| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,026,958 | C→T | 5.2% | G330D (GGT→GAT) | vraS ← | sensor histidine kinase VraS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,026,958 | 0 | C | T | 5.2% | 330.2 / 5.9 | 107 | G330D (GGT→GAT) | vraS | sensor histidine kinase VraS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/45); new base T (3/3); total (59/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAA > CP000730/2026819‑2027097 | ccAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTAcc < 1:581255/141‑1 (MQ=255) actactTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGa > 1:640660/1‑141 (MQ=255) ctactTTAATGTCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCGTATACGGACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTTCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGaa < 1:623574/141‑1 (MQ=255) ttCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACTATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGCTTCTTTCACTTCGATACGTGTACCTGAATCTg > 2:354099/1‑141 (MQ=255) ttCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTg > 2:110785/1‑141 (MQ=255) tCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAGATTCCTATACGTACCATTTCATGCTCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTCTACCTGAATCttg > 1:196938/1‑139 (MQ=255) tatCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAt < 1:176637/141‑1 (MQ=255) tatCACTTGGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAt < 1:501940/141‑1 (MQ=255) atCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑g < 2:440997/141‑1 (MQ=255) ttGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACaa > 2:581818/1‑141 (MQ=255) gCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTCTTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAata > 1:629326/1‑141 (MQ=255) cGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATCCGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GTTACAattt > 2:63635/1‑139 (MQ=255) gTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATg < 1:37043/141‑1 (MQ=255) gTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑AATACAATATg > 2:465626/1‑141 (MQ=255) ttGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGATGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCACT‑GCTACAATATgg > 2:118857/1‑141 (MQ=255) atagataACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGATGCTTTCACCTCGATACGTATACCTGAATCTCACAAT‑GATACGATATTGAAc > 1:83667/1‑141 (MQ=255) taACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGc < 2:298893/141‑1 (MQ=255) ttaaaaTTCCTAGACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCa < 2:758964/138‑1 (MQ=255) ttGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATC‑CGCACTCTGTAGAATATGGAACGTTGCACCa < 1:595057/141‑1 (MQ=255) aaTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACACTCCTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAAttt > 2:531755/1‑141 (MQ=255) aaTTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAAttt > 2:318744/1‑141 (MQ=255) cTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATGCACTATGGAACGTTTCACCAATTTCCaaa > 1:720036/1‑141 (MQ=255) ttaCGGACCATTTCATGGTCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGc < 2:308410/140‑1 (MQ=255) ataCGTACCCTTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGAAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGc < 2:351831/141‑1 (MQ=255) ataCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACATGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGc > 1:596352/1‑141 (MQ=255) ataCGTACCATCTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGc < 2:262518/141‑1 (MQ=255) taCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGATCGTTGCACCAATTTCCAAAGct < 2:251031/141‑1 (MQ=255) aCGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGctc < 2:529527/141‑1 (MQ=255) cGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGctct < 1:706774/141‑1 (MQ=255) ccATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCa < 2:250387/141‑1 (MQ=255) aTTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGAAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACg < 2:739200/141‑1 (MQ=255) tttCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTCAATGAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCGCGCAAT‑GATACAAGATGGAACGTTGCACCAATTTCCAACGCTCTTTCActc > 1:672515/1‑139 (MQ=255) ttccATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCCCCAGTTTCCAAAGGCCTTTCACGc > 2:137482/4‑141 (MQ=255) ttCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCa > 2:700899/1‑141 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata < 1:569029/141‑1 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata < 1:219340/141‑1 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata < 1:254125/141‑1 (MQ=255) cATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCata < 1:126729/141‑1 (MQ=255) tGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATAtt < 2:784020/141‑1 (MQ=255) tGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATAtt < 1:505371/141‑1 (MQ=255) gATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATAttt > 2:387957/1‑141 (MQ=255) tcCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAg > 2:444783/1‑141 (MQ=255) cacaAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACAAATTTCCACAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTc < 2:799839/141‑1 (MQ=255) cacaAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCCCGATACGTGTACCTGAATCTGGGAAT‑GATACAATATGAAACGATGCACCAATTTCCAAAGATCTTTAACCAATCTTTTTCAGta > 2:713336/1‑140 (MQ=255) acaaacaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTcc < 1:177866/141‑1 (MQ=255) aaacaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCGCCTTATTTAAAGGTGCCTTCAGCTGGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCAt < 2:83778/141‑1 (MQ=255) acaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATaa < 1:131044/141‑1 (MQ=255) acaaTACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATaa < 2:613631/141‑1 (MQ=255) cTTTAATCGGCCTACGACTCCTCCTTATTTAAAGTTGCTTTCCCCTCGATACGTGTACCAGAATCTGGCAAT‑GTTACAATATCGAACGTTGCACCAATTTCCAGCGCTCTTTCACGCCAATTTTTCAGTCCATAACTTAGt > 2:419972/1‑141 (MQ=255) tAATCGTCATACGCATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCATTTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCt < 2:523859/141‑1 (MQ=255) gTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAttt < 1:387957/141‑1 (MQ=255) tCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAtttt > 2:12490/1‑141 (MQ=255) tCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGACAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAAtttt > 2:21009/1‑141 (MQ=255) cATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAGGTCCCTAACTTTGTTCTAtttttt > 1:622160/1‑141 (MQ=255) cGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTtcatc < 1:396009/141‑1 (MQ=255) cctcctTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTGTAATTTTTCGTCAACAt > 1:96578/1‑141 (MQ=255) ctcctTATTTAAAGGTGCTATACACTCTATGCTTGTACCAGGCTCGGGCACC‑GTGACAGTATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACAtt < 1:584276/141‑1 (MQ=255) cctTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAGCTTTGCTCTAATTTTTCATCAACCTTaa > 2:733082/1‑141 (MQ=255) ttATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATTCAAATTaaaa > 2:184469/1‑141 (MQ=255) ttATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGACCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTaaaa > 2:442114/1‑141 (MQ=255) tATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAAc < 1:321380/141‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTATCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCtt > 1:783736/1‑141 (MQ=255) tAACGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑TATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCttt < 1:740115/141‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCACT‑GATACAATATGACAGGCTGCGCCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTAcc > 1:153568/1‑141 (MQ=255) aGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTAcc > 1:16179/1‑141 (MQ=255) aGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTAcc > 2:414502/1‑141 (MQ=255) aGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTAcc > 1:703212/1‑141 (MQ=255) aGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGGTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACACTTAcc > 2:185371/1‑141 (MQ=255) gTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCAt > 1:64255/1‑141 (MQ=255) cTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTAt > 1:322778/1‑141 (MQ=255) cTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTAt > 1:522251/1‑141 (MQ=255) cTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTAt > 1:798771/1‑141 (MQ=255) cTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTAt > 1:88122/1‑141 (MQ=255) tttCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATCCAATAAGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATc < 1:753291/141‑1 (MQ=255) tttCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATc < 1:207730/141‑1 (MQ=255) tttCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATc < 1:27785/141‑1 (MQ=255) tttCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATc < 1:693839/141‑1 (MQ=255) ttCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCt > 2:469292/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACCTTAAAACCTTTACCATTATCtt > 1:16281/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTTTCtt > 2:272169/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCtt > 2:34773/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCtt > 2:467448/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCtt > 1:13909/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGGTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCGTCACCTTTAGCACTTTTACCATTATCtt > 1:16044/1‑141 (MQ=255) tCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGACAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCtt > 2:710442/1‑141 (MQ=255) cACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTg < 1:502150/141‑1 (MQ=255) cccTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGa < 2:134164/140‑1 (MQ=255) aCCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATTACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTCCCATTATCTTGa > 2:80828/1‑141 (MQ=255) aCCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGa > 2:461207/1‑141 (MQ=255) aCCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGa > 2:80752/1‑141 (MQ=255) aCCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGa > 2:272212/1‑141 (MQ=255) ccTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGaa > 2:93012/1‑141 (MQ=255) ccTCGATACGTGTACCTGAATCTGGAAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTCCCATTCTCTTGat > 2:239126/1‑140 (MQ=255) caacGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GCTACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGaa > 2:296596/4‑141 (MQ=255) ccGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGGCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAAtt < 1:110785/140‑1 (MQ=255) gATACGGGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATtct < 1:266495/141‑1 (MQ=255) tACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACaata < 1:63635/141‑1 (MQ=255) aCCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACaataa < 1:581818/141‑1 (MQ=255) aCCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACaataa > 2:42735/1‑141 (MQ=255) aCCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACCTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACaataa > 2:587986/1‑141 (MQ=255) | CCAACTACTTCAATATCACTTTGCGTTGATAGATAACTTGAAATTCCTATACGTACCATTTCATGATCATCCACAAACAATACTTTAATCGTCATACGAATCCTCCTTATTTAAAGGTGCTTTCACCTCGATACGTGTACCTGAATCTGGCAAT‑GATACAATATGGAACGTTGCACCAATTTCCAAAGCTCTTTCACGCATATTTTTAAGTCCATAACTTTGTTCTAATTTTTCATCAACATTAAAACCTTTACCATTATCTTGAATTCTCAACAATAA > CP000730/2026819‑2027097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |