| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,289,257 | A→C | V78G (GTA→GGA) | ybbP ← | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,289,257 | 0 | A | C | 97.3% | 264.3 / 0.8 | 75 | coding (233/810 nt) | ybbP | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (31/42); minor base . (2/0); total (33/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
TATTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAG > CP000730/2289110‑2289399 | tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:206940/1‑151 (MQ=255)tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc < 1:826113/151‑1 (MQ=255)tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:1052973/1‑151 (MQ=255)tatTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccc > 2:1052968/1‑151 (MQ=255) ttttcacaGCCTTTGAAACCGTTTGAATCACTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 1:387753/147‑1 (MQ=255) ccatgactacaatagAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 2:276497/137‑1 (MQ=255) atTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCcccc < 2:487910/151‑1 (MQ=255) ttGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccccc < 2:950086/151‑1 (MQ=255) cacaTCCTTTGAACCCGATTGAATCTATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACTTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCAt < 2:278050/151‑1 (MQ=255) caGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTg < 1:409189/151‑1 (MQ=255) tGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACg < 2:765349/151‑1 (MQ=255) gAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGa > 2:820739/1‑151 (MQ=255) aaaCCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGat < 1:612144/151‑1 (MQ=255) aCCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGatat > 2:920896/1‑151 (MQ=255) ttGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaat < 2:67443/151‑1 (MQ=255) ttGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaat < 1:548164/151‑1 (MQ=255) gAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaataa > 1:276498/1‑151 (MQ=255) aaTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGaataat > 2:460453/1‑151 (MQ=255) aTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAAtt > 1:997641/1‑151 (MQ=255) aTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAAtt > 1:544231/1‑151 (MQ=255) aaTTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAg > 2:693538/1‑151 (MQ=255) tggctctTCATCTTTACGATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAGAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGGATAACGATATCGAATAATTTAGAt < 2:34641/148‑1 (MQ=255) ctctTCATCCATACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTATTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGtt < 2:179395/151‑1 (MQ=255) ctTCATCTGTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGc < 2:180388/151‑1 (MQ=255) tCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAg < 2:888640/151‑1 (MQ=255) cATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGt > 2:422424/1‑151 (MQ=255) tCTTTTCTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTCAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCa < 1:470097/151‑1 (MQ=255) cTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCaa > 1:440408/1‑151 (MQ=255) tttACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAg < 1:71396/151‑1 (MQ=255) tACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGtt < 1:854686/151‑1 (MQ=255) ccTATACGTATTAGAAGTAAAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGCTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTATAGCTACTCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTc < 2:729275/150‑1 (MQ=255) tataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 1:299370/1‑151 (MQ=255) tataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 1:237467/1‑151 (MQ=255) aataCGTATTAGAAATATAGCGTTTTAAAGAGCTATCTCTACCAAGTTGTTCGAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCAGTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa < 2:1005520/150‑1 (MQ=255) ataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAat < 1:309710/151‑1 (MQ=255) cGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAAT‑CCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCa > 1:37397/1‑151 (MQ=255) cGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAAT‑CCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCa > 1:988204/1‑151 (MQ=255) tATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCAt < 2:946910/151‑1 (MQ=255) tataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctg < 2:275906/151‑1 (MQ=255) ataGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCCGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgt > 1:387474/1‑150 (MQ=255) aGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgctg > 2:345825/1‑151 (MQ=255) aGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATctgctg > 2:940982/1‑151 (MQ=255) cGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAc > 1:224507/1‑151 (MQ=255) gTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAcc > 2:572512/1‑151 (MQ=255) gTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAcc < 2:528164/151‑1 (MQ=255) ttttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCa < 1:79151/151‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCaa < 1:115236/151‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCaa < 2:598583/151‑1 (MQ=255) tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATa < 2:227164/151‑1 (MQ=255) tAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATATGCTGACCAATa > 1:319690/1‑151 (MQ=255) aaaaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATaa > 2:342297/1‑151 (MQ=255) aaaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAAc > 2:279766/1‑151 (MQ=255) aaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACaa < 1:290570/151‑1 (MQ=255) aaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACaa < 2:191611/151‑1 (MQ=255) gCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCGAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAAtt > 2:487435/1‑151 (MQ=255) tACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAatat > 2:724483/1‑151 (MQ=255) ccAAGTGGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATcc < 1:608211/151‑1 (MQ=255) cAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATccc < 2:544231/151‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTa < 1:260990/151‑1 (MQ=255) ngttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTaa > 1:868163/2‑151 (MQ=255) gttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAg < 1:422424/151‑1 (MQ=255) cTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTaa > 2:204238/1‑151 (MQ=255) aCGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTg < 1:71825/151‑1 (MQ=255) cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:940982/151‑1 (MQ=255) cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:345825/151‑1 (MQ=255) cGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt > 1:717804/1‑151 (MQ=255) cACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTAt > 2:129705/1‑151 (MQ=255) gTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGACTAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 2:913348/1‑151 (MQ=255) tAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCttt < 2:237467/151‑1 (MQ=255) ttCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGtt > 2:460081/1‑151 (MQ=255) tCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc > 1:246287/1‑151 (MQ=255) tCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc < 2:276498/151‑1 (MQ=255) cTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTcc < 2:664171/151‑1 (MQ=255) ggAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTaaa < 2:1045728/151‑1 (MQ=255) tACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtg < 1:449033/151‑1 (MQ=255) aCTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGtga < 1:791068/151‑1 (MQ=255) ttAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgag < 1:271401/151‑1 (MQ=255) tAACGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATgaga > 2:575139/1‑151 (MQ=255) aaaGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaa > 1:576940/1‑151 (MQ=255) aaGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGagaag > 2:610144/1‑151 (MQ=255) | TATTGCACAGCCTTTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGTGATGAGAAG > CP000730/2289110‑2289399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |