| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP000730 | = 515946 | NA (NA) | 3 (0.050) | 3/286 | 2.3 | NA | noncoding (1241/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA |
| ? | CP000730 | = 515981 | NA (NA) | noncoding (1276/2921 nt) | rrl1 | 23S ribosomal RNA | |||||
CCCAGACAACTAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/515790‑515946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctaagCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT < CP000730/515981‑515832 CCCAGACAACTAGGATGTTGGCTTAGCAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACGAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATAACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT < 2:842014/151‑1CCCAGACAACTAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGT > 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1:640417/151‑1 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTC > 1:182720/1‑151 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTC < 2:153689/151‑1 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTC < 1:74414/151‑1 AAGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTC < 1:435297/151‑1 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT > 2:920169/1‑151 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT < 1:700306/151‑1 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT > 1:866671/1‑151 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT > 1:352638/1‑151 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT > 1:854776/1‑151 AGCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCCCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCT > 2:341124/1‑151 GCGCTCCGCATGTCCGTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT < 1:514223/151‑1 GCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTACTCCATTTACACCACGTAAATTCTAAGCGCAGTGTCACCCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT > 1:97470/1‑151 GCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT > 1:343003/1‑151 GCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT > 1:872061/1‑151 GCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT < 1:746209/151‑1 GCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT > 2:298685/1‑151 CCCAGACAACTAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCATCATTTAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTAGTCGAGTGACACTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACATATTACCGAAGCTGTGGATTGTCCTTTGGACAATGGTAGGAGAGCGTTCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/515790‑515946‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctaagCGCTCCACATGTCCTTACGATCATGCTTCAACGCCCTTAGAACGCTCTCCTACCATTGTCCAAAGGACAATCCACAGCTTCGGTAATATGTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGTGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTT < CP000730/515981‑515832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |