| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 195,286 | T→A | 100% | intergenic (‑97/‑82) | USA300HOU_0183 ← / → USA300HOU_0184 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 195,286 | 0 | T | A | 100.0% | 273.4 / NA | 83 | intergenic (‑97/‑82) | USA300HOU_0183/USA300HOU_0184 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (33/50); total (33/50) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TTTGTTTCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTTAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGATTTTGCATCAACGA > CP000730/195148‑195416 | tttGTTTCTAGCTAGACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCACCTCTATATATGTTTATTTACTTATACTCTAACATGATTTTTATACTCTTTGATAATATAGTTTACAGAATTTTATCTAAATATTaaa > 2:645702/1‑141 (MQ=255) tGTTTCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTCTACTCTTTGATAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAaaaa > 1:148965/1‑141 (MQ=255) tGTTTCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATACATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAaaaa > 1:559584/1‑141 (MQ=255) tGTTCCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAaaaa > 1:325353/1‑141 (MQ=255) tCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAat > 1:301881/1‑141 (MQ=255) ttAGTTAAACTTGTTTAGACAGATTTTTTATTCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATGTACTTATACCCTAAAATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAAAATTAAAAAAAata < 2:58592/140‑1 (MQ=255) ttAGCTTAATTTGCTACGACAGATTCTTTAAAAAAAATGATAGCTCTCTATATATATGTTTGTTTGCTTATACGTTAGCATGATTTTTATGTTATTTGAAATTATATTTTACATTTTTTTATAAAAAAAAAAAAAAAAata < 2:338447/140‑1 (MQ=255) cTAGCTAAACTTGCTACGACATATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATTTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAata < 1:165429/141‑1 (MQ=255) cTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAata < 1:149719/141‑1 (MQ=255) cTAGCTAAACTCTACACCAGAGATTCTTTATCCATGACGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACCTATACCCCAACTTGATTTTCATCCTCTTTGAACATATATTTTTCAGAATTTCATCTAAATATTAAAAAAActa < 2:196435/141‑1 (MQ=255) cTTGCTACGACAGATAACTTATCAATTTAAATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAatat > 1:393694/1‑141 (MQ=255) gCTACGACAGTTTCCTTATACATAATGATAGACCTCTATATAGATGTTTGTCTACTTGCACCCTACGATTATTCTTATACTCTTTGAATATATGTTTTACAGGAGTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCt < 2:271196/141‑1 (MQ=255) gCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCt > 2:533246/1‑141 (MQ=255) aCATATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAAt < 2:335490/141‑1 (MQ=255) aCAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATTGTTACTTAATTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAAt < 2:272638/141‑1 (MQ=255) aCAGATTCTTTACCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAAt < 2:537098/141‑1 (MQ=255) tattttTCCATAATGCAAGTCACTTATATTTTTGCTTATCTATTTATTCCCCAACATTATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTATTATCCTTGTAATCCGATa < 2:631522/139‑1 (MQ=255) tCTTTATCCATAAGTGTAGCCCCTTATATATATGTTTATTTACGTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATa < 2:426935/141‑1 (MQ=255) tCTTGATCCATAAGGATCGCCCCCTATATATATGGTTATGTACGTATACCCTATCATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTCCAGAATTTTATCTAAAAAAAAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATa < 2:427311/141‑1 (MQ=255) tCTGTATCCATGATGATAGCTCTCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATa < 2:629544/141‑1 (MQ=255) cactattaTAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACGCTAACATGATTTTTTGACCCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATtat < 2:605399/134‑1 (MQ=255) caaaaTGATAGCCTCCTATTTATATGTTTATTTACGTATACCCTAACATGATTTTTATAGTTTTTGAAAATATATTTTACAGTATTTTATAAAAAAAAAAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATtat < 2:436807/138‑1 (MQ=255) cATAATAAAAGCTCCCTATATATATGTTTATGTACATATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGTATTTTATCTAAATAAAAAAAAAAATATGTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGACTtat < 2:492267/141‑1 (MQ=255) tattaTAGCCCCCTATATATATGTTTTTTTACTTATATCCTAACATTATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGt < 2:284036/137‑1 (MQ=255) aaTGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGt > 2:360661/1‑141 (MQ=255) accccccTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATAtt < 1:83997/139‑1 (MQ=255) aGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATAtt < 1:13870/141‑1 (MQ=255) cccTATATATATTTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAACAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGCTACGAATTATAGTAATAtttttt < 2:575523/141‑1 (MQ=255) ccTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTc < 1:444721/141‑1 (MQ=255) cTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCa < 1:76920/141‑1 (MQ=255) cTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCa > 1:357042/1‑141 (MQ=255) cTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTATAATCCGTTAAGAATTATAGAAATATTTTTTCa > 1:99712/1‑141 (MQ=255) tatatataTGTTTATTTACTTATCCCCTAACATGATTTTTATACGTTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTTATCCGATACGAATTATAGTAATATTTTTTCaa < 1:315556/141‑1 (MQ=255) atatatatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAAc > 2:682628/1‑141 (MQ=255) tataaatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTATTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATAATAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAAcc < 2:666100/141‑1 (MQ=255) tatatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCAt < 1:360661/141‑1 (MQ=255) tatggTTTA‑TTACTTTTCACCTCACATGATTTTTATACTCTTTGAACATATATCTTACACAATTTTATCTAAATATTAAAACAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGCTAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTg < 1:74599/137‑1 (MQ=255) tatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTg < 1:708593/141‑1 (MQ=255) tatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTg < 1:615719/141‑1 (MQ=255) tatGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTg > 2:678367/1‑141 (MQ=255) gTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTta < 1:499509/141‑1 (MQ=255) tttatttaCTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTtat < 1:474244/141‑1 (MQ=255) tttatttaCTTACACCCTAAAATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTtat < 2:236950/141‑1 (MQ=255) taCTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATaggagg > 2:332645/1‑141 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1:409795/141‑1 (MQ=255) aCTTATACCCTAACATGATTTTTATACACTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATATAAATAATAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGt < 2:151407/141‑1 (MQ=255) cTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATGTCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGtt > 2:532609/1‑140 (MQ=255) cTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTc > 1:723215/1‑141 (MQ=255) tcatctgctacctGATTCTTATACTCTTTGAAAATATTTTCTCCCTTTTTTTATCTAAAAATTAAAAACAATATCTTAATATCCTTGTAATCCCATAAGAATTATCGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCtt < 2:354675/129‑1 (MQ=255) aCCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCttatt > 2:785222/1‑141 (MQ=255) aCCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCttatt < 2:621063/141‑1 (MQ=255) aCCCTAAAATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATATAACTATTAAAAAAAATATTTTTATAACCTACAATGCCAACAAGAATGATAAGAATATTTTTTCAACCATTGTTAAaggagtgctgata > 2:569978/1‑133 (MQ=255) aaCATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAACAAATATCTTAATATCCTTGTATTCCGATGAGAATCATTTGAATATTTTGTCGTCGTGTTTTATAGTAGGTCttatttatta > 1:772419/1‑139 (MQ=255) aaCATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTGTTAATGa > 1:175649/1‑141 (MQ=255) cATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACa > 1:605448/1‑141 (MQ=255) gATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACatta > 1:427061/1‑141 (MQ=255) gATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACatta > 2:214835/1‑141 (MQ=255) aCTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTttatta > 1:467452/1‑141 (MQ=255) ctctTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAg < 2:660081/141‑1 (MQ=255) tttGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTTATTCTTTTTTATAGGAGAACTGATTTATGATatttattaattaggagg > 2:727684/1‑127 (MQ=255) tttGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAg < 1:625175/141‑1 (MQ=255) tttGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACAATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGAAATTTTTTTTATTAGAAg > 2:163434/1‑141 (MQ=255) aaaaTATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTaa > 2:462085/1‑141 (MQ=255) aaaaTATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAATAATATTTTTTCAACAGATGATTTACGAGAGTTTATTAATGACATTCTTTTTATTAGAAACTag > 2:246524/1‑140 (MQ=255) aaaTATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAAc < 1:409618/141‑1 (MQ=255) aaTATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTCATCCGCTAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGCCATTATTTTTATTAGAAGCTACCa > 1:364554/1‑141 (MQ=255) aaTATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACa > 2:207305/1‑141 (MQ=255) tatatTTTACATAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAAGATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAAt < 1:127454/141‑1 (MQ=255) tatatTCTACAGACTTATATCTAATTATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCACCCCTTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAAt < 1:212105/141‑1 (MQ=255) atatTTTACATAATTTTAACTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATc < 2:176400/141‑1 (MQ=255) atatTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATc < 2:148965/141‑1 (MQ=255) atatTTTACAGAATTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATc < 2:325353/141‑1 (MQ=255) atatTTTACAGAATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATc < 2:559584/141‑1 (MQ=255) ataaTTTACAGAAATTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATc < 2:783491/141‑1 (MQ=255) caccccagttaaTCTCACTATTAAAAAAAAGATCTTAATATCCTTGTGAGTCTATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGAtt < 2:156778/130‑1 (MQ=255) aTTTTATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGAAGGTTGCATGTATGACATTATTTTTATTATAAGCTAACAATCTTGATTTTGCAt > 1:585073/1‑141 (MQ=255) aTTTTATCTAAATAATAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATACGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGATTTTGCAt > 1:424660/1‑141 (MQ=255) tttATCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGATTTTGCATCa < 2:553827/141‑1 (MQ=255) tCTAAATATTAAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGATTTTGCATCAACGa > 1:16951/1‑141 (MQ=255) | TTTGTTTCTAGCTAAACTTGCTACGACAGATTCTTTATCCATAATGATAGCCCCCTATATATATGTTTATTTACTTATACCCTAACATGATTTTTATACTCTTTGAAAATATATTTTACAGAATTTTATCTAAATATTTAAAAAAATATCTTAATATCCTTGTAATCCGATAAGAATTATAGTAATATTTTTTCAACCATTGTTATAGGAGGTCTTATTAATGACATTATTTTTATTAGAAGCTAACAATCTTGATTTTGCATCAACGA > CP000730/195148‑195416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |