| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,233,504 | 0 | T | A | 72.1% | 91.4 / 49.7 | 68 | V470D (GTT→GAT) | prkC | non‑specific serine/threonine protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (7/12); new base A (23/26); total (30/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACTCCTAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGTTTATGTAGAAGACTTT > CP000730/1233356‑1233652 | aCTCCTAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATCTCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTCTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGCAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGt < 2:327669/149‑1 (MQ=255) ccaaaTACTGGGGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTAc < 2:27912/146‑1 (MQ=255) ccTAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTAc < 2:598032/149‑1 (MQ=255) tAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAACTGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTAAGGTCTAAAAGATGTTACgc > 2:264418/1‑148 (MQ=255) tAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGttgaga > 2:59719/1‑145 (MQ=255) tGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATa > 1:470905/1‑140 (MQ=255) tgTGAACGGGTTGAACGTGGTGAAAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTAAAAAGGTTAAAATGCAAAATATCATTCGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTAGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGtaaaaaaaaaaaa < 2:513618/148‑13 (MQ=255) ggTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGaaaa < 2:34692/149‑1 (MQ=255) gTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACg < 1:716789/140‑1 (MQ=255) tGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGa > 1:360095/1‑140 (MQ=255) tGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATCGCGTTACATCCGAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGa < 1:779770/140‑1 (MQ=255) aaCGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGta < 2:40635/149‑1 (MQ=255) cGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGGTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGa > 1:681236/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTGAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTTAAAAAGtata < 2:303247/149‑1 (MQ=255) tgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGaaa > 1:169216/1‑140 (MQ=255) tgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGaaa < 1:938264/140‑1 (MQ=255) tGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATAAGATTGAAAAAg > 1:846883/1‑140 (MQ=255) tggtgACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGtatata < 1:442407/140‑1 (MQ=255) gtgACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATataat > 1:875838/1‑140 (MQ=255) aGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCaaa < 2:446505/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCa < 1:665404/140‑1 (MQ=255) gtTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAgc > 1:184525/1‑140 (MQ=255) atatCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATa > 1:51981/1‑140 (MQ=255) tatCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATAc < 1:156330/140‑1 (MQ=255) tagcAAAGGGGCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGCTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATAc < 1:52035/137‑1 (MQ=255) ggCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCaaa > 1:537924/1‑140 (MQ=255) ggCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGACATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCGTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCaaa > 1:651331/1‑140 (MQ=255) ccTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCa > 1:505117/1‑140 (MQ=255) aaaaGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCa > 2:546337/1‑149 (MQ=255) aGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATAGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCGAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTa < 1:654078/140‑1 (MQ=255) gTTAAAAGGACGAATGTAATTGCTTTACACAAGGAGGATGCTGTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAATATAAAACAAAAGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATAc < 2:325933/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCATTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTACAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTCaaa > 2:203377/1‑149 (MQ=255) aTGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGaa > 1:414356/1‑140 (MQ=255) caatGGTTTACCGAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATg < 2:467134/146‑1 (MQ=255) cATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATg < 2:343361/149‑1 (MQ=255) cATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCg > 1:538299/1‑140 (MQ=255) ggTTTACCTAAGGAGGAAGCCGTGCAGAAATTAAGAGCGTTAGGGCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACAGTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAAGCGCTAt < 1:916391/140‑1 (MQ=255) tAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGAtt < 1:809545/140‑1 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTaaa > 2:177548/1‑149 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTaaa < 2:556399/149‑1 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCt > 1:637033/1‑140 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGAGACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCt < 1:134593/140‑1 (MQ=255) gagggAGCCTTGAAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATAGGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCTAAATGCAACCGCAAATACTGAAATCGCGATTCATGATTCTaa > 1:713003/1‑140 (MQ=255) aggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACta > 2:517155/1‑149 (MQ=255) aggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACta > 2:235998/1‑149 (MQ=255) aggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATAGTTCTCCAAAAAGGGATGGGGTAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACCGAAATCGCTATTCAGGATTCTAat < 1:738768/140‑1 (MQ=255) ggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAata > 1:446434/1‑140 (MQ=255) aGCCTTGCAGAAATTAAAAGCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATCATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTa > 1:606478/1‑140 (MQ=255) cTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGAGTGAAAAGGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAAc > 1:532734/1‑140 (MQ=255) gCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACtat < 1:667813/140‑1 (MQ=255) aGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAACCAAGAACCAGAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTatat < 1:735749/140‑1 (MQ=255) aGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAAGAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACGGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTatat < 1:204130/140‑1 (MQ=255) gAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAg < 2:213612/149‑1 (MQ=255) gAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATg < 1:150221/140‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGa < 1:919255/140‑1 (MQ=255) aTTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCa < 2:538699/149‑1 (MQ=255) aTTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATAATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCACAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAAt < 1:617716/140‑1 (MQ=255) ttAAAATCGTTAGGTCTTACAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATc > 1:553049/1‑140 (MQ=255) ttAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATc < 1:74416/140‑1 (MQ=255) agcGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAg < 1:707674/138‑1 (MQ=255) aTCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACCATATGAATCTTTAg < 1:555301/140‑1 (MQ=255) gTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAATGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAg > 2:386289/1‑149 (MQ=255) ttAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTTTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCAt > 1:968120/1‑140 (MQ=255) tAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATATTAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAATCTATATGAATCTTTAGGCAtt > 1:700596/1‑140 (MQ=255) tAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCAtt > 1:534443/1‑140 (MQ=255) aGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTa < 1:446431/140‑1 (MQ=255) aGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTa < 1:781351/140‑1 (MQ=255) gTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGTTTAt < 2:133377/149‑1 (MQ=255) gTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAg < 1:552559/140‑1 (MQ=255) tAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAg < 1:223175/140‑1 (MQ=255) aaaGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCTTGATTTTAATGTTTAATTTTATGATTCTTTAGGAATTTAGTAAGt > 1:249258/1‑140 (MQ=255) ttACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCACTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGTTTATGTAGAAGACttt < 2:416529/149‑1 (MQ=255) | ACTCCTAATACTGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGTTTATGTAGAAGACTTT > CP000730/1233356‑1233652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |