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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,322 | 0 | G | A | 59.7% | 270.9 / inf | 550 | intergenic (+380/‑754) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 557 total aligned reads displayed.
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2:501241/141‑1 (MQ=14) atatatCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAA‑GCTAATTACAAATGGCGTATtgaag > 2:333652/1‑139 (MQ=11) tatctCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAA‑GCTAATTACAAATGGCGTATTGATgag > 2:280689/1‑141 (MQ=255) atCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATAATTCAACGATCTACCGTTGAGTTCAAAAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGACT‑AAAAACGCTGATTACAAATGGCTTATAGTTgagaa > 1:188733/1‑140 (MQ=1) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAA‑GCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAA > CP000730/76182‑76461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |