| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,295 | 0 | T | C | 60.9% | 347.5 / inf | 581 | intergenic (+353/‑781) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 589 total aligned reads displayed.
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(MQ=18) aaGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGATCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagc > 1:566894/1‑138 (MQ=11) gATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTATTATCCGGCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctt < 1:333604/141‑6 (MQ=11) ttATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGAAAACGTACATCATTCAACGGGCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAAAAAAAGCTAATTACAAATGGcta > 2:162611/1‑139 (MQ=255) | ATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGT > CP000730/76156‑76435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |