| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 874,718 | A→C | 100% | K541N (AAA→AAC) | clfA → | fibrinogen‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 874,718 | 0 | A | C | 100.0% | 242.5 / NA | 77 | K541N (AAA→AAC) | clfA | fibrinogen‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (55/22); total (55/22) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
ATCCGAATAGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAAACCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTCTA > CP000730/874582‑874851 | aTCCGAATAGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCa < 2:556177/140‑1 (MQ=255) ccGAATAGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTACCGATAACCAAgt > 2:281307/1‑140 (MQ=255) aaTAGCAAATGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTATATATGGGTATAGCCCAAAAACAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAgttgt < 1:358157/140‑1 (MQ=255) aGCAAAGGTGATTTCGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTCTCACTCGTATATAATTTGGCGCTATATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATGTAATCACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATCACCCAgttgttgc > 1:3260/1‑138 (MQ=255) aGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGTTAACCCAGTTGTTcc > 2:27441/1‑140 (MQ=255) aGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATGACCCAGTTGTTcc > 2:27326/1‑140 (MQ=255) aGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTcc > 2:643064/1‑140 (MQ=255) gCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCt > 2:152569/1‑140 (MQ=255) aaaGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGa > 1:631907/1‑140 (MQ=255) aaGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCAAAAACCAAGTTGTTCCTaaa > 1:319519/1‑140 (MQ=255) aaGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGATGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGaa > 1:225036/1‑140 (MQ=255) cTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGTATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAg < 2:424233/140‑1 (MQ=255) cTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAg < 2:586920/140‑1 (MQ=255) ttACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGc‑c > 2:354967/1‑140 (MQ=255) tCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGa > 2:108915/1‑140 (MQ=255) cagcTTTAAATTGGTATAATGCGATTATTATTTGACGCTCTATGTCAGGGGTCAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTGGTTCCTGACAAACCTGATGAGC‑CTGGTGaa > 2:256764/4‑140 (MQ=255) cAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGaa > 1:272626/1‑140 (MQ=255) cAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGaa > 2:700301/1‑140 (MQ=255) aaCTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTGTCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGaaa > 2:226490/1‑140 (MQ=255) ttaagtGGCTATAACCCGAATATAAGTTGGCGCGCTATGGCCTGGGGCAACGAAGTAGCATTAAATAACGGATCAGGTACTCCTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGa < 2:199710/135‑1 (MQ=255) ttATATGGGTATAACTGGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGa < 2:233741/140‑1 (MQ=255) tataTGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGaa > 2:472561/1‑140 (MQ=255) atatGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATGGAAc > 1:198979/1‑140 (MQ=255) atatGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGAATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAAc > 1:636603/1‑140 (MQ=255) atatGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTAATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGCTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAAc > 1:422849/1‑140 (MQ=255) atatGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTAAAAGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAAc > 1:333951/1‑140 (MQ=255) tatGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAAcc < 1:500434/140‑1 (MQ=255) atGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAAcaa > 1:272113/1‑138 (MQ=255) taACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCag > 2:412946/1‑140 (MQ=255) aCTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCagag > 2:313425/1‑140 (MQ=255) aCTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCagag > 1:718696/1‑140 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATTAGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGa < 1:746059/140‑1 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGa > 1:573816/1‑140 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTAGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACTAATTCCAGGGGa > 1:68981/1‑140 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGAACAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGGTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCCGAGGa > 2:663693/1‑140 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGAAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGAATCGATAACCCAGTTGTTACTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATAGCAGAGGa > 2:380332/1‑140 (MQ=255) tCGAATATAATTTGGCGCTCTATGCCATCCAGCGACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGATC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGa > 1:367207/1‑140 (MQ=255) cGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAACTTGAACCAATTCCAGAggct > 2:118265/1‑138 (MQ=255) cGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGA‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGAt > 1:721500/1‑140 (MQ=255) gAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATTACGAATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTATTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTGCACAGGAtt > 1:294636/1‑140 (MQ=255) tataATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGCATTCAg > 2:184129/1‑140 (MQ=255) ataATTTGGCGCTCTATGTCATGGGATAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGa < 1:123085/140‑1 (MQ=255) ataATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGa > 2:452702/1‑140 (MQ=255) gcTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGACCCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGGcccg > 2:716469/1‑139 (MQ=255) tATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGtt > 2:590171/1‑140 (MQ=255) gACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACTCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTgg < 1:37360/140‑1 (MQ=255) gACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTgg > 2:477994/1‑140 (MQ=255) gACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATACTGACCCAGGTTCAGATTCTgg > 1:667445/1‑140 (MQ=255) gACAACAAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTgg > 2:477915/1‑140 (MQ=255) aCAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGc > 2:282495/1‑140 (MQ=255) cAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATCCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCa > 2:114808/1‑140 (MQ=255) aaCGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCGAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAg > 1:98942/1‑140 (MQ=255) aCGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGTCAACCGCTAG‑CAACTTGAACCAATACCAAAGGATTAAGATACTGACCCAGAATAAAATTCTGGAAGc > 1:361712/1‑140 (MQ=255) aaGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGATGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAAATGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGAt < 1:72819/140‑1 (MQ=255) aaGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGAt > 2:752112/1‑140 (MQ=255) aGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGCTTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATCCTGGCAGCGGtt > 1:224496/1‑140 (MQ=255) gCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCAAGAGGAATCAGATTCTGACCGAGGTTCAGATTCTGGCAACGATTCTaa > 1:108058/1‑140 (MQ=255) aataaCGGTTCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGa < 1:119826/140‑1 (MQ=255) aataaCGGATCAGGTTCTGGTGACGTTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGa < 1:335156/140‑1 (MQ=255) aataaCGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGa > 1:430382/1‑140 (MQ=255) aataaCGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGa < 2:31303/140‑1 (MQ=255) aaCGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCATATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAg > 2:730018/1‑140 (MQ=255) aaCGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACGCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAg < 1:354967/140‑1 (MQ=255) cGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCACTTCCAGAGGATTCAGATTCTGCCACAGGTCCAGCTCCTGGCAGCGATTCTAATTCAGACAGct < 2:636603/140‑2 (MQ=255) ggATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGGTTGCgg < 2:658825/140‑1 (MQ=255) aTCAGGTTGTGGTGACGGTATCGATAACCCGGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCGGATAGCGGtt < 2:514339/140‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGtt < 1:90914/140‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCAAGGTTCAGATTCTGGAAGCGATTCTAATTCAGATGGCGGTTCa > 1:603125/1‑140 (MQ=255) ggTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATCGAGATGCTGACCCAGGTTGAGATTCTGGCAGCGATCCTAATCCATAGAGGGGCTCAGa > 2:248689/1‑140 (MQ=255) gTTCTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTCACCCAGGTTCAGATTCTGGCCGCGATTCTAATTTAGATAGCGTTTTAGAt > 1:730529/1‑140 (MQ=255) cTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCg > 2:334793/1‑140 (MQ=255) cTGGTGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCg > 1:373178/1‑140 (MQ=255) tGACGGTATCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCgggga > 2:18617/1‑138 (MQ=255) aTCGATAACCCAGTTGTTACTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGAGAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTc < 1:663693/140‑1 (MQ=255) tCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTCt < 2:647336/140‑1 (MQ=255) tCGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATCCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTCt < 1:716469/140‑1 (MQ=255) cGATAACCCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATACCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTACAGAATCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTCTa > 1:606782/1‑140 (MQ=255) | ATCCGAATAGCAAAGGTGATTTAGCTTTACGTTCAACTTTATATGGGTATAACTCGAATATAATTTGGCGCTCTATGTCATGGGACAACGAAGTAGCATTTAATAACGGATCAGGTTCTGGTGACGGTATCGATAAACCAGTTGTTCCTGAACAACCTGATGAGC‑CTGGTGAAATTGAACCAATTCCAGAGGATTCAGATTCTGACCCAGGTTCAGATTCTGGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGATTCTA > CP000730/874582‑874851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |