| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,171,944 | A→G | 6.8% | N509D (AAT→GAT) | leuA2 → | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,171,944 | 0 | A | G | 6.8% | 203.4 / 3.2 | 69 | N509D (AAT→GAT) | leuA2 | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/26); new base G (3/2); total (41/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGAAGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGAATTTGGTG > CP000730/2171804‑2172084 | cAGAAGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGATGAGAAggtaggta > 1:281893/1‑141 (MQ=255) ggaGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGtaat < 2:752034/139‑1 (MQ=255) aaattACATGTAAACTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCCTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGtaat < 1:169344/137‑1 (MQ=255) aaGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTTGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGtaatt < 2:434639/141‑1 (MQ=255) aaGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGAATGTCAATGGCGATGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCTTATGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATTTTGAGAAGGTAGGtaatt > 2:403354/1‑141 (MQ=255) aGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGtaatta > 1:541862/1‑141 (MQ=255) gTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCCCATGTAAAACAGACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGCAAATGTTGAGAAGGTAGGtaattaa > 1:360812/1‑141 (MQ=255) aCATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTaattaatt < 2:636651/141‑1 (MQ=255) aaTTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACtt < 1:554149/141‑1 (MQ=255) aTTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCGCATGCTAAATTTGCGGCTGAAAAGGTGGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTta > 1:632647/1‑141 (MQ=255) aTTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTta > 2:331845/1‑141 (MQ=255) ttATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTtata < 2:437149/141‑1 (MQ=255) tATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATaa > 1:137396/1‑141 (MQ=255) attgattgAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAAc < 2:141115/141‑1 (MQ=255) aatgattgaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAAc < 2:141416/139‑1 (MQ=255) ttgattgaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACa > 1:88221/1‑141 (MQ=255) ttgattgaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACa < 1:409593/141‑1 (MQ=255) tgattgaAGGTAAGAGTGTCAATGGATTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAGTTAATTATGACTTATAACAt > 1:381378/1‑141 (MQ=255) tgattgaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACAt > 1:664086/1‑141 (MQ=255) ttgaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCCGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACAttgt < 2:571149/141‑1 (MQ=255) gaAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACAttgttg > 1:611537/1‑141 (MQ=255) aGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGcc < 2:95944/141‑1 (MQ=255) tAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCtc > 2:626918/1‑140 (MQ=255) tAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTa > 1:675158/1‑141 (MQ=255) aaGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACACGCCTATTTAAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTAc < 1:58371/141‑1 (MQ=255) aCTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTGTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTg < 1:209237/141‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGCTTGGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTgg < 2:562155/140‑1 (MQ=255) tCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGa < 2:541862/141‑1 (MQ=255) cAATGGCTTTGGTATTAATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGAt > 1:450984/1‑141 (MQ=255) ggCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAGTTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGGCTTATAACATTGTTGCACTACCTGGTGATGGaa > 2:234285/1‑141 (MQ=255) ggCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGaa > 1:507976/1‑141 (MQ=255) cTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATc > 2:646935/1‑141 (MQ=255) gTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTcc < 2:361590/141‑1 (MQ=255) aTTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAg > 1:485979/1‑141 (MQ=255) ttGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGa < 2:420734/141‑1 (MQ=255) gATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGaaa > 2:52606/1‑141 (MQ=255) gATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGaaa > 2:36750/1‑141 (MQ=255) gATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACCTATAACATTGTTGCCCTACCTGTTCATGGAATCGGTCCGGaaa > 1:368996/1‑141 (MQ=255) cATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGTTTAAGTGGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTTCCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAAttt < 2:568576/141‑1 (MQ=255) aggATATTTTAAAAACCTCTTATAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAAGTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTGATAAATTATGACTAATAAGATTGTTGCCCAACCTAGAGAAGGAATTGGTCCAGAAAgttt > 2:73268/3‑141 (MQ=255) aTGATATATTACAAGCCTCTAGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGGCTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAAtttt > 1:475660/1‑141 (MQ=255) atTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACg < 1:83948/141‑1 (MQ=255) atTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACg > 1:696010/1‑141 (MQ=255) ttttACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCGATACCTGGTAATGGCGTCGATCCAGAAATTTTGAACgg > 2:521943/1‑141 (MQ=255) tttACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTAGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTGTAAACCGa > 1:166761/1‑141 (MQ=255) cAAGCGTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAGATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTACAGAAATTTTGAACGGGtctc > 2:666682/1‑141 (MQ=255) aggctTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGACAATGTTGAGAAGGTAGGTGATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATc > 2:92813/4‑141 (MQ=255) aggctTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTGATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATc > 2:92486/4‑141 (MQ=255) tctTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCAt < 1:331845/141‑1 (MQ=255) gTAAAGCATACTTAGAAGCACATGCTAAATGTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTTATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCt < 1:402481/141‑1 (MQ=255) aaaGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTg < 1:98399/141‑1 (MQ=255) aGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGaa > 2:697041/1‑141 (MQ=255) cctACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAAt < 1:36312/139‑1 (MQ=255) aCGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATtat > 1:575594/1‑141 (MQ=255) gTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATaa > 2:250536/1‑141 (MQ=255) aaGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGtaa < 2:267830/141‑1 (MQ=255) aaGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAACGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGACCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGtaa < 1:368408/141‑1 (MQ=255) aaGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAAAGTTGAGAAGGGAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGAACCAGAAATTTTGAACAGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGtaa > 2:493303/1‑141 (MQ=255) caTGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTGTAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTaataaat > 1:505478/1‑141 (MQ=255) aTGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATACGTaataaaca > 2:720168/1‑139 (MQ=255) cTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATaa > 1:295072/1‑141 (MQ=255) aaTTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACtt > 2:12065/1‑141 (MQ=255) ttGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTTATAAATATAACTTTaa > 1:472532/1‑141 (MQ=255) ttGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTaa > 1:274944/1‑141 (MQ=255) cAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAAATAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTa > 1:482424/1‑141 (MQ=255) aGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTAt < 2:169894/141‑1 (MQ=255) aGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAAATTTAATTAt > 1:534325/1‑141 (MQ=255) aGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTAGCCTTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGCACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTAt > 2:32399/1‑141 (MQ=255) gCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATc < 2:664086/141‑1 (MQ=255) aaaaTGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCaaac > 2:760925/1‑140 (MQ=255) tGTTGAGAAGGTAAGCAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGATCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATCAATATAACTTTAATCATCAAATacag > 2:398505/1‑141 (MQ=255) ttGAGAAGGTAGGTGATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGca < 1:92813/141‑1 (MQ=255) ttGAGAAGGTAGGTGATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGca < 1:92486/141‑1 (MQ=255) tGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGcac > 1:710269/1‑141 (MQ=255) gaAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACAGTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGcaccac < 1:269435/141‑1 (MQ=255) aaGGTAGGTAATTACTTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACg < 2:611537/141‑1 (MQ=255) aggtaggtAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTCCCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGa < 1:493303/141‑1 (MQ=255) taggtaATTTATTATGTCTGATATCATTTTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGAAtt < 2:315747/141‑1 (MQ=255) taggtaATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGAAtt < 1:248252/141‑1 (MQ=255) aattaattATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGAATTtggtg < 1:250536/141‑1 (MQ=255) | CAGAAGTACATGTAAATTTATTGATTGAAGGTAAGACTGTCAATGGCTTTGGTATTGATCATGATATTTTACAAGCCTCTTGTAAAGCATACGTAGAAGCACATGCTAAATTTGCAGCTGAAAATGTTGAGAAGGTAGGTAATTAATTATGACTTATAACATTGTTGCCCTACCTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGCACCACGAATTTGGTG > CP000730/2171804‑2172084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |