Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	1654327	1654411	85	2 [1]	[0] 3	USA300HOU_1541	possible competence protein ComGF

GATACGGTGTTGCCTAATTTCAATATCGTTTCTATCTACTCCTTTAAAATCATCTAGAATATCTCTTGAGAAAAATTCGAAATCTACAGTTGTTAAATCCCTACTTTCAATTAGAAAAGTTTTACTAAGTCTAATTAAGTCTGGAACAATT  >  CP000730/1654412‑1654562 |                                                                                                                                                       gATACGGTGTTGCCTAATTTCAATATCGTTTCTATCTACTCCTTTAAAATCATCTAGAATATCTCTTGAGAAAAATTCGAAATCTACAGTTGTTAAATCCCTACTTTCAATTAGAAAAGTTTTACTAAGTCTAATTaattaagtctggaac  >  2:60362/1‑138 (MQ=255) gATACGGTGTTGCCTAATTTCAATATCGTTTCTATCTACTCCTTTAAAATCATCTAGAATATCTCTTGAGAAAAATTCGAAATCTACAGTTGTTAAATCCCTACTTTCAATTAGAAAAGTTTTACTAAGTCTAATTAAGTCTGGAACAAtt  >  2:257761/1‑151 (MQ=255) gATACGGTGTTGCCTAATTTCAATATCGTTTCTATCTACTCCTTTAAAATCATCTAGAATATCTCTTGAGAAAAATTCGAAATCTACAGTTGTTAAATCCCTACTTTCAATTAGAAAAGTTTTACTAAGTCTAATTAAGTCTGGAACAAtt  >  2:268515/1‑151 (MQ=255) |                                                                                                                                                       GATACGGTGTTGCCTAATTTCAATATCGTTTCTATCTACTCCTTTAAAATCATCTAGAATATCTCTTGAGAAAAATTCGAAATCTACAGTTGTTAAATCCCTACTTTCAATTAGAAAAGTTTTACTAAGTCTAATTAAGTCTGGAACAATT  >  CP000730/1654412‑1654562

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑