Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA CP000730 2,046,831 A→G 11.8% intergenic (+39/+50) putP → / ← camS SSS family solute:sodium (Na+)/proline symporter/pheromone lipoprotein CamS

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP0007302,046,8310AG11.8% 184.7 / 15.1 68intergenic (+39/+50)putP/camSSSS family solute:sodium (Na+)/proline symporter/pheromone lipoprotein CamS
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (31/29);  new base G (3/5);  total (34/34)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.68e-01

AGTGTAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAAT  >  CP000730/2046691‑2046970
                                                                                                                                            |                                                                                                                                           
aGTGTAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTaa                                                                                                                                             <  1:636001/141‑1 (MQ=255)
    tAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCaa                                                                                                                                         <  1:269779/141‑1 (MQ=255)
       tCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAAt                                                                                                                                      >  1:342793/1‑141 (MQ=255)
          ttACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTAt                                                                                                                                   >  2:30196/1‑141 (MQ=255)
             cATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGAc                                                                                                                                >  2:42304/1‑141 (MQ=255)
               tatGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTa                                                                                                                              >  2:131742/1‑141 (MQ=255)
                atGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTaa                                                                                                                             <  1:17917/141‑1 (MQ=38)
                   ttgtAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACAt                                                                                                                          >  2:30401/1‑141 (MQ=255)
                    tgtAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACAtt                                                                                                                         <  1:597198/141‑1 (MQ=38)
                     gtaagtaaACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACAtta                                                                                                                        <  1:771029/141‑2 (MQ=38)
                       aagtttaCTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGt                                                                                                                      >  2:437287/7‑141 (MQ=255)
                           aaaCTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCt                                                                                                                  <  1:556427/141‑1 (MQ=37)
                               ttACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCttttt                                                                                                              <  1:484109/141‑1 (MQ=37)
                                 aCTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTttat                                                                                                            <  1:28568/141‑1 (MQ=255)
                                  cTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTttatt                                                                                                           >  2:67217/1‑141 (MQ=255)
                                    aaaaaaCCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTtattat                                                                                                         <  1:571625/141‑1 (MQ=255)
                                     aaaaaCCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATc                                                                                                        <  1:258157/141‑1 (MQ=255)
                                            tGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAAtt                                                                                                 >  2:605206/1‑141 (MQ=255)
                                            tGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAAtt                                                                                                 >  2:86394/1‑141 (MQ=255)
                                              gTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTAGGATCTTTAATTTa                                                                                               >  1:42905/1‑141 (MQ=255)
                                                     tgttgAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACaattaa                                                                                        >  2:775180/1‑141 (MQ=255)
                                                         gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc                                                                                    <  2:219686/141‑1 (MQ=255)
                                                         gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc                                                                                    >  1:660944/1‑141 (MQ=255)
                                                         gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc                                                                                    <  1:496262/141‑1 (MQ=255)
                                                           aaCTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTg                                                                                  >  2:249736/1‑141 (MQ=255)
                                                           aaCTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTACTATCTTTAATTTACAATTAATTACTg                                                                                  >  2:623440/1‑141 (MQ=255)
                                                               gACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTaaa                                                                              >  2:362953/1‑141 (MQ=255)
                                                                aCTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAat                                                                             <  1:420946/141‑1 (MQ=255)
                                                                 cTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAata                                                                            <  1:267820/141‑1 (MQ=255)
                                                                  ttAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAatat                                                                           >  2:653422/1‑141 (MQ=255)
                                                                   tAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATg                                                                          <  1:703393/141‑1 (MQ=255)
                                                                     aaCAAAGTTCGTGACCTCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGaa                                                                        >  2:52770/1‑141 (MQ=255)
                                                                     aaCAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTGACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGaa                                                                        <  2:44239/141‑1 (MQ=255)
                                                                      aCAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAAc                                                                       >  2:473388/1‑141 (MQ=255)
                                                                        aaaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAACATTATGACTAACATTGGTACCTTTCTATTATATTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACtt                                                                     <  1:674895/141‑1 (MQ=255)
                                                                        aaaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACtt                                                                     >  2:576493/1‑141 (MQ=255)
                                                                         aaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAGCTTg                                                                    >  2:48780/1‑141 (MQ=255)
                                                                         aaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTg                                                                    <  1:275734/141‑1 (MQ=255)
                                                                          aGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGc                                                                   >  1:628718/1‑141 (MQ=255)
                                                                           gTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCg                                                                  >  2:478261/1‑141 (MQ=255)
                                                                                         tAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCt                                                    >  2:534979/1‑141 (MQ=255)
                                                                                         tAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCt                                                    <  1:436377/141‑1 (MQ=255)
                                                                                          agagAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCtt                                                   <  1:722762/141‑1 (MQ=255)
                                                                                          agagAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCtt                                                   <  1:669396/141‑1 (MQ=255)
                                                                                           gagaAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCttt                                                  >  1:468646/1‑141 (MQ=255)
                                                                                           gagaAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCttt                                                  <  1:224654/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                 aataatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCtt                                            <  1:680676/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ataatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTa                                           <  2:193218/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                    aatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACt                                         <  1:254586/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                            aGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTGAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAg                                 <  2:385047/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                             gTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTATATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGc                                <  2:314832/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                             gTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGc                                <  1:554888/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                               cTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCAc                              <  1:110069/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                 aaagataatAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGt                            >  2:436977/9‑141 (MQ=21)
                                                                                                                 aaagataatAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGt                            >  2:245845/9‑141 (MQ=21)
                                                                                                                  aaCAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtg                           >  2:511839/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                       aTTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtggttgg                      <  1:493295/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                        ttAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtggttggt                     <  2:687311/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                          aaaaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTa                   <  2:513367/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                          aaaaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTa                   >  1:435325/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                            aaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTAcc                 >  1:268935/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                             aaGGTACTAATGTTAATCAAGATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCa                <  2:244403/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                  aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt           >  1:106800/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                  aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt           >  1:751390/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                  aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt           >  1:369377/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                      aTGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTGATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATa       >  2:94936/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                      aTGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATa       <  1:249736/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                       tGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATAc      >  1:440335/1‑141 (MQ=38)
                                                                                                                                       tGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATAc      <  2:436926/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                           aaTCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAAt  >  1:389285/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                            |                                                                                                                                           
AGTGTAATCGTTACATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAAT  >  CP000730/2046691‑2046970

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: