BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	92 (1.430)	50 (1.200) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC	35/168	NT	49.4%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	2176447 =	66 (1.020)	50 (1.200) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC	35/168	NT	49.4%	noncoding (114/114 nt)	rrf5	5S ribosomal RNA

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GGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTA  >  CP000730/512482‑512758

ggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGGTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaa                                                                                                                                           <  2:241667/140‑1 (MQ=255)

   acctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttcagctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaacaataaaatggacgagataaaaata                                                                                                                                        <  2:469996‑M1/5‑3 (MQ=255)

   acctgttcacatgacgaacacagaagttaagctccttagcgtcgttggtagtcgaacttacgtgccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaaggtaaaaaaa                                                                                                                                        <  2:255850‑M1/5‑1 (MQ=255)

     tcggTACAGATGACAAAGGTGTAATTATTACGGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCCAACAAAACAACTCAACTTAGGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTGTAAAAAGt                                                                                                                                      >  2:202809/4‑140 (MQ=255)

       gttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTa                                                                                                                                    <  1:661819‑M1/9‑1 (MQ=255)

       aGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTCAAGCAGCCTCAAAGCCTGCATCGTCATCATTCGTCGAGACAAACTAACTAAATTAACTTAACAAAAAAAATGATAGACTAACGAAAATAAATTTTAAAAAGTTa                                                                                                                                    >  2:65144/1‑140 (MQ=255)

        ttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaataaaattctggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAt                                                                                                                                   >  2:695306‑M1/131‑140 (MQ=255)

        ttcccatgcccaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAt                                                                                                                                   >  1:264132‑M1/131‑140 (MQ=255)

         tcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttaagttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAtt                                                                                                                                  >  1:362494‑M1/130‑140 (MQ=255)

         tACAGGTGATAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAtt                                                                                                                                  <  2:426826/140‑1 (MQ=255)

         tACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAtt                                                                                                                                  >  1:356145/1‑140 (MQ=255)

            aGATGACAAAAGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                               <  2:259695/140‑1 (MQ=255)

             gATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAACAACTTGAATTACTAACGACAATTACTTTTCAAAAGTTATTGACt                                                                                                                              <  1:417219/140‑1 (MQ=255)

                gACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTaa                                                                                                                           <  1:119101/140‑1 (MQ=255)

                 cgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagcacgttgccaggcagtttttgaaacaaattttgggtaaaaaatgaaatggacaaaaaaaAAAAAGTTATTGACTTaaa                                                                                                                          <  2:26733‑M1/19‑1 (MQ=255)

                   aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                        >  2:354732/1‑140 (MQ=255)

                   aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                        >  2:424729/1‑140 (MQ=255)

                     aGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                      >  2:280441/1‑140 (MQ=255)

                      ccagaagttaagcgccataacgtcgatggtagtccaacttacgatccactacaacagaacattgccaggcagttttttaatcaaattttgtttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATgttg                                                                                                                     >  2:584655‑M1/117‑139 (MQ=255)

                       cagaagttaagcttcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAtgttga                                                                                                                    >  1:529524‑M1/116‑138 (MQ=255)

                          aagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTCTTGACTTAAATGTtgataa                                                                                                                 >  1:567115‑M1/113‑140 (MQ=255)

                            gttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaGAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATaaaa                                                                                                               <  1:291868‑M1/30‑1 (MQ=255)

                              ttttACTGTTGTTAAGTAGTTTGAAAGCTTGTATTGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAAGTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg                                                                                                             <  1:290409/140‑1 (MQ=255)

                                 tcatgttgtTAAGCAGTTTTAAATCCTGAATAGTATTTATATGTTGAGGCAAACAAAACACCTCAACTTAAGAAATATCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATTTTAATAAAATGtat                                                                                                          <  2:727763/137‑1 (MQ=255)

                                 gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtat                                                                                                          <  1:494421‑M1/35‑1 (MQ=255)

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                                   cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTAAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTAAATTAAATGTTAATAAAATGTAtaa                                                                                                        >  1:61919/1‑140 (MQ=255)

                                   cTGTTGTTAAGCAGCTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAACCAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAATTAAATGTTAATAAAATGTAtaa                                                                                                        >  1:398081/1‑140 (MQ=255)

                                     cttagcgtcgatggtagtagaacttacgttccgctagagtagaacgttgctaggtagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatt                                                                                                      >  1:353852‑M1/102‑140 (MQ=255)

                                       tagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                    >  1:701107‑M1/100‑140 (MQ=255)

                                        gttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaat                                                                                                   >  1:688046/1‑140 (MQ=255)

                                        gttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaat                                                                                                   >  2:438434/1‑140 (MQ=255)

                                        gttAAGAAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaat                                                                                                   <  1:56046/140‑1 (MQ=255)

                                        agcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                   <  2:119277‑M1/42‑1 (MQ=255)

                                           gtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgctaggtagtttttttatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                >  1:659254‑M1/96‑140 (MQ=255)

                                           gtcgagtgtagctgaaattacgttccggtaaagtataacgttgccaggcagttttttaatcaaattttgtttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                >  2:21048‑M1/96‑140 (MQ=255)

                                           aaGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                <  1:233988/140‑1 (MQ=255)

                                             gCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGAATTAAATGTTAATAAAATGTATAGTTAATTCTTg                                                                                              >  1:15392/1‑140 (MQ=255)

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                                                gTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTACATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg                                                                                           >  1:211469/1‑140 (MQ=255)

                                                 ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCttgtagg                                                                                          <  2:705202‑M1/51‑4 (MQ=255)

                                                  gtagtcgaacttacgtcccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaaataaagaaaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTGATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                         >  2:404359‑M1/89‑140 (MQ=255)

                                                    agtcgaacttacgttcggctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagttaaAAAAAGTTATTGAGTTAAATGTTGTTAAAATGTATAATTACTTATGGTGGGtat                                                                                       <  2:724588‑M1/54‑2 (MQ=255)

                                                     gtcgaatttacgttccgctagagtagaacgtttcctggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggataagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAGGTTGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                      >  1:366321‑M1/86‑140 (MQ=255)

                                                     gtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                      >  1:622954‑M1/86‑140 (MQ=255)

                                                     aaaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                      >  2:243896/1‑140 (MQ=255)

                                                       aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                    >  2:19604/1‑140 (MQ=255)

                                                       aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                    >  1:745902/1‑140 (MQ=255)

                                                       aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                    >  2:24880/1‑140 (MQ=255)

                                                              acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                             <  1:82675‑M1/64‑1 (MQ=255)

                                                              acgttccgctagagtagaacgttgacaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaattgacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCGTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                             >  1:376355‑M1/77‑140 (MQ=255)

                                                                       tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa                                                                    >  1:541856‑M1/68‑140 (MQ=255)

                                                                         ttctggAGGCAAACAAAACAACTTAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGGCTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                  <  2:459665/135‑1 (MQ=255)

                                                                         gagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTCTCGGtaagaaaaacgaaactcgaaactc                                                                  <  2:330990‑M1/75‑12 (MQ=255)

                                                                          tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAGCATTGAAAACTg                                                                 >  2:546873/1‑140 (MQ=255)

                                                                          tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGATAAGAAAAAGAAACATTAAAAACTg                                                                 >  1:475041/1‑140 (MQ=255)

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                                                                           gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAGTGAACATTGAAAACTGa                                                                >  2:440349/1‑140 (MQ=255)

                                                                           gtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa                                                                <  2:742014‑M1/77‑1 (MQ=255)

                                                                            tagagatatgacaggcagttttttcatcaagtttttattaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGTAAACTGaa                                                               >  2:89175‑M1/63‑140 (MQ=255)

                                                                              gaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATAAACATtgaaaacacaatg                                                             <  2:701909‑M1/80‑7 (MQ=255)

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                                                                                ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATACTTGTAGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc                                                           >  1:199870/1‑140 (MQ=255)

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                                                                                      ccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                     <  1:512057‑M1/88‑1 (MQ=255)

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                                                                                                      tcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATTTCAACGTTAATTCCaa                                     >  1:453149‑M1/37‑140 (MQ=255)

                                                                                                      tcaaatttgggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                     >  2:515337‑M1/37‑140 (MQ=255)

                                                                                                       caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAAATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCaaaa                                    <  2:609162‑M1/105‑1 (MQ=255)

                                                                                                        gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCcaaa                                   >  2:680330/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                         aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                  >  2:4487‑M1/34‑140 (MQ=255)

                                                                                                            tttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACg                               >  2:743728‑M1/31‑140 (MQ=255)

                                                                                                              tggtgaaaaaataaaatggacaaaataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                             >  2:182440‑M1/29‑140 (MQ=255)

                                                                                                              tggataaaaaaaaaaatggacaaaataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                             >  2:139547‑M1/29‑140 (MQ=255)

                                                                                                              aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                             >  1:408630/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                               ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTAAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                            <  1:729813‑M1/113‑1 (MQ=255)

                                                                                                               ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATAGAAAACTGAATGACAATATGTAAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                            <  1:102027‑M1/113‑1 (MQ=255)

                                                                                                                ttGAATTAGTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTATTAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAGGAACATTGAAAACTGAATGACAACATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                           >  2:560647/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                ttGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                           <  2:618073/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 tGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACt                          >  1:27277/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                     ttACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATATCAAAGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATaa                      >  1:617469/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                         tAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATCGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAACGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa                  <  1:429470/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                           aaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAA‑CGTAACTATAAGTTACaa               <  2:537892‑M1/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             atggacaagataaAAAAAGTGATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTAAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa              <  2:605832‑M1/127‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             agggacaagataaAAAAAGTTCGTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGATAATATGTCAACGTTAATTCCAAACAACGTTACTATAAGTTACaaa              >  2:128272‑M1/14‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                aattaattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACat           <  2:677497/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                   taattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattat        <  2:745902/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                    aattTTAAAGAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt       <  2:419337/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                    aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt       >  1:222167/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                    aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt       >  2:299704/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                    aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAATGGGTGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt       >  1:174253/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                     gataaAAAAAGTTATTGTCTTAAATGTTGAGAAAATGTATAATTAATTTTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAATAAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAttt      >  2:399913‑M1/6‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                     attTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAAAAACATTAttt      >  2:49102/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                         aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTa  >  1:112432‑M1/2‑140 (MQ=255)

GGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTA  >  CP000730/512482‑512758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.