| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,575,054 | T→G | 5.5% | A117A (GCA→GCC) | opuBC ← | glycine betaine/L‑proline ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,575,054 | 0 | T | G | 5.5% | 210.5 / 4.2 | 65 | A117A (GCA→GCC) | opuBC | glycine betaine/L‑proline ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/35); new base G (2/2); total (28/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTTTGCTAAATCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTAAAT > CP000730/2574919‑2575193 | cTTTGCTAAATCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGTATTCGTATTCGCAAAACCAAACAAAAAAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTAt < 2:501240/141‑1 (MQ=255) tGCTAAATCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCAt < 1:670341/141‑1 (MQ=255) tCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTTTCTTTTTTTTTCGTTACCATCAATGCATAAGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCANTGCTTTc > 2:588739/1‑141 (MQ=255) aaaCTGTCTCTAAATGATATTTTTTATCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAg > 2:341072/1‑141 (MQ=255) gTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGAttt > 1:602437/1‑141 (MQ=255) gTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGAttt < 2:464870/141‑1 (MQ=255) ggcggggggATGTTTTGTAGCGGTGTGCTTCGTTACCATGAATGCATACGGAGTGGCAAAAGCATACGAAAGAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGAttttt < 2:718842/133‑1 (MQ=255) tctAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTa < 1:319715/141‑1 (MQ=255) aaTGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTg > 1:518165/1‑141 (MQ=255) aTGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCTGTTTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTgg > 1:410087/1‑141 (MQ=255) gATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTg < 2:451175/141‑1 (MQ=255) tatTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGct < 1:289528/141‑1 (MQ=255) gCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCaaa > 1:554745/1‑141 (MQ=255) gCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACAAAAAAAAAAAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCaaa < 2:760298/141‑1 (MQ=255) cGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAg > 2:409369/1‑141 (MQ=255) tCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTccc < 1:17383/141‑1 (MQ=255) cTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGt > 1:784216/1‑141 (MQ=255) cTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTATTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGt < 2:234631/141‑1 (MQ=255) ttCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGtt < 2:137857/141‑1 (MQ=255) tCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTa > 1:721722/1‑141 (MQ=255) tCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTAATCATCCCTTCAAAGCTCCCGTTa > 1:403471/1‑141 (MQ=255) cGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTaa < 2:333639/141‑1 (MQ=255) gTTACCAGGAAAGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGAGTGATTAACTTTCTATTTAAATCCTTGTTGAGTTGCTATAAATGCTATCTGAAGATTTTTCATTGGTACCTCCTTCAAATCTcgcgaaaaa > 2:85672/1‑136 (MQ=255) tACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATc < 2:27396/141‑1 (MQ=255) cATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCtgt > 1:236484/1‑141 (MQ=255) aTGAATGCATATGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATACTTGTTGTGTTGATATCATTGTTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCtgtg > 1:508836/1‑141 (MQ=255) aTGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCtgtg < 2:61126/141‑1 (MQ=255) tGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTGGCTATCATTGCTTTCTTAGGATCTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGc < 2:643815/141‑1 (MQ=255) aTGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCAt < 1:459606/141‑1 (MQ=255) aTGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCAt > 1:107067/1‑141 (MQ=255) aTGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCAt > 1:331678/1‑141 (MQ=255) tGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCAtt < 1:234209/141‑1 (MQ=255) gCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTatcatttaaagcaga > 1:489176/1‑127 (MQ=255) aTACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTTTGGCTATCATTGCGTTGTTAGGAGTGTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATtata > 1:353879/1‑141 (MQ=255) cGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCGCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCt < 2:688440/141‑1 (MQ=255) gTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTa < 2:82602/141‑1 (MQ=255) tCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAacac < 2:640687/141‑1 (MQ=255) tCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAacac < 2:292465/141‑1 (MQ=255) cGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACAcc > 1:262385/1‑141 (MQ=255) gCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCt > 2:635169/1‑141 (MQ=255) aCCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTTATTGTTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGatat > 2:348384/1‑141 (MQ=255) aCCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATcaggtgttagatat < 2:154948/141‑14 (MQ=255) aCCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGatat > 1:24118/1‑141 (MQ=255) ccATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGatata > 2:658549/1‑141 (MQ=255) cGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGc < 1:419245/141‑1 (MQ=255) cGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGc < 1:371571/141‑1 (MQ=255) aaTCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCAt < 1:626182/141‑1 (MQ=255) aTCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTGAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATc > 2:706100/1‑141 (MQ=255) aaaaaaCGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATcccc > 2:186933/1‑141 (MQ=255) aaaaaaCGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATcccc > 1:238377/1‑141 (MQ=255) cGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCattaat < 2:26270/141‑1 (MQ=255) ttGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTGGCTATCATTGCTTTCTTAGGATCTTTAATTGGTGct < 2:358061/70‑1 (MQ=255) ttGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTGGCTATCATTGCTTTCTTAGGATCTTTAATTGGTGct > 1:358061/1‑70 (MQ=255) tGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAg < 2:523838/141‑1 (MQ=255) tGATCAAATTTCTTTTTAAATACTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAg > 1:542682/1‑141 (MQ=255) gATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAgg < 2:465022/141‑1 (MQ=255) gATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAgg < 1:341072/141‑1 (MQ=255) gATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAgg < 1:635169/141‑1 (MQ=255) aTCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGc < 2:784216/141‑1 (MQ=255) ttCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGt < 1:146439/141‑1 (MQ=255) tCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGtt < 1:222374/141‑1 (MQ=255) ttttAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGaa < 1:702819/141‑1 (MQ=255) tttAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAAt > 2:781236/1‑141 (MQ=255) tttAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAAt < 1:66684/141‑1 (MQ=255) aaaTCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGt < 1:135788/141‑1 (MQ=255) ttgtgttgCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGAccc > 1:279696/1‑141 (MQ=255) ttgtgttgCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCGCCCGTTCAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGAccc < 2:780914/141‑1 (MQ=255) gtgttgCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTa < 2:761976/141‑1 (MQ=255) tgttgCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTaa > 2:311166/1‑141 (MQ=255) ttgCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTAAat < 1:268332/141‑1 (MQ=255) | CTTTGCTAAATCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCGGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTTGCTATCATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTGCCATTATATCTAACACCTGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTAAAT > CP000730/2574919‑2575193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |