BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	60 (0.860)	47 (1.040) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC	28/170	NT	55.0%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	2176447 =	58 (0.830)	47 (1.040) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAAAAAAC	28/170	NT	55.0%	noncoding (114/114 nt)	rrf5	5S ribosomal RNA

Only 100 of 152 total aligned reads displayed.

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccactagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                             <  2:457127‑M1/1‑1 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttacagaataaaatggacaagataaaa                                                                                                                                            <  2:423302‑M1/2‑1 (MQ=255)

  ggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATCTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaa                                                                                                                                           <  1:278364/141‑1 (MQ=255)

  cacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcagattttggttaaaaaataaaatggacaagagaaaaa                                                                                                                                           <  1:155253‑M1/3‑1 (MQ=255)

   acacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                          <  1:325959‑M1/4‑1 (MQ=255)

    ggTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  2:368819/140‑1 (MQ=255)

    ggTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  2:80238/140‑1 (MQ=255)

    ctgtCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  2:61586/138‑1 (MQ=255)

    cGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCACCTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAACTTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         >  2:377888/1‑141 (MQ=255)

    cGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         >  1:154297/1‑141 (MQ=255)

         aggaCAGATGACTATTGTTTAATTTTTAATGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGACTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt                                                                                                                                    <  1:125911/138‑1 (MQ=255)

         aGTACAGATGACAAAGGTGTTATTTTTACTTTTGTTTAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt                                                                                                                                    <  1:52755/141‑1 (MQ=255)

         aGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTAAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAt                                                                                                                                    <  1:13149/141‑1 (MQ=255)

            cccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 >  2:7052‑M1/129‑141 (MQ=255)

            cccaagccgaacacagaagttaagctccttagcgacgatggtagtcaaacttacggtccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaaatttggctaaaaaataaaatggacaagagaaAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 <  1:570035‑M1/13‑1 (MQ=255)

            ataGATGACGAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCACCTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 <  2:571309/139‑1 (MQ=255)

            aCAGATTACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAAATCTTCGAATCTTTTTAATTCATAACTTGGCTTACTAACGAAAATTACTTTTAAAAATTTATTGa                                                                                                                                 <  2:570784/141‑1 (MQ=255)

               atgccgatcacagaatttaagatccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACtt                                                                                                                              >  1:461978‑M1/126‑141 (MQ=255)

                tgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTa                                                                                                                             <  1:742166‑M1/17‑1 (MQ=255)

                   cgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAt                                                                                                                          >  1:101416‑M1/122‑141 (MQ=255)

                    gaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                         >  1:120094‑M1/121‑141 (MQ=255)

                     aacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        <  2:12985‑M1/22‑1 (MQ=255)

                     aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAATTTAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        <  1:189384/141‑1 (MQ=255)

                      atggTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  2:253940/139‑1 (MQ=255)

                      aaGGTGTAATTTTTATTGTTGTTAAGCATTTTAAAAGCCTTTATAGTAGTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACGCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTCACTTTAAAAAGTTATTGACTTTACTGta                                                                                                                       <  2:337825/141‑2 (MQ=255)

                           ttAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTATGAAAGCCTGTATAGTATTTATATGTTGAGGCAAAAAAAACAACTCAACGTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa                                                                                                                  <  2:606856/140‑1 (MQ=255)

                                ttttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGt                                                                                                             >  2:96765/1‑141 (MQ=255)

                                  agctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtat                                                                                                           <  2:399062‑M1/35‑1 (MQ=255)

                                   gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtata                                                                                                          <  1:132952‑M1/36‑1 (MQ=255)

                                   gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctacagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGATGATAAAATGtata                                                                                                          <  1:577433‑M1/36‑1 (MQ=255)

                                    ctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaa                                                                                                         <  1:66309‑M1/37‑1 (MQ=255)

                                      ccttagcgtcgatgggagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatt                                                                                                       >  1:713948‑M1/103‑141 (MQ=255)

                                       cttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATgtataagta                                                                                                      <  1:89208‑M1/40‑4 (MQ=255)

                                             gtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATAAATCCtt                                                                                                <  2:769101‑M1/46‑1 (MQ=255)

                                             gtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGAAAAAATGTATAATTAATTCtt                                                                                                <  2:333496‑M1/46‑1 (MQ=255)

                                               cgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccacgcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggcaaagctaaAAACAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAAANGATAATTAATtctttt                                                                                              <  1:658220‑M1/48‑3 (MQ=255)

                                                 aGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAACAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg                                                                                            >  1:280101/1‑141 (MQ=255)

                                                   tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  2:411235/141‑1 (MQ=255)

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                                                   tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:716807/141‑1 (MQ=255)

                                                   tttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:128481/141‑1 (MQ=255)

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                                                   ttcgtaaGCCTTTATCGTATTTTTTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTTAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  2:760147/136‑1 (MQ=255)

                                                   ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:195168‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                   ggtagtataacttacgttacgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          >  2:283771‑M1/90‑141 (MQ=255)

                                                    gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         <  2:155771‑M1/53‑1 (MQ=255)

                                                     tgggcgaacatacgttgagctatacgagaacgtagccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGATATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        >  2:506498‑M1/88‑141 (MQ=255)

                                                     tagtcgaacgtacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        >  1:226205‑M1/88‑141 (MQ=255)

                                                     gagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        >  1:609686‑M1/88‑141 (MQ=255)

                                                      gAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTACGGAGAAACGTGAATTCCTAACGAACATTAATTTTAATAAGTTATGTCCTGAAGGGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGTTagg                                                                                       >  1:469663/1‑139 (MQ=255)

                                                      agtcgaacttactttctgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       >  1:231814‑M1/87‑141 (MQ=255)

                                                      agtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcccctgttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       >  1:384981‑M1/87‑141 (MQ=255)

                                                       aaaGCCTGTATAGTATTTATTTCTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                      <  2:674544/141‑1 (MQ=255)

                                                       aaaGCCTGTAGAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                      <  1:145912/141‑1 (MQ=255)

                                                         aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTACCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATCCTTGTCGGTAAGaaa                                                                                    >  1:738397/1‑141 (MQ=255)

                                                           aacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaaaa                                                                                  >  1:450128‑M1/82‑141 (MQ=255)

                                                                           gagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggtaaaaaaataaaatggaaacgataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATGATTAATTATTGTCAGTAAGAAAAATCAACATTAACAACTg                                                                  <  2:324064‑M1/76‑1 (MQ=255)

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                                                                             gtagaatctgtccaggcagttttttagtcaaatcttagtcaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATCTATAATTAACTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAActgca                                                                >  2:650677‑M1/64‑139 (MQ=255)

                                                                             gtagaacattgccaggcagttttttaatcaaatttttgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa                                                                >  2:228241‑M1/64‑141 (MQ=255)

                                                                               tgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg                                                              >  2:751985/1‑141 (MQ=255)

                                                                                gaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGa                                                             <  1:552990‑M1/81‑1 (MQ=255)

                                                                                 aGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTCATTTTAAAAAGATATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTAGGTAAGAAAACACAACATTGaaacatgcaccac                                                            >  2:725643/1‑131 (MQ=255)

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                                                                                    gttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagagaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTTATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         >  1:269052‑M1/57‑141 (MQ=255)

                                                                                       gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                      <  2:712315‑M1/88‑1 (MQ=255)

                                                                                         aaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTc                                                    >  2:75586/1‑141 (MQ=255)

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                                                                                            acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc                                                 <  2:656978/141‑1 (MQ=255)

                                                                                              aactcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt                                               >  1:146191/1‑141 (MQ=255)

                                                                                               gttttttaatcatattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                              >  1:613854‑M1/46‑141 (MQ=255)

                                                                                               gttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt                                              >  1:325244‑M1/46‑141 (MQ=255)

                                                                                                     taatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                        >  2:634022‑M1/40‑141 (MQ=255)

                                                                                                     ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                        <  1:625060/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                           aattttggttaaacaataaaatggacacgataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                  <  2:30727‑M1/108‑1 (MQ=255)

                                                                                                                aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                             >  1:509044/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                            <  2:647223‑M1/114‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                            >  2:109332‑M1/28‑141 (MQ=255)

                                                                                                                  ttGAATTACAAACAAAAAAAAATTATAAAAAAGTAGTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTAAAAAAAAAAAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACt                           <  2:155435/141‑1 (MQ=18)

                                                                                                                   tGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGACTGACAATATGTCAACCGTAATTCCAAAAAACATAACta                          >  2:679801/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                    gAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTAGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAGGTTAATTCAAAAAAAAGTAACtaa                         >  2:103845/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                     aaTTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                        <  2:636945/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        aaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     >  1:647967‑M1/21‑141 (MQ=255)

                                                                                                                        aaataaaatggaaaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     >  1:47510‑M1/21‑141 (MQ=255)

                                                                                                                          cTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAGGAGAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTACACGTTAATTCCAAAAAACGTACCtgaacgtta                   >  2:101600/1‑133 (MQ=37)

                                                                                                                             aaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa                <  2:511326‑M1/126‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             aaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACGATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGtaattataaagaacaa                <  2:221125‑M1/126‑8 (MQ=255)

                                                                                                                             aCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa                >  2:342691/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                              cGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               <  1:408716/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                              cGAAAATTAATTTGAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               <  1:35349/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                              agAAAATTAATGTTAATAAGTTAGTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATTATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               <  1:115010/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                               gAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaaa              >  1:528218/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             <  1:755886‑M1/129‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                 ggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAAGATGTCAGCGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACat            <  1:105689‑M1/130‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                   attaattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAAGTTAATTACAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta          <  1:49001/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        ttttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     <  1:341030/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        ataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAAAATTTAGCAACGTTAATTCCAAAAAACGTGACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     <  1:585093‑M1/137‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        agaaAAAAAGGTATGGAGTGAAAGGTGGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAGTGCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAGATGATTTAg     >  2:658220‑M1/5‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                         tttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAGTGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGt    >  1:466414/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                           aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt  <  2:399946‑M1/140‑1 (MQ=255)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.