| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,002,484 | 0 | T | C | 60.5% | 187.6 / 217.0 | 185 | noncoding (930/1540 nt) | rrs3 | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/35); new base C (56/56); total (94/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTG > CP000730/2002335‑2002631 | gacacgaGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTc < 1:377852/151‑1 (MQ=32) cgaGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCg < 2:419704/151‑1 (MQ=32) aGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCCCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTc > 2:944496/1‑151 (MQ=14) gCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCa < 1:531265/151‑1 (MQ=32) gCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACGTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACCTGCTCCCCCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCa < 1:34888/151‑1 (MQ=9) cTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCaa < 2:151709/151‑1 (MQ=32) gacgacAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAAtt > 2:248223/1‑151 (MQ=31) cgacAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCACGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTcc > 2:200964/1‑151 (MQ=17) acAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCtt > 1:123876/1‑151 (MQ=32) acAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGATGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCtt > 2:373688/1‑151 (MQ=17) cAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCttt > 2:444170/1‑151 (MQ=32) cATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGt > 1:86135/1‑151 (MQ=32) aTGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGtt < 2:602752/151‑1 (MQ=31) gCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTc < 2:230633/151‑1 (MQ=32) caccTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAAcc < 2:988466/151‑1 (MQ=31) caccTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAAcc > 1:716164/1‑151 (MQ=32) tGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGGTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGc > 1:733470/1‑151 (MQ=14) gTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCg > 1:786671/1‑151 (MQ=32) tCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCgg < 2:1018833/151‑1 (MQ=31) tCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCgg < 1:73199/151‑1 (MQ=32) cACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGt < 2:125098/151‑1 (MQ=31) cACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGt > 2:637485/1‑151 (MQ=32) tttGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGt < 2:1826/151‑1 (MQ=32) tttGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGt < 1:27453/151‑1 (MQ=32) tGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTAc > 1:185547/1‑151 (MQ=32) tGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTAc > 1:654864/1‑151 (MQ=31) gTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGGCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACt > 2:751228/1‑151 (MQ=17) cccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTcc < 1:1001052/151‑1 (MQ=32) ccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTccc > 1:105226/1‑151 (MQ=32) ccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTccc > 2:592807/1‑151 (MQ=31) ccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTccc > 1:947573/1‑151 (MQ=32) cccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTcccc > 2:801714/1‑151 (MQ=31) aGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCg < 1:323368/151‑1 (MQ=32) ggggAAAGCTCTATCTCTTGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCgg < 2:808497/151‑1 (MQ=14) gggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGa < 2:901860/151‑1 (MQ=31) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg < 1:844827/151‑1 (MQ=32) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGAGTCCCCGACAATTCCTTTGAGTTACAGCCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg < 2:776226/151‑1 (MQ=9) gAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTAAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGt > 1:220146/1‑151 (MQ=14) tctgaaaacttccgtggatgtcaagaccaggtAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtt < 2:652848‑M1/136‑16 (MQ=255) ctgaaaacttccgtggatgtcaagaccaggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtta < 2:511253‑M1/137‑17 (MQ=255) tgaaaacttccgtggatgtcaagaccagGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttag > 1:1040706‑M1/14‑134 (MQ=255) gggaaagttctgtggatgtcaagaccagGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttag < 1:780649‑M1/138‑18 (MQ=255) gaaaacttccgtggatgtcaagaccaGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagc > 1:984799‑M1/13‑133 (MQ=255) gaaaacttccgtggatgtcaagaccaGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagc < 2:769574‑M1/139‑19 (MQ=255) gaaaacttccgtggatgtcaagaccaGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagc > 1:103265‑M1/13‑133 (MQ=255) cttccgtggatgtcaaGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccgg > 1:132728‑M1/8‑128 (MQ=255) cttccgtggatgtcaaGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccgg > 1:204954‑M1/8‑128 (MQ=255) tccgtggatgtcAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaa > 1:863435‑M1/6‑126 (MQ=255) ccgtggatgtCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaag < 1:609235‑M1/147‑27 (MQ=255) ccgtggatgtCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaag < 2:128865‑M1/147‑27 (MQ=255) gtggatGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCGCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagcc < 2:459995‑M1/149‑29 (MQ=255) gtggatGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagcc < 1:420504‑M1/149‑29 (MQ=255) tgtcaagaccaggtaaggttcttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcc < 1:409126‑M1/140‑34 (MQ=255) tgtcaagaccaggtaaggttcttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcc > 2:854013‑M1/12‑118 (MQ=255) gtcaagaccaggtaaggttcttCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcct > 2:561066‑M1/11‑117 (MQ=255) tcaagaccaggtaaggttctTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctc > 2:843827‑M1/10‑116 (MQ=255) aagaccaggtaaggttCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTCTCTTAGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaa < 1:766734‑M1/144‑38 (MQ=255) gaccaggtaaggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagg < 2:148109‑M1/146‑40 (MQ=255) ccaggtaaGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggc < 1:583972‑M1/148‑42 (MQ=255) caggtaAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggca > 2:566835‑M1/3‑109 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca > 1:237169‑M1/1‑107 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca < 1:191240‑M1/151‑45 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGAGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca > 2:914615‑M1/1‑107 (MQ=255) gTAAGGTTCTTCGCGGTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaa < 2:532951‑M1/151‑46 (MQ=255) tAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaac > 2:256934‑M1/1‑105 (MQ=255) ggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctc > 1:531566‑M1/1‑102 (MQ=255) ggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctc < 1:660845‑M1/151‑50 (MQ=255) gTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctcc < 1:473157‑M1/151‑51 (MQ=255) cttcGCGTTTCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTTCGGGCCCCCTTCAATTCATTTGAGTTGTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaag < 1:951028‑M1/151‑54 (MQ=255) cttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaag < 1:130310‑M1/151‑54 (MQ=255) cttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaag > 1:340536‑M1/1‑98 (MQ=255) tcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtc < 1:24557‑M1/151‑56 (MQ=255) gTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgaca > 1:5053‑M1/1‑92 (MQ=255) ttGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacat > 1:31460‑M1/1‑91 (MQ=255) tGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgctagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatc < 2:203959‑M1/151‑62 (MQ=255) atcGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtt > 1:709352‑M1/2‑87 (MQ=255) atcGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtt < 1:216158‑M1/150‑65 (MQ=255) atcGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtt > 1:372291‑M1/2‑87 (MQ=255) tCGAATTAAACCACATGCTCCCCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgttt < 2:867826‑M1/151‑66 (MQ=255) tCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgttt > 2:526867‑M1/1‑86 (MQ=255) cGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGgcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctcccagtcgacatcgttta > 2:657651‑M1/1‑85 (MQ=255) gAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttac > 2:708024‑M1/1‑84 (MQ=255) aTTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacgg < 2:295958‑M1/151‑70 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg < 2:971005‑M1/151‑72 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg > 2:390249‑M1/1‑80 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGCtcgacttaacgcgtcagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg > 2:699558‑M1/1‑80 (MQ=255) aaaCCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGGTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgctagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgt > 2:678499‑M1/1‑79 (MQ=255) aaCCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacagatcggaagagcgt < 1:992441‑M1/151‑74 (MQ=255) cacaTGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggac > 1:954830‑M1/1‑75 (MQ=255) aTGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactac > 2:675060‑M1/1‑72 (MQ=255) cTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccag > 1:813024‑M1/1‑69 (MQ=255) cccccgctTGCGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccaggg < 1:541587‑M1/148‑85 (MQ=255) ccACCTCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccaggg < 1:888792‑M1/151‑85 (MQ=255) cACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggt < 1:931441‑M1/151‑86 (MQ=255) aCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggta < 2:730375‑M1/151‑87 (MQ=255) cGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatc < 2:880889‑M1/151‑89 (MQ=255) cGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATGTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCGCCCGCGGtcgacttaacgcggtagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatc < 1:1005463‑M1/151‑89 (MQ=255) tgtgCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaat > 2:349655‑M1/1‑59 (MQ=255) tgCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACCCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcc < 2:896753‑M1/151‑95 (MQ=255) gggCCCCCGTCAATTCATTTGATTTTTAACCGTGCTGCCGGACTCCCCAGGCGGtcgacgtaacgcggtagcgccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgt < 1:747156‑M1/151‑98 (MQ=255) | GACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTG > CP000730/2002335‑2002631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |