| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,002,507 | 0 | C | T | 75.0% | 355.8 / 120.7 | 176 | noncoding (907/1540 nt) | rrs3 | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/19); new base T (71/61); total (96/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCG > CP000730/2002357‑2002650 | gCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTc < 2:230633/151‑1 (MQ=32) caccTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAAcc > 1:779529/1‑151 (MQ=32) caccTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAAcc > 1:716164/1‑151 (MQ=32) tGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGGTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGc > 1:733470/1‑151 (MQ=14) gTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGCATGTAACTACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCg > 1:19064/1‑151 (MQ=255) gTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCg > 1:786671/1‑151 (MQ=32) gTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCg > 1:562557/1‑151 (MQ=32) tCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCgg < 1:73199/151‑1 (MQ=32) gTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGGCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACt > 2:751228/1‑151 (MQ=17) cccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTcc < 1:1001052/151‑1 (MQ=32) ccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTTCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTccc > 1:1059372/1‑151 (MQ=17) ccccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTccc > 1:947573/1‑151 (MQ=32) cccGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTcccc < 2:517954/151‑1 (MQ=31) aGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCg < 1:323368/151‑1 (MQ=32) gggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGa < 2:58758/151‑1 (MQ=32) gggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGa < 2:901860/151‑1 (MQ=31) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg < 1:859616/151‑1 (MQ=31) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg > 1:387957/1‑151 (MQ=31) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCCTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg < 1:176938/151‑1 (MQ=14) ggAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGGTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAg > 1:952236/1‑151 (MQ=14) gAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGt > 2:986511/1‑151 (MQ=31) aaGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGc > 1:486633/1‑151 (MQ=31) aGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCt < 1:356299/151‑1 (MQ=11) tctgaaaacttccgtggatgtcaagaccaggtAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtt < 2:652848‑M1/136‑16 (MQ=255) ctgaaaacttccgtggatgtcaagaccaggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtta < 2:511253‑M1/137‑17 (MQ=255) ctgaaaacttccgtggatgtcaagaccaggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtta < 2:828033‑M1/137‑17 (MQ=255) gaaaacttccgtggatgtcaagaccaGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagc > 1:984799‑M1/13‑133 (MQ=255) gaaaacttccgtggatgtcaagaccaGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagc < 2:769574‑M1/139‑19 (MQ=255) aagttctgtggatgtcaagaCCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctcc < 1:411218‑M1/142‑22 (MQ=255) gttctgtggatgtcaaGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccgg > 1:657688‑M1/8‑128 (MQ=255) cttccgtggatgtcaaGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccgg > 1:132728‑M1/8‑128 (MQ=255) ttctgtggatgtcaAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgtt > 2:527630‑M1/7‑127 (MQ=255) tccgtggatgtcAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaa > 1:863435‑M1/6‑126 (MQ=255) ccgtggatgtCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaag < 2:128865‑M1/147‑27 (MQ=255) ccgtggatgtCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaag > 2:268042‑M1/5‑125 (MQ=255) aggtggatgtCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGCTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaag > 2:148135‑M1/5‑125 (MQ=255) gtggatGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagcc < 1:420504‑M1/149‑29 (MQ=255) tggaTGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagcca < 1:222104‑M1/150‑30 (MQ=255) atgtcaagaccaggtaaggttcttcgCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgc < 2:803426‑M1/139‑33 (MQ=255) tgtcaagaccaggtaaggttcttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcc > 2:854013‑M1/12‑118 (MQ=255) gtcaagaccaggtaaggttcttCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcct > 2:561066‑M1/11‑117 (MQ=255) tcaagaccaggtaaggttctTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctc > 2:843827‑M1/10‑116 (MQ=255) aagaccaggtaaggttCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaa > 2:248664‑M1/8‑114 (MQ=255) aagaccaggtaaggttCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagcgccggaagccacgcctcan < 2:130050‑M1/144‑38 (MQ=255) agaccaggtaaggtTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaag > 1:75223‑M1/7‑113 (MQ=255) gaccaggtaaggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagg > 1:834836‑M1/6‑112 (MQ=255) caggtaAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggca > 1:961046‑M1/3‑109 (MQ=255) caggtaAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggca > 2:566835‑M1/3‑109 (MQ=255) caggtaAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggca > 2:4593‑M1/3‑109 (MQ=255) aggtAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAACCCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcac < 2:352352‑M1/150‑44 (MQ=255) aggtAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcac < 1:1020166‑M1/150‑44 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca < 1:191240‑M1/151‑45 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca > 1:254492‑M1/1‑107 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca > 2:646898‑M1/1‑107 (MQ=255) ggTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGAGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcaca > 2:914615‑M1/1‑107 (MQ=255) aGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacct > 1:783530‑M1/1‑103 (MQ=255) ggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctc < 1:660845‑M1/151‑50 (MQ=255) ggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctc > 1:531566‑M1/1‑102 (MQ=255) ggTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCAGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctc > 1:907909‑M1/1‑102 (MQ=255) ttcttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctcca > 2:76216‑M1/1‑100 (MQ=255) ttcttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGccgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctcca < 2:102080‑M1/151‑52 (MQ=255) cttcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaag > 1:340536‑M1/1‑98 (MQ=255) tcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtc < 1:24557‑M1/151‑56 (MQ=255) tcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtc < 1:1043927‑M1/151‑56 (MQ=255) tcGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtc > 1:1033970‑M1/1‑96 (MQ=255) gTTGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgaca > 1:5053‑M1/1‑92 (MQ=255) tGCATCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgctagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatc < 2:203959‑M1/151‑62 (MQ=255) catcgAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgt > 2:951140‑M1/3‑88 (MQ=255) atcGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtt < 1:216158‑M1/150‑65 (MQ=255) atcGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtt > 1:617368‑M1/2‑87 (MQ=255) tCGAATTAAACCACATGCTCCCCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgttt < 2:867826‑M1/151‑66 (MQ=255) cGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGgcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctcccagtcgacatcgttta > 2:657651‑M1/1‑85 (MQ=255) gAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttac > 2:708024‑M1/1‑84 (MQ=255) gAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTAAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttac < 2:69844‑M1/151‑68 (MQ=255) aTTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacgg < 2:295958‑M1/151‑70 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg > 2:390249‑M1/1‑80 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGCtcgacttaacgcgtcagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg > 2:699558‑M1/1‑80 (MQ=255) tAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTCTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcg > 2:784594‑M1/1‑80 (MQ=255) aaCCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacagatcggaagagcgt < 1:992441‑M1/151‑74 (MQ=255) aCCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtgg > 1:740125‑M1/1‑77 (MQ=255) ccccatgcTCCACCGCCTGGGCGGGCCCCCGTCCAGTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgactttacgcgttaggtccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagccgacatcgtttacggcgtgga < 2:899363‑M1/148‑76 (MQ=255) acaTGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggact > 2:543314‑M1/1‑74 (MQ=255) aTGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactac > 2:675060‑M1/1‑72 (MQ=255) gCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactacca < 1:275111‑M1/151‑82 (MQ=255) cccccgctTGCGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccaggg < 1:541587‑M1/148‑85 (MQ=255) ccACCTCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccaggg < 1:888792‑M1/151‑85 (MQ=255) aCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggta < 2:730375‑M1/151‑87 (MQ=255) cGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatc < 2:880889‑M1/151‑89 (MQ=255) cGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATGTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCGCCCGCGGtcgacttaacgcggtagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatc < 1:1005463‑M1/151‑89 (MQ=255) gCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatct < 1:597621‑M1/151‑90 (MQ=255) cTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatcta < 2:597805‑M1/151‑91 (MQ=255) tgtgCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaat > 2:349655‑M1/1‑59 (MQ=255) cccccgTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttg > 2:617799‑M1/2‑51 (MQ=255) cGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctcc < 1:228198‑M1/151‑105 (MQ=255) tCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctcccc > 1:928785‑M1/1‑45 (MQ=255) cAATTCATTTGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctcccca > 1:214135‑M1/1‑44 (MQ=255) catttgaGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctt > 2:521438‑M1/3‑39 (MQ=255) catttgaGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctt > 1:678734‑M1/3‑39 (MQ=255) atttgAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGccgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagagcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgcttt > 2:158859‑M1/2‑38 (MQ=255) tGAGTTTTAACCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGtcgacttaacgcgttagctccggaagccacgcctcaagggcacaacctccaagtcgacatcgtttacggcgtggactaccagggtatctaatcctgtttgctccccacgctttcgc < 1:1043863‑M1/151‑117 (MQ=255) | GCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCG > CP000730/2002357‑2002650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |