| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CATTAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATAGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/517290‑517446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catagctACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA < CP000730/517450‑517301 CATTAGAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGC < 2:663590/151‑1CATTAAAGCGGTTCGCGAGCTGGGTTCAGAACGTGGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTAGGCGGAGGAAAGTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACATCTGGTGTACCCGTTGTCGTACCAACGGC < 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TAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATA > 1:111849/1‑151 TAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATA > 1:140067/1‑151 TAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATA > 2:869326/1‑151 AAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGGACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATAG < 2:592684/151‑1 AAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGGGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTCCTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATAG > 2:189853/1‑151 AAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATAG > 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ATAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTC < 2:506848/151‑1 TAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCG < 2:489566/151‑1 TAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCG > 2:516588/1‑151 TAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCG > 1:587297/1‑151 TAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCG > 2:677335/1‑151 TAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCG > 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2:778938/151‑1 GCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCG > 2:380161/1‑151 GCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCG > 2:324689/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 2:784039/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 2:396031/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 1:587778/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 1:442741/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 2:592164/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT < 1:321195/151‑1 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGT > 1:661298/1‑151 CTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACCCCCACGCCGGATACGGACCGAACTGCCCCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGc > 2:712492/1‑150 TACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA > 1:432245/1‑151 TACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA > 2:550411/1‑151 TACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA > 1:648540/1‑151 TACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA > 2:1034593/1‑151 TACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA > 2:169343/1‑151 CATTAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGTGGGCGTAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACATACCTCTGGTGTACCAGTTGTCGTGCCAACGGCATAGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000730/517290‑517446‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catagctACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTA < CP000730/517450‑517301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |