Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	345080	345089	10	3 [1]	[0] 2	USA300HOU_0309	hypothetical membrane protein

TGCAGCTGTACAAAACCATTATGATTTATTTAATTATTGGTTGATGGGTTCGATTTCAATCATAATTAGCTATTTATTATTAGTAATTGGCGGAATGTTCACGTTATTAAAATTACCTAAAGTAACAAAACGTTGGGGTGGTAAAACTAAAACACATTTC  >  CP000730/344929‑345088                                                                                                                                                       |          tGCAGCTGTACAAAACCATTATGATTTATTTAATTATTGGTTGATGGGTTCGATTTCAATCATAATTAGCTATTTATTATTAGTAATTGGCGGAATGTTCACGTTATTAAAATTACCTAAAGTAACAAAACGTTGGGGTGGtaaaactaaa           >  2:146841/1‑151 (MQ=255) tGCAGCTGTACAAAACCATTATGATTTATTTAATTATTGGTTGATGGGTTCGATTTCAATCATAATTAGCTATTTATTATTAGTAATTGGCGGAATGTTCACGTTATTAAAATTACCTAAAGTAACAAAACGTTGGGGTGGtaaaactaaa           >  2:146857/1‑151 (MQ=255)          aCAAAACCATTATGATTTATTTAATTATTGGTTGATGGGTTCGATTTCAATCATAATTAGCTATTTATTATTAGTAATTGGCGGAATGTTCACGTTATTAAAATTACCTAAAGTAACAAAACGTTGGGGTGGTAAAACTAAAACACATTTc  <  1:325173/151‑1 (MQ=255)                                                                                                                                                       |          TGCAGCTGTACAAAACCATTATGATTTATTTAATTATTGGTTGATGGGTTCGATTTCAATCATAATTAGCTATTTATTATTAGTAATTGGCGGAATGTTCACGTTATTAAAATTACCTAAAGTAACAAAACGTTGGGGTGGTAAAACTAAAACACATTTC  >  CP000730/344929‑345088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑