Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 2,046,844 | C→T | 12.8% | intergenic (+52/+37) | putP → / ← camS | SSS family solute:sodium (Na+)/proline symporter/pheromone lipoprotein CamS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 2,046,844 | 0 | C | T | 12.8% | 191.0 / 16.8 | 70 | intergenic (+52/+37) | putP/camS | SSS family solute:sodium (Na+)/proline symporter/pheromone lipoprotein CamS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/31); new base T (3/6); total (33/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.88e-01 |
CATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATCGA > CP000730/2046704‑2046984 | cATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGAc > 2:42304/1‑141 (MQ=255) tatGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTa > 2:131742/1‑141 (MQ=255) atGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTaa < 1:17917/141‑1 (MQ=38) ttgtAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACAt > 2:30401/1‑141 (MQ=255) tgtAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACAtt < 1:597198/141‑1 (MQ=38) gtaagtaaACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACAtta < 1:771029/141‑2 (MQ=38) aagtttaCTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGt > 2:437287/7‑141 (MQ=255) aaaCTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCt < 1:556427/141‑1 (MQ=37) ttACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCttttt < 1:484109/141‑1 (MQ=37) aCTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTttat < 1:28568/141‑1 (MQ=255) cTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTttatt > 2:67217/1‑141 (MQ=255) aaaaaaCCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTtattat < 1:571625/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATc < 1:258157/141‑1 (MQ=255) tGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAAtt > 2:86394/1‑141 (MQ=255) tGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAAtt > 2:605206/1‑141 (MQ=255) gTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTAGGATCTTTAATTTa > 1:42905/1‑141 (MQ=255) tgttgAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACaattaa > 2:775180/1‑141 (MQ=255) gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc > 1:660944/1‑141 (MQ=255) gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc < 2:219686/141‑1 (MQ=255) gAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTAc < 1:496262/141‑1 (MQ=255) aaCTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTg > 2:249736/1‑141 (MQ=255) aaCTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTACTATCTTTAATTTACAATTAATTACTg > 2:623440/1‑141 (MQ=255) gACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTaaa > 2:362953/1‑141 (MQ=255) aCTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAat < 1:420946/141‑1 (MQ=255) cTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAata < 1:267820/141‑1 (MQ=255) ttAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAatat > 2:653422/1‑141 (MQ=255) tAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATg < 1:703393/141‑1 (MQ=255) aaCAAAGTTCGTGACCTCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGaa > 2:52770/1‑141 (MQ=255) aaCAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTGACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGaa < 2:44239/141‑1 (MQ=255) aCAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAAc > 2:473388/1‑141 (MQ=255) aaaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAACATTATGACTAACATTGGTACCTTTCTATTATATTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACtt < 1:674895/141‑1 (MQ=255) aaaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACtt > 2:576493/1‑141 (MQ=255) aaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAGCTTg > 2:48780/1‑141 (MQ=255) aaGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTg < 1:275734/141‑1 (MQ=255) aGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGc > 1:628718/1‑141 (MQ=255) gTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCg > 2:478261/1‑141 (MQ=255) tAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCt < 1:436377/141‑1 (MQ=255) tAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCt > 2:534979/1‑141 (MQ=255) agagAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCtt < 1:722762/141‑1 (MQ=255) agagAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCtt < 1:669396/141‑1 (MQ=255) gagaAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCttt < 1:224654/141‑1 (MQ=255) gagaAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCttt > 1:468646/1‑141 (MQ=255) aataatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCtt < 1:680676/141‑1 (MQ=255) ataatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTa < 2:193218/141‑1 (MQ=255) aatTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACt < 1:254586/141‑1 (MQ=255) aGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTGAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAg < 2:385047/141‑1 (MQ=255) gTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTATATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGc < 2:314832/141‑1 (MQ=255) gTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGc < 1:554888/141‑1 (MQ=255) cTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCAc < 1:110069/141‑1 (MQ=255) aaagataatAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGt > 2:436977/9‑141 (MQ=21) aaagataatAAAAAGGTACCAATGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGt > 2:245845/9‑141 (MQ=21) aaCAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtg > 2:511839/1‑141 (MQ=255) aTTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtggttgg < 1:493295/141‑1 (MQ=255) ttAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGtggttggt < 2:687311/141‑1 (MQ=255) aaaaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTa > 1:435325/1‑141 (MQ=255) aaaaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTa < 2:513367/141‑1 (MQ=255) aaaGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTAcc > 1:268935/1‑141 (MQ=255) aaGGTACTAATGTTAATCAAGATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCa < 2:244403/141‑1 (MQ=255) aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt > 1:106800/1‑141 (MQ=255) aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt > 1:369377/1‑141 (MQ=255) aCTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCttt > 1:751390/1‑141 (MQ=255) aTGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTGATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATa > 2:94936/1‑141 (MQ=255) aTGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATa < 1:249736/141‑1 (MQ=255) tGTTAGTCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATAc > 1:440335/1‑141 (MQ=38) tGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATAc < 2:436926/141‑1 (MQ=255) aaTCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAAt > 1:389285/1‑141 (MQ=255) gtCATAATTTTGATTAACATTAGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAAtt < 2:684943/140‑1 (MQ=255) aTTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAg < 2:314544/141‑1 (MQ=255) aTGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTa < 1:180260/141‑1 (MQ=255) tGACTAANATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACAAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTAt < 2:589617/141‑1 (MQ=255) tGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTCATTAAAGCACGTGGTTGGGTACCATCTGTAATACGAATTTCATAGtaac > 2:585920/1‑138 (MQ=255) acttacttTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATct > 2:396934/1‑140 (MQ=255) cTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATCGa < 1:495968/141‑1 (MQ=255) | CATATGTTGTAAGTAAACTTACTAAAAAACCTGGTGCATTTGTTGAAACTGACTTAAACAAAGTTCGTGACATCGTTAGAGAAAAATAATTCATAAGTCTTAACAAATTAAAAAGGTACTAATGTTAATCAAAATTATGACTAACATTGGTACCTTTTTATTATCTTTAATTTACAATTAATTACTGTAAATATGAACTTGCGGTTCTTTGTCATCTTTTGTCTTACTAATTAAAGCACGTGGTTGGTTACCATCTTTAATACGAATTTCATAGTTATCGA > CP000730/2046704‑2046984 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |