BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	92 (1.230)	67 (1.300) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	42/180	NT	51.4%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	1998278 =	NA (NA)	67 (1.300) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	42/180	NT	51.4%	intergenic (‑6/+5)	USA300HOU_t0050/rrf4	tRNA‑Val/5S ribosomal RNA

Only 100 of 219 total aligned reads displayed.

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaagggacaagataaa                                                                                                                                             <  2:720122‑M1/1‑1 (MQ=255)

gtcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaaatatggaaaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                             >  1:326470‑M1/141‑141 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatgacgaacacagaagtgaagctccttagagtgggaactaatcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggccaagataaaa                                                                                                                                            >  1:625812‑M1/140‑141 (MQ=255)

 tcacacctgttcccatcccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaa                                                                                                                                            >  2:81764‑M1/140‑141 (MQ=255)

 gggTGTTCAGTACAGATGACAAATGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaa                                                                                                                                            <  1:720303/141‑1 (MQ=255)

 gggCGTTCAGTACAGATGAAAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGATGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaa                                                                                                                                            <  1:445517/141‑1 (MQ=255)

   acacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaa                                                                                                                                          >  1:437912‑M1/138‑141 (MQ=255)

      ttCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaa                                                                                                                                          <  2:716963/138‑1 (MQ=255)

        tgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaataaaacgtcggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTa                                                                                                                                     <  1:21391‑M1/9‑1 (MQ=255)

          gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAtt                                                                                                                                   >  2:240638/1‑141 (MQ=255)

            cccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGa                                                                                                                                 >  2:549917‑M1/129‑141 (MQ=255)

             cAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAGGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAATTTAATTTTAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                <  2:77342/141‑1 (MQ=255)

                  ccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccactagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataagatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTaaa                                                                                                                           <  1:579938‑M1/19‑1 (MQ=255)

                     aaaGGTTTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        <  2:192427/141‑1 (MQ=255)

                      aaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  2:531451/141‑1 (MQ=255)

                        acagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAtgttga                                                                                                                     >  1:72561‑M1/117‑139 (MQ=255)

                         cagaagttaagctccttagcgtcgattgtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAatgttgat                                                                                                                    >  2:493170‑M1/116‑138 (MQ=255)

                           gtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa                                                                                                                  >  1:31189/1‑141 (MQ=255)

                              gttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAAt                                                                                                               <  1:380881‑M1/31‑1 (MQ=255)

                              aTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt                                                                                                               >  1:861623/1‑141 (MQ=255)

                              aTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt                                                                                                               >  2:59610/1‑141 (MQ=255)

                               tttttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTATGTCGTTTATGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg                                                                                                              <  1:668797/141‑1 (MQ=255)

                               ttaagctccttagcgtcgatgttagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaatttttgttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATg                                                                                                              >  1:761697‑M1/110‑141 (MQ=255)

                                taagctgcttagcggcgatggtagtcgaacttactgtcctctagagtagaacgttgtcaggcagttttttaaacaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGt                                                                                                             >  2:30302‑M1/109‑141 (MQ=255)

                                 aagctccttagcctcgatggtactcgaacttacggtccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGta                                                                                                            >  2:361625‑M1/108‑141 (MQ=255)

                                   gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtata                                                                                                          <  1:436344‑M1/36‑1 (MQ=255)

                                   gctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGtata                                                                                                          <  2:211295‑M1/36‑1 (MQ=255)

                                     cTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAATTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat                                                                                                        >  1:315722/1‑141 (MQ=255)

                                        tgagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaaacaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     >  2:577727‑M1/101‑141 (MQ=255)

                                          agcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATaattaatt                                                                                                   <  1:121436‑M1/43‑1 (MQ=255)

                                            cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  2:104076‑M1/45‑1 (MQ=255)

                                              tcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTg                                                                                               <  1:37595‑M1/47‑1 (MQ=255)

                                                gatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTACTTCTTGTc                                                                                             <  2:324233‑M1/49‑1 (MQ=255)

                                                   ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:457557‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                   ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:130710‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                   ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  2:662410‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                    ttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         >  2:187026/1‑141 (MQ=255)

                                                    ttGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         >  1:351442/1‑141 (MQ=255)

                                                    gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa                                                                                         <  2:686058‑M1/53‑1 (MQ=255)

                                                      gAAAGCCTGTATAATAGTTATTGGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       <  1:293214/141‑1 (MQ=255)

                                                      agccgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccagggagttttttaatcaaattttgcttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACGTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       >  1:300510‑M1/87‑141 (MQ=255)

                                                       aaaGACTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                      <  1:854316/141‑1 (MQ=255)

                                                         cgaacttacgttccgctacagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaaa                                                                                    >  1:106177‑M1/84‑141 (MQ=255)

                                                            cTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAt                                                                                 >  2:341109/1‑141 (MQ=255)

                                                             cttacgccccgtgagggtagaacgttggcaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACGTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATg                                                                                >  1:109489‑M1/80‑141 (MQ=255)

                                                              gTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGa                                                                               >  1:700306/1‑141 (MQ=255)

                                                                acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaacaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAACGTTGATCACATGTATAATTCATCCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             <  1:604324‑M1/65‑1 (MQ=255)

                                                                acgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             >  1:407802‑M1/77‑141 (MQ=255)

                                                                  gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaattggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                           >  1:558178‑M1/75‑141 (MQ=255)

                                                                  gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                           >  1:341411‑M1/75‑141 (MQ=255)

                                                                   ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTAGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                          <  2:798151‑M1/68‑1 (MQ=255)

                                                                        tatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa                                                                     <  1:53855/141‑1 (MQ=255)

                                                                         tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaatagaaggtacaagatcaAAAAACTGATGGACTTAAATGTTGATAAAATTTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                    <  1:202867‑M1/74‑1 (MQ=255)

                                                                          tttGTGGAGGAAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   <  2:414121/141‑1 (MQ=255)

                                                                            tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTGAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTACTAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGACCATTGAAACCTGa                                                                 >  1:548206/1‑141 (MQ=255)

                                                                             gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAATAAAAATGAACATTGAAAACTGaa                                                                >  2:67578/1‑141 (MQ=255)

                                                                              ttgAGGCAAGCAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAGAATTAATTGTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt                                                               >  2:443850/1‑141 (MQ=255)

                                                                               tgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg                                                              <  1:240638/141‑1 (MQ=255)

                                                                                gAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGa                                                             >  2:708134/1‑141 (MQ=255)

                                                                                  ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACa                                                           >  1:828277/1‑141 (MQ=255)

                                                                                       acaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTTTTGGCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATg                                                      >  1:713361/1‑141 (MQ=255)

                                                                                         caggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTc                                                    <  1:139683‑M1/90‑1 (MQ=255)

                                                                                          aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaagtggagaagagaaAAGAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                   <  2:651236‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                                            acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAACATATGTCAAc                                                 >  1:624256/1‑141 (MQ=255)

                                                                                            acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGATAATAAAATGTATAACGATGGCGCGTCGGTGAGAAAAATGAACATAGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc                                                 >  1:162741/1‑141 (MQ=255)

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                                                                                                      aatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCa                                       >  1:91579‑M1/39‑141 (MQ=255)

                                                                                                       atcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGGTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                      >  1:79009‑M1/38‑141 (MQ=255)

                                                                                                         caaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    <  2:248940‑M1/106‑1 (MQ=255)

                                                                                                             ttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACg                                >  2:436382‑M1/32‑141 (MQ=255)

                                                                                                               ttggttaaaaaagaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTa                              <  2:803910‑M1/112‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 ggttaaaaaacaaaatggacaagataaAAAAAGTTATGGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc                            >  2:41877‑M1/28‑141 (MQ=255)

                                                                                                                  ttGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACt                           <  1:734475/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACta                          <  2:828277/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    gAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtat                         >  1:529464/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                     aaaaaaaaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATACTGCACAAAGTGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                        >  1:816287‑M1/24‑141 (MQ=255)

                                                                                                                     aaTTAATAACAAAAATAAATCAAAAAAAGTTAACGACTTAAATGCTAATAAAATGTACAACTAACTCTTGTCAGTAAGAAAAATGAACATAGAAAACTGAATGACAATATGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACGTAACtata                        <  2:539321/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      aaaaataaaatggacaagataaAAAAAGGTATTGACTTAAATGTTGAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATaa                       >  1:857114‑M1/23‑141 (MQ=255)

                                                                                                                      aTTACTAACGAAAATTAATTTTGAAAAGTTATTGACTTAAGTGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtatat                       <  2:523073/141‑2 (MQ=255)

                                                                                                                         tcTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt                    <  2:693098/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                         aataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGtt                    >  1:104076‑M1/20‑141 (MQ=255)

                                                                                                                           tAACGAAAATTAATTTTCAGAGGGTAGTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTATTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAc                  >  2:615095/1‑141 (MQ=25)

                                                                                                                            aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                 >  2:121436‑M1/17‑141 (MQ=255)

                                                                                                                            aaCGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACa                 >  2:110069/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                              aatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTCTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCATAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               >  2:619561‑M1/15‑141 (MQ=255)

                                                                                                                               aaaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc              <  2:157369/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                               aaaaaTTAAATTTAAAAAATTATTGAATTAAATGTTAAAAAAATGTACAATTAATTCTTGTCAGTAAGAAAAATGAAAATTTAAAACGTAATGACAATATGTAAACGTTAATTCAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc              <  2:564604/140‑1 (MQ=21)

                                                                                                                                    caagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattat         <  2:38547‑M1/133‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                      aattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAAAAACATTAttt       >  2:432781/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                         tttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGCAACTATAAGTTACAAACCTTATTTAGt    <  1:635340/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                         aaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACAAAAAAAAAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGt    >  2:202867‑M1/4‑141 (MQ=255)

AGGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512480‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.