| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,519,942 | C→A | 6.7% | W230C (TGG→TGT) | narG ← | nitrate reductase alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,519,942 | 0 | C | A | 6.7% | 255.3 / 5.0 | 75 | W230C (TGG→TGT) | narG | nitrate reductase alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/36); new base A (3/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 | |||||||||||
ATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTG > CP000730/2519802‑2520078 | aTGGCTTTTGTACCTTGAGAGCGGTCTTCAGTCATAAAATGTGCAGCCGGAGTACGTGTTGAAGGTACATTAGAGCCCCACCTAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTccc < 2:527205/141‑1 (MQ=255)aTGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTccc < 1:23985/141‑1 (MQ=255) gACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCa < 2:661202/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaa < 2:439744/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaa < 2:326455/141‑1 (MQ=255) cTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaaa < 2:265328/141‑1 (MQ=255) cTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaaa > 2:539270/1‑141 (MQ=255) cTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACAGTAGAGCCCCACATAATAATGTAGGATGCGTTATACCAGTCACTTGATGCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaaa > 1:469969/1‑141 (MQ=255) ttttGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAAt > 2:479938/1‑141 (MQ=255) ttGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAAttt > 1:104766/1‑141 (MQ=255) ccTTTATAGCGGCCTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCACAAATTTGGGga < 2:289768/141‑1 (MQ=255) ccTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGga < 1:750450/141‑1 (MQ=255) ttATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGagag < 2:257923/141‑1 (MQ=255) cGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggt < 2:107343/141‑1 (MQ=255) ggACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggtg > 1:79620/1‑141 (MQ=255) ttCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTaa > 2:585572/1‑141 (MQ=255) tCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTaaa > 1:381002/1‑141 (MQ=255) gTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCt > 1:395803/1‑141 (MQ=255) tCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAGGTTACATTATAGGCCCAGAGGATAATGTATTATTCTGTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTg < 1:662278/141‑1 (MQ=255) cATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGc < 1:323234/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCAt < 2:433489/140‑1 (MQ=255) aTGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCa > 2:384073/1‑141 (MQ=255) tgtgCATCCGGAGTACGGGTTGAAGGTACTTTAGAGCCCCACATTATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAg < 2:231532/141‑1 (MQ=255) gtgCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGt > 2:301581/1‑141 (MQ=255) tgCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTc < 1:719967/141‑1 (MQ=255) cATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCAt > 1:596133/1‑141 (MQ=255) cATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCAt < 2:325559/141‑1 (MQ=255) ccGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaaa > 2:523007/1‑99 (MQ=255) ccGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCaaa < 1:523007/99‑1 (MQ=255) cGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGc > 2:62403/1‑141 (MQ=255) aaaGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTca > 1:209140/1‑141 (MQ=255) aaGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGCAGTTCCACATAGAACTGATAAAAACTATGCAGTTcgc > 1:424605/1‑139 (MQ=255) ggaCATTAGAACCGCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTCAATCTGCCTACCAGTCATAAAAACTaaaaacctgacatc > 2:28984/3‑129 (MQ=255) tACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCaccacc < 1:467947/141‑1 (MQ=255) cATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCaa < 2:478075/141‑1 (MQ=255) cATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCaa > 2:640663/1‑141 (MQ=255) aTTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAg < 1:539270/141‑1 (MQ=255) tAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCa < 1:61658/141‑1 (MQ=255) agCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGga > 2:56931/1‑80 (MQ=255) agCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGga < 1:56931/80‑1 (MQ=255) agCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTCATTCAAGCACAACTGTTTGCTCTCCCCACATCTGTGGAGAGGCCGGTGGTAAATCTGCATACAAGTCATAAAGACTAAGCCTTTCACCACCAAGCAAAt > 2:503097/1‑141 (MQ=255) agCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTCAGTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAAt > 1:574191/1‑141 (MQ=255) cccACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATtga < 2:54739/141‑1 (MQ=255) ccACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATtgat < 1:581940/141‑1 (MQ=255) aataatGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCg < 2:602408/141‑1 (MQ=255) tGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCAc < 2:487566/141‑1 (MQ=255) tATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACct > 2:135048/1‑141 (MQ=255) atgatgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACctg < 2:730504/141‑1 (MQ=255) atgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAATACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACctgctg > 1:336103/1‑141 (MQ=255) atgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACctgctg > 1:451782/1‑141 (MQ=255) tgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCtgctgc < 2:745443/141‑1 (MQ=255) tgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCtgctgc > 1:431360/1‑141 (MQ=255) gCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCa > 1:720089/1‑141 (MQ=255) ttATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGGGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATaa > 2:283308/1‑141 (MQ=255) ttATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGCGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATaa < 1:589535/141‑1 (MQ=255) ttATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATaa < 1:229628/141‑1 (MQ=255) ataCCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACt > 1:456601/1‑141 (MQ=255) gTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCAt > 2:680803/1‑141 (MQ=255) cACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTg < 1:538820/141‑1 (MQ=255) aCTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGa < 2:765008/141‑1 (MQ=255) tGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACAt < 1:135048/141‑1 (MQ=255) gATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTATGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATc > 2:416763/1‑141 (MQ=255) tCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCt < 2:211927/141‑1 (MQ=255) tCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCt > 2:113439/1‑141 (MQ=255) gatttaccacctgcctctCCACAAATTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGa > 2:84764/15‑141 (MQ=38) caTCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAg > 1:325968/1‑141 (MQ=255) aTCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAgg > 2:46841/1‑141 (MQ=255) cTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtg < 2:230220/141‑1 (MQ=255) cTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtg < 2:706482/141‑1 (MQ=255) tGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtgt > 2:352589/1‑141 (MQ=255) tttGCGCTCCCCAAAGTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTaa < 2:224087/141‑1 (MQ=255) ttGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCAGGatttacacctat < 1:109261/141‑12 (MQ=255) ctctCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATcc > 1:241099/1‑141 (MQ=255) tctcCACAAATTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGCATAGGGGTAAATCCt > 2:71848/1‑141 (MQ=255) ctcCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTg < 2:622624/141‑1 (MQ=255) ctcCACAAGTTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATtgat > 1:307945/1‑82 (MQ=255) ctcCACAAGTTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATtgat < 2:307945/82‑1 (MQ=255) | ATGACTTTTGTACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTG > CP000730/2519802‑2520078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |