New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 810097 = | 35 (0.930) | 3 (0.090) | 3/252 | 5.8 | 8.9% | intergenic (+28/‑90) | nrdE/nrdF | ribonuceloside diphosphate reductase subunit alpha/ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
? | CP000730 | 810130 = | 30 (0.880) | intergenic (+61/‑57) | nrdE/nrdF | ribonuceloside diphosphate reductase subunit alpha/ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGT > CP000730/809991‑810263 | cTATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATTCTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGAc < 2:23735/141‑1 (MQ=255) gATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGt > 2:347626/1‑141 (MQ=255) aTTAAAATCACCATACTATAATAGCAACAAATTATTAAGGGTAGAGGAACGTACAAGTTGTTCTAGCTAACAATTAATTGTTGAAAATGACAAACCGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTc < 2:99506/141‑1 (MQ=255) cTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTc > 2:363508/1‑141 (MQ=255) cTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTc < 2:354502/141‑1 (MQ=255) ttACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCaa > 2:55181/1‑141 (MQ=255) actatactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAatt < 1:60668/141‑1 (MQ=255) actatactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAatt > 2:77151/1‑141 (MQ=255) tatactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAattat < 2:220048/141‑1 (MQ=255) taGAAATAAATTATTAAGTGTAAAAGAATGTAAAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTTATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGt < 2:288059/141‑1 (MQ=255) ataaatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAt < 2:307814/141‑1 (MQ=255) tattaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACagg > 2:155494/1‑141 (MQ=255) tgtAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAt > 2:133496/1‑141 (MQ=255) aaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCa < 1:304275/141‑1 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAGATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGa < 2:20080/141‑1 (MQ=255) ttgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:76651/141‑1 (MQ=255) ttgttCTATCGAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTCCAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGt < 2:136521/141‑1 (MQ=255) gttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCCTGATAGCTGTTa > 1:334766/1‑141 (MQ=255) tctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGa > 2:410332/1‑141 (MQ=255) ctaACAAATAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAAGCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAGTACAGAAGGAAATTATATGCATGATAGCTGCTAAGTGGaa < 2:110420/141‑1 (MQ=255) aCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAacac > 2:75295/1‑141 (MQ=255) cAATTAAATGTTGAAAAGGACAAACAGTGAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTGTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAAGTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAacaca < 2:384115/141‑1 (MQ=255) tAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACaag < 1:132532/141‑1 (MQ=255) aaTGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACaagaa > 2:415107/1‑141 (MQ=255) aTGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACaagaag > 1:416636/1‑141 (MQ=255) gACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAat > 1:282193/1‑141 (MQ=255) atcatcTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGgaga > 2:177060/1‑141 (MQ=255) tGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAat < 1:183018/141‑1 (MQ=255) gCTCTGAATTAGCAGGTGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAata > 2:195970/1‑141 (MQ=255) ctGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAatatat < 1:166343/141‑1 (MQ=255) gCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAAtg < 1:282406/141‑1 (MQ=255) tgatTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGt > 2:154240/1‑141 (MQ=255) | CTATAAAGGATTAAAATCACTTTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAACACACAAGAAGATATGACGAATATGTTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGT > CP000730/809991‑810263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |