) aTGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTAAGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTAAAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAAttgg > 2:225220/1‑139 (MQ=255) tGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGa < 1:159342/141‑1 (MQ=255) gACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGaa < 2:373271/141‑1 (MQ=255) cATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAgg > 2:473544/1‑141 (MQ=255) aTCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGgt < 1:1192038/141‑1 (MQ=255) aTCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTCTTAAATGACGGATTATCACATTTTGAAGATAAATTTGAAgtt > 2:459272/1‑139 (MQ=255) tCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCCGCCCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAgggg > 1:1065875/1‑139 (MQ=255) cGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGgtgt > 1:26357/1‑141 (MQ=255) gTTGGCTTTGCTAACTTTATTTAGGGTTAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAAAATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGGTAAATTGGAAggagat > 2:39489/1‑137 (MQ=255) gTTGGCTTTGCTAACGTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGATAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGtt < 2:639189/141‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCTAAATTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAAACGCAAAATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAAAGAAGGATTATCGCGTTTTGAAGATAAATTTGAACGAGttt > 2:702294/1‑141 (MQ=255) cTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGCTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACtt < 1:356520/141‑1 (MQ=255) cTTTGCTAACTTTATTGACGGTGCAGAATGATATTTATCAGCTCATCATGTTAAACCAGAATCGAAACATACAGGTTATGGTAGAGCATTGTGAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACtt < 1:258968/141‑1 (MQ=255) gCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACAAACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGaa > 2:783796/1‑141 (MQ=255) cTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAg > 1:333461/1‑141 (MQ=255) aCTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAg < 1:542886/141‑1 (MQ=255) atttatttaCGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGAAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGa < 2:1054479/140‑1 (MQ=255) tttatttaCGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGat > 2:1043703/1‑141 (MQ=255) gttatttatGGTCAAGTATTATATATATCAGCTCAGTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGGACAGCATTTTTAAATGAAGGATTATCACGTTGTGAAAATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGat < 2:562026/140‑1 (MQ=255) taCGGGGAGGTATTGTATTTATGAGCGCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGCTTAACGAGTAGGGTATGTTTAGTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATaaa > 2:539926/1‑141 (MQ=255) ggTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAAt > 1:948846/1‑141 (MQ=255) gaagaaTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATgaa < 2:26357/141‑1 (MQ=255) agaaTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATgaaga > 2:772905/1‑141 (MQ=255) gaaTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAGCCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGGTAATAAAAATgaagaa < 1:592095/141‑1 (MQ=255) gaaTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATgaagaa < 1:341304/141‑1 (MQ=255) aaTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGGTAATAAAAATGaagaag > 1:439467/1‑141 (MQ=255) aTTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATGAAGAAGc < 2:634695/141‑1 (MQ=255) | TGCGACAACAGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATGAAGAAGCA > CP000730/665252‑665531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |