| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,419,527 | 0 | G | T | 21.8% | 199.9 / 42.6 | 87 | P7T (CCT→ACT) | USA300HOU_1317 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/28); new base T (11/8); total (51/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.47e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGAAAATTTGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGTT > CP000730/1419387‑1419666 | ttGAAAATTTGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAgg < 2:844756/141‑1 (MQ=255) gAAAATTTGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCa > 1:459420/1‑141 (MQ=255) aTTTGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATc < 1:873870/141‑1 (MQ=255) tGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGaa > 1:420338/1‑141 (MQ=255) ggAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGaat > 2:371632/1‑141 (MQ=255) aTAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGaataat < 2:856612/141‑1 (MQ=255) tAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCGTTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATg < 1:309591/141‑1 (MQ=255) aaaTGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCat > 1:342451/1‑141 (MQ=255) aTGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCatat > 2:446199/1‑141 (MQ=255) gCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATattc > 1:467261/1‑141 (MQ=255) cAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATattca > 1:111472/1‑141 (MQ=255) gCACACCTACTATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACATAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATattcattc > 2:828249/1‑141 (MQ=255) aacacCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTTTGTTCCATAAATAATTAGTCATATTGAATAATTTCTTattcatttt > 2:960858/2‑139 (MQ=255) acacCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATtctc < 1:505715/141‑1 (MQ=255) acCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCt > 2:560356/1‑141 (MQ=255) taACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTc < 2:635706/141‑1 (MQ=255) aaCAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTTAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCa < 1:771720/141‑1 (MQ=255) aCAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAt < 2:777488/141‑1 (MQ=255) aCAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAt > 2:31601/1‑141 (MQ=255) aCAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAt > 2:966013/1‑141 (MQ=255) cAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAGCAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAtt < 2:71354/141‑1 (MQ=255) cAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAtt < 2:365219/141‑1 (MQ=255) cAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCAtt > 2:158071/1‑141 (MQ=255) aaaTGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTa > 1:109872/1‑141 (MQ=255) cTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGta < 2:594314/141‑1 (MQ=255) cTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGta < 2:393735/141‑1 (MQ=255) gaaaCAAACCAAATATGTAAAACAAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTAGACTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACAt > 2:940090/4‑141 (MQ=255) gATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACAt > 2:329964/1‑141 (MQ=255) aTACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACAtt > 2:576516/1‑141 (MQ=255) aCCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTttatta > 1:280258/1‑141 (MQ=255) aCCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTttatta > 1:951168/1‑141 (MQ=255) tttatttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAACGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTATCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATaaa > 2:255496/1‑141 (MQ=255) ttatttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAt < 1:739225/141‑1 (MQ=255) ttatttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAt < 2:379407/141‑1 (MQ=255) ttatttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATAATTATTAATGTTGTGATCCATATATAATTAGGCATATCGAATAACGTCGTATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAt < 2:296893/141‑1 (MQ=255) tatttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAtt > 1:462238/1‑141 (MQ=255) atttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAttt > 2:482359/1‑141 (MQ=255) atttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATCTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAttt > 2:378332/1‑141 (MQ=255) ttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAttttt > 2:762672/1‑141 (MQ=255) ttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATCTTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTTCTTGTATACATTTTGTTATAAAttttt > 1:776708/1‑141 (MQ=255) ttaAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAttttt < 2:562064/141‑1 (MQ=255) taAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTa > 2:495653/1‑141 (MQ=255) aaaCTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTaaa > 2:500588/1‑141 (MQ=255) tAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACt < 1:680695/141‑1 (MQ=255) aGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCTTATAATGTCATTTTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTa > 1:636395/1‑141 (MQ=255) aGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTa > 2:889970/1‑141 (MQ=255) cAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTaaa > 1:144866/1‑141 (MQ=255) cAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTaaa > 2:127778/1‑141 (MQ=255) aaCAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTACCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTaagc < 2:307178/141‑3 (MQ=255) aCAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATAGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACa > 1:314769/1‑141 (MQ=255) cAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTATCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACCAAAACaa > 2:357682/1‑141 (MQ=255) gAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATa > 1:849815/1‑141 (MQ=255) tatTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTAAAAAAAAAAAAAAACTTAAACAATAGca < 2:850832/141‑1 (MQ=255) ttGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagt > 2:137409/1‑141 (MQ=255) ttGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagt > 2:33783/1‑141 (MQ=255) ttGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagt > 2:222764/1‑141 (MQ=255) ttGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagt > 2:139359/1‑141 (MQ=255) ttGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagt > 2:479020/1‑141 (MQ=255) tGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagtc > 2:237621/1‑141 (MQ=255) tGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGcagtc < 2:111472/141‑1 (MQ=255) aataaAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGtt < 1:355690/141‑1 (MQ=255) aataaAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGtt > 1:96228/1‑141 (MQ=255) ataaAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGttt > 2:72969/1‑141 (MQ=255) taaATTCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTc > 1:958605/1‑141 (MQ=255) aaaaTCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTCTTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCa < 1:716900/141‑1 (MQ=255) cATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCaa < 1:205170/141‑1 (MQ=255) aattattAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAAATATTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCaa < 2:538733/140‑1 (MQ=255) attattAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAat > 1:447118/1‑141 (MQ=255) tattaATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAatat > 1:705713/1‑141 (MQ=255) tattaATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAatat < 2:328722/141‑1 (MQ=255) taATGTTGTGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATtct < 1:929734/141‑1 (MQ=255) aTGTTGTGGTTCATGGCTAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTTATTCTCCTTTTATGTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTACTATATATTGTTAAAAACTTATACAAGTGCTTTCAGTTTCAGGCaagctgctat < 2:843165/141‑9 (MQ=255) aTGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATtctat < 1:158071/141‑1 (MQ=255) aTGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATtctat < 1:560356/141‑1 (MQ=255) gttgtGATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATtctatct < 1:62026/141‑1 (MQ=255) gtgATCCATAAATAATTAGTCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATctact < 1:261237/141‑1 (MQ=255) gtgATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTATTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTAAAAATATTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATctact < 2:235043/141‑1 (MQ=255) tCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATa < 1:416134/141‑1 (MQ=255) ataaataaTTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGaa > 2:729506/1‑141 (MQ=255) aataatTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGaaaaa > 1:661457/1‑141 (MQ=255) aataatTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGaaaaa < 1:801807/141‑1 (MQ=255) ataatTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAAt > 2:373566/1‑141 (MQ=255) ataatTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAAt < 2:649165/141‑1 (MQ=255) tAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTg > 1:493961/1‑141 (MQ=255) aGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGt < 1:666396/141‑1 (MQ=255) aGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGt < 2:905397/141‑1 (MQ=255) aGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGt > 2:568215/1‑141 (MQ=255) aGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGt > 1:852121/1‑141 (MQ=255) ggCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGtt > 1:715756/1‑141 (MQ=255) | TTGAAAATTTGGAATAAAAAATGCAAGCACACCTAATATAACAAATGTAATTACTGCAGATACAAACCATTTATTTAAAACTAAGCAACAGAATATTGTTAATAAAATCATTATTAATGTTGTGATCCATAAATAATTAGGCATATCGAATAATGTCATATTCATTCTCCTTTTATTTCATTACTTTCCTTGTATACATTTTATTATAAATTTTTAAAAACTTAAACAATAGCAGTCAGTTTCAAGCAATATTCTATCTACTAATAGAAAAATCATTGTT > CP000730/1419387‑1419666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |