| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 512620 = | 62 (0.840) | 46 (0.870) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA |
33/204 | 0.5 | 50.8% | intergenic (+688/‑173) | recR/rrs1 | recombination protein RecR/16S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | 1998278 = | NA (NA) | intergenic (‑6/+5) | USA300HOU_t0050/rrf4 | tRNA‑Val/5S ribosomal RNA | |||||
ACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATACATTCAAA > CP000730/1998138‑1998425 | aCTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGcc > 2:221103/1‑149 (MQ=255) tACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCTACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACt < 1:418304/140‑1 (MQ=255) tACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCaa > 2:360040/1‑149 (MQ=255) tACAAGTCAGTTGCTCTACCAATGGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGGATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCaa > 2:450018/1‑149 (MQ=255) agtgatgtGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGGCCTAATTCCCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGtt > 2:221323/8‑149 (MQ=17) aGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCCGCAATATGGAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGtt < 2:274111/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTg < 1:145009/140‑1 (MQ=255) ccgTTGCTCTGCCTATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTATGAATAAATGGTGGGGTATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCCTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑TTTTAAAACTGCCTGGc < 1:501183/138‑1 (MQ=14) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGTTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTa > 2:324081/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTa > 2:599073/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGGTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGc > 1:960902/1‑140 (MQ=255) ttGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAAc > 1:291603/1‑140 (MQ=255) gCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGt < 1:642997/140‑1 (MQ=255) ctctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑CTTTAAAACTGCCTGGCACCGTTCTACTCTAg > 2:139864/1‑149 (MQ=255) tctACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑GTTTAAAACTGCCTGGCAACGTTc > 1:1002211/1‑140 (MQ=255) ccAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCAACCCACTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCACCGGTCTACTCTAGCGGaa > 2:34170/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACg > 1:662931/1‑140 (MQ=255) aGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGACGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACg > 1:669978/1‑140 (MQ=255) ggCCGGCAATATGTAAGAATAAATCGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGAc < 2:374048/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTACAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAAAGTAAGTTCGACt > 2:265648/1‑149 (MQ=255) tatatGTAGGAACAAATGGTGGAGAATGACGGGTGCGAACCGCCGACCCTCTTCTGGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCg < 1:454104/139‑1 (MQ=17) aaTATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCg < 1:982457/140‑1 (MQ=255) atatGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGa > 1:477755/1‑140 (MQ=255) tGTAAGAATAAATGGTGGAGCATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACg < 2:508772/149‑1 (MQ=255) aGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTaa < 2:525385/149‑1 (MQ=255) aGAATAAAGGGTGGTGAATGACGGGTTCGGACCGCCGACCCGCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTTAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTaa < 2:486973/149‑1 (MQ=17) aTAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGa > 1:176230/1‑140 (MQ=255) aaTGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGTCAGATGCACTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTTGACTACCATCGCCGCTAAGGAGCt > 2:374637/1‑149 (MQ=255) aaTCGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACAGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGc > 1:726107/1‑140 (MQ=255) aTGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCt > 1:715906/1‑140 (MQ=255) gtggAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAg < 1:204060/140‑1 (MQ=255) gtggAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACCTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAAc > 2:329199/1‑149 (MQ=255) gagaATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTCGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTc < 2:297606/149‑1 (MQ=255) tGACGTGTTCGAACCGCCGTCCCTCTGCTTGTAACGCAGATGCTCTCCCAGCGGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCAACGCTAAGGAGCTTaa < 1:500698/140‑1 (MQ=14) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTaa < 1:570880/140‑1 (MQ=255) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTaa > 1:440023/1‑140 (MQ=255) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTaa > 1:868536/1‑140 (MQ=255) tGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTaa > 1:922176/1‑140 (MQ=255) gACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAAAGGGCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAAc > 1:735593/1‑140 (MQ=255) cGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTCAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTCAACTTCTGTGttgg > 2:135894/1‑147 (MQ=255) ggTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCt < 1:973837/140‑1 (MQ=255) tCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATg < 2:50888/149‑1 (MQ=255) gccgACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCa > 1:825448/1‑140 (MQ=255) ccgACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAgg < 2:222991/149‑1 (MQ=255) gACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTTTGTGTTCGGCATgg < 1:550834/140‑1 (MQ=255) cccTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATCTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGCAAGCGCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAGCTTCTGTGTTCGGCATGGGa > 1:383151/1‑140 (MQ=14) ccTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGaa > 1:947203/1‑140 (MQ=255) cTTGTAAGGCCGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGgtg < 1:878105/140‑1 (MQ=255) ttGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCtt < 2:467591/149‑1 (MQ=255) gTAAGGCCGCTGTTCTGCGAGTCGAGCCAATGCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGCAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCGTTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGc < 2:584160/149‑1 (MQ=14) gTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCGGGCGACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGc > 2:246226/1‑149 (MQ=255) tAAGGCAGATGCCCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAc < 1:455673/140‑1 (MQ=255) aGGCAGATGCTCTCCCCGCTGAGCTAAGGCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAcct > 1:489929/1‑140 (MQ=255) ggCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAcctc < 1:880184/140‑1 (MQ=255) ggCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata > 2:374809/1‑149 (MQ=255) ggCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCtata > 2:439081/1‑149 (MQ=255) gacgCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCa < 2:368021/146‑1 (MQ=255) actcttccccAGCTGAGCTAATTCGCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGc < 1:810581/133‑1 (MQ=255) gCTCTCCCAGCTGGGCTAATTCCCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCCAAGTATTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTACta < 1:987633/140‑1 (MQ=14) ctctCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAg > 2:601344/1‑149 (MQ=255) ctcCCAGCTGGGGCAATCCTCCG‑‑ATTTAACACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACCACCACCGACGCTAAGGAGCCTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACATGTGCGACCTCCTTGCTATAg < 1:399440/140‑1 (MQ=14) ctcCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTACTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGAc < 2:576246/149‑1 (MQ=255) cccccAGCCGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAg < 1:316300/138‑1 (MQ=255) tcCCAGCTGAGCTAATTCGCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGt < 1:352286/140‑1 (MQ=255) cccAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTACATCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTc < 1:273905/140‑1 (MQ=255) cccAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTc < 1:721935/140‑1 (MQ=255) cccAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGAAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGCCag > 2:509187/1‑148 (MQ=255) cccAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACGCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGAACTCCTTGCTATAGTc < 1:146448/140‑1 (MQ=255) ggctaGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGAAACGTTCTACTCTCGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGa < 2:355175/145‑1 (MQ=255) gCTGAGCTAATTCTCCGACATATTAAAC‑CCCAGGCAACGTTCTACTCTGGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCAcc > 1:241281/1‑140 (MQ=11) aGCTAATTCTCCG‑‑TTTTAAAACTGCCTGGGAACGTTCGACTCTAGCGGACCGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCGCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 1:522861/140‑1 (MQ=14) aGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGATCGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 1:258569/140‑1 (MQ=255) aGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 1:676050/140‑1 (MQ=255) aGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACGGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACa < 1:944778/140‑1 (MQ=255) gCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACat < 1:841931/140‑1 (MQ=255) tAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGACTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACatat < 1:293278/140‑1 (MQ=255) gagttCTCCG‑‑ATTTGACACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGCGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAt < 2:563340/146‑1 (MQ=255) ttgcncnG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAttt < 2:539167/146‑1 (MQ=255) ctcCG‑‑ATTTAAAACTGCCCGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTtata < 2:415596/149‑1 (MQ=255) tcCG‑‑ATTTAAAACCGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGt < 1:395110/140‑1 (MQ=255) g‑‑ATTTACAACTGCCTGTCAATGTTCTTCTCTTGCGGAACGTAATTTCGACTTCCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAt < 1:52521/140‑1 (MQ=11) g‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAt < 1:50865/140‑1 (MQ=38) tAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATACATTCaaa < 2:398681/149‑1 (MQ=34) aaaaCTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTtata < 1:110523/140‑1 (MQ=33) | ACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCAATATGTAAGAATAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCG‑‑ATTTAAAACTGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATACATTCAAA > CP000730/1998138‑1998425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |