| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 665,392 | T→G | 100% | L79* (TTA→TGA) | iolS → | possible acetytransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 665,392 | 0 | T | G | 100.0% | 220.0 / NA | 67 | L79* (TTA→TGA) | iolS | possible acetytransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (37/30); total (37/30) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
ACAACAGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATGAAGA > CP000730/665256‑665527 | acaacaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAGTgata > 2:213994/1‑140 (MQ=255) caacaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTCTATTTACGGTGAAGAATGatat > 1:707177/1‑140 (MQ=255) aacaGTTGATCACTTGTTAGAAGCATCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATAtt > 1:483595/1‑140 (MQ=255) aacaGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATAtt > 1:51891/1‑140 (MQ=255) gTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATc > 2:679691/1‑140 (MQ=255) aaTCAATTGTTAGAATCTTCATAGAACGAACAGCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACCATTATTCTTAGTTGTTGAATAAGGTAATTACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGc < 2:401701/140‑1 (MQ=255) cACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAAAAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCGTTGCTAACTTTATTTACGAGGAAGAATGATATTTATCAGGTCa > 2:239399/1‑140 (MQ=255) ttGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACAGCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTa < 1:344796/140‑1 (MQ=255) tAGAAGCTTCATATAATGAAGATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTGACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCCCATTCTGtt > 1:534060/1‑140 (MQ=255) gAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTaa < 1:679691/140‑1 (MQ=255) aaGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTaaa > 2:641447/1‑140 (MQ=255) aaGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTaaa > 1:760759/1‑140 (MQ=255) aaGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAAGTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTaaa > 2:490859/1‑140 (MQ=255) aaGCTTCATATAATAAACATCATTTAAAGAAACGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGATGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTCGCTAACTTGATTTAGGGTGAAGACTGCTATTAATCGACTCATCATGTTagc > 2:517979/1‑138 (MQ=255) agcatactataATGATAATCATTTAAAGAAAAAACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAAc < 1:131875/133‑1 (MQ=255) aGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAAc < 1:574041/140‑1 (MQ=255) ttCATATAATGAATATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAg < 1:378796/140‑1 (MQ=255) cATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTCTGTTAAACCAGaa > 2:477751/1‑140 (MQ=255) tataATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATc > 1:425917/1‑140 (MQ=255) tataATGAACATCACTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAGTGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATc > 1:420919/1‑140 (MQ=255) ataATGCACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATCCTTAGTCGTTGCAGAAGGTCATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAACAATGATATTTATCAGCCCATTATCTTCAACCAGAATcc > 2:419646/1‑139 (MQ=255) ataATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTGTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCg > 2:419773/1‑140 (MQ=255) taATGAACATCATTTAAATAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCCTAGTCGGTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGc < 1:154937/140‑1 (MQ=255) aaCATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGCTATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACAt > 1:537934/1‑140 (MQ=255) tcatTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAg < 2:30015/140‑1 (MQ=255) catTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAgg > 2:454447/1‑140 (MQ=255) catTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAgg < 1:505375/140‑1 (MQ=255) catTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAgg < 1:729272/140‑1 (MQ=255) catTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAAGGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAgg < 1:572715/140‑1 (MQ=255) atTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGt < 1:138557/140‑1 (MQ=255) ttAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTa > 1:370533/1‑140 (MQ=255) agaCTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGc < 2:505956/140‑1 (MQ=255) ttCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTg < 1:699617/140‑1 (MQ=255) tCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTTAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTGATGGTACAGCATTGt < 1:566734/140‑1 (MQ=255) tCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGt < 2:384790/140‑1 (MQ=255) cAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGATAAACCAGAATAGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGtt > 1:99367/1‑140 (MQ=255) acgcaccattattCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGCCATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTa < 2:578691/133‑1 (MQ=255) aaGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGGAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCGCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTa < 1:97542/140‑1 (MQ=255) gAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTGACTTTGTTTACGGTGACGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCANCATATAGGTGATGGTANAGCATTGTTaca > 1:220913/1‑138 (MQ=255) atccTTAGTCGTTTAAGAAGGTAATGACATCGTTGACTTTGCTAACTTTATTTACAGTGAAGAATGATATATAACAGCTCATTATGTTAAACAAGACTCTCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAgaat < 1:25614/137‑4 (MQ=255) ttAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATc < 2:47851/140‑1 (MQ=255) tAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCa < 1:7555/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAAGCAGAGTCGCAATATGCAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACg > 2:568827/1‑140 (MQ=255) tCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGt > 1:278940/1‑140 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGCATGAAAATTACAAGCTCATAATGTTAAACCAGAAACAGAAAATCACGGTTATGGTACAGCATAGGTAACTGCAGGAtacaaacggtt > 2:21431/1‑130 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGttt > 1:278270/1‑140 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGttt > 1:217963/1‑140 (MQ=255) aagaagGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTCGaa > 2:504946/1‑140 (MQ=255) gaagGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGa < 1:610237/140‑1 (MQ=255) gaagGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGGGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGa > 1:520835/1‑140 (MQ=255) aaTGACATCGTTTGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAAtt < 2:201052/140‑1 (MQ=255) aCATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATCTTTATCAGCTTATTCTGTTTAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTCAATGAAGGATTATAACGTTTTGAAGATAAACTTGac > 2:193590/1‑139 (MQ=255) aCATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGaa > 1:340943/1‑140 (MQ=255) aTCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAgg < 2:608742/140‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGtt < 2:51891/140‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAAAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGtt < 2:483595/140‑1 (MQ=255) tGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGttt < 2:278940/140‑1 (MQ=255) tGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATAACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGttt > 1:158624/1‑140 (MQ=255) tGGCTTTACTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGttt > 1:685135/1‑140 (MQ=255) tGGCTTTACTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTAAAGCAATGGTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGgtt > 1:329013/1‑140 (MQ=255) ttttGCTAACTTTATTTACGGTGAATAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACt < 1:267285/139‑1 (MQ=255) tttGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTTTGGTACAGCATTGTTAAATGAAGAATTACCACAGTTTGACGACAAACTTGAAGGGGTTTACtt > 2:216452/1‑140 (MQ=255) gCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGATTTGACGATAAATTTGAAGGGGCTTACtgaaa > 2:146667/1‑136 (MQ=255) aaCTTTATTTACGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGt < 1:176784/140‑1 (MQ=255) ttatataCGTTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATTCAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGat < 2:221717/140‑1 (MQ=255) cGGTGAAGAATGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATAGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGATAAATGAAGGATTTGCATTTTTTTATGATTAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATagaa > 2:535403/1‑140 (MQ=255) aagaaTGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATgaa > 1:363578/1‑140 (MQ=255) gaaTGATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAACgaaga > 1:705529/1‑140 (MQ=255) | ACAACAGTTAATCACTTGTTAGAAGCTTCATATAATGAACATCATTTAAAGAAAAGACTTCAAGAACAATTATTCTTAGTCGTTGAAGAAGGTAATGACATCGTTGGCTTTGCTAACTTTATTTACGGTGAAGAATTATATTTATCAGCTCATTATGTTAAACCAGAATCGCAACATACAGGTTATGGTACAGCATTGTTAAATGAAGGATTATCACGTTTTGAAGATAAATTTGAAGGTGTTTACTTAGAAGTAGATAATAAAAATGAAGA > CP000730/665256‑665527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |