| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 79,449 | T→G | 5.1% | intergenic (+58/‑202) | USA300HOU_0076 → / → USA300HOU_0077 | transposase/possible S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 79,449 | 0 | T | G | 5.1% | 246.3 / 5.8 | 78 | intergenic (+58/‑202) | USA300HOU_0076/USA300HOU_0077 | transposase/possible S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/39); new base G (2/2); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
CTTGTATAAATCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGCATAAATG > CP000730/79309‑79588 | cTTGTATAAATCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGtt > 1:462953/1‑141 (MQ=255)cTTGTATAAATCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGtt > 1:697830/1‑141 (MQ=255) gTATAAATCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAg < 1:463089/141‑1 (MQ=255) tCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTa > 2:54233/1‑141 (MQ=255) cGATTATTAAAAACGATTCATTAGCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTaa < 1:338333/141‑1 (MQ=255) attaAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCtt < 1:91217/141‑1 (MQ=255) aaaaaCGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTAtt < 1:566316/141‑1 (MQ=255) aCGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTaa > 2:491916/1‑141 (MQ=255) cGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAAt > 1:490549/1‑141 (MQ=255) gATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAAtt > 2:690945/1‑141 (MQ=255) gATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAAtt < 1:261871/141‑1 (MQ=255) aTTCATTATCTGGTACTGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTAATCAAAAAAATAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATta > 1:310150/1‑141 (MQ=255) ttCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATtat > 2:351204/1‑141 (MQ=255) ttCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGATTATTTTAATtat > 2:328423/1‑141 (MQ=255) tcattaccagatAATGAATCGTAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTGTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATtata > 2:132042/12‑141 (MQ=255) tcattaccagatAATGAATCGTAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTGTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATtata > 2:366900/12‑141 (MQ=255) cATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATaa > 1:283907/1‑141 (MQ=255) aTTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAg > 2:202538/1‑141 (MQ=255) accagatAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGTTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTaa > 2:369660/7‑140 (MQ=255) tCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACt > 1:654010/1‑141 (MQ=255) cTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACtt > 1:749959/1‑141 (MQ=255) cTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACtt > 1:276097/1‑141 (MQ=255) tGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTg > 2:84295/1‑141 (MQ=255) ggTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCAAATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGa < 1:613749/141‑1 (MQ=255) gTAGTGAATCAGAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACACTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGAc < 1:620472/141‑1 (MQ=255) gTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGAc < 1:126319/141‑1 (MQ=255) gTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGAc < 1:708240/141‑1 (MQ=255) aaTGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTa > 1:503435/1‑141 (MQ=255) aTCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGt > 2:86669/1‑141 (MQ=255) aTCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGt < 2:595203/141‑1 (MQ=255) aTAAATTGTACGATTCACACTTTTTACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTaag < 1:206362/141‑1 (MQ=255) aaaTTGTACGATTATCAGTTGGCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTaagaa < 1:6664/141‑1 (MQ=255) aaaTTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTaagaa < 1:181503/141‑1 (MQ=255) aaTTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTaagaaa < 2:406106/141‑1 (MQ=255) aTTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTaagaaag < 1:56260/141‑1 (MQ=255) gTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGCCTAATCGTAAGAAAGAGc > 2:110665/1‑141 (MQ=255) gTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGc > 2:267535/1‑141 (MQ=255) gTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATAAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGc > 2:110733/1‑141 (MQ=255) aTTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAgg < 1:58131/141‑1 (MQ=255) tATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGAc < 1:779370/141‑1 (MQ=255) tATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGAc > 2:480288/1‑141 (MQ=255) tATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGAc < 2:506237/141‑1 (MQ=255) aTCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACa < 2:258430/141‑1 (MQ=255) tCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACAt > 1:307474/1‑141 (MQ=255) aTGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAAt > 1:364338/1‑141 (MQ=255) aTGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAAt > 1:39365/1‑141 (MQ=255) gTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTGTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCa < 1:366900/141‑1 (MQ=255) gTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTGTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCa < 1:132042/141‑1 (MQ=255) accacATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATg > 2:716899/1‑141 (MQ=255) accacATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATg > 1:465437/1‑141 (MQ=255) ccacATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGt > 2:144460/1‑141 (MQ=255) ccAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGAcc > 1:120901/1‑141 (MQ=255) cAAACGTACAATTAAATATATTATAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACca > 1:184144/1‑141 (MQ=255) gTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCt < 1:286953/141‑1 (MQ=255) cAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTaa < 1:218689/141‑1 (MQ=255) aaTTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAAt < 1:701277/141‑1 (MQ=255) aaTTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAAt < 2:724643/141‑1 (MQ=255) aaTTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAAt < 2:724688/141‑1 (MQ=255) aTTAAATATATTTTAGTACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAAtt < 1:348991/141‑1 (MQ=255) atTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGtt < 2:452944/141‑1 (MQ=255) ttttAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGttc < 2:699340/141‑1 (MQ=255) ttAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGttcat < 1:229443/141‑1 (MQ=255) aaTACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGttcattc > 2:669633/1‑141 (MQ=255) aaTACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGttcattc < 2:211272/141‑1 (MQ=255) aCCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATg < 2:653201/141‑1 (MQ=255) cTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGAc < 1:755365/141‑1 (MQ=255) cTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGAc < 1:375893/141‑1 (MQ=255) ttATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACt < 1:730383/141‑1 (MQ=255) tATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACtt < 2:384608/141‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTaaaaa > 2:305967/1‑141 (MQ=255) aaaaTTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTaaaaaa < 1:411475/141‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAAt > 2:11852/1‑141 (MQ=255) tAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCtt < 1:742741/141‑1 (MQ=255) aaaTGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTAt < 1:64223/141‑1 (MQ=255) aaaTGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTAt > 1:748701/1‑141 (MQ=255) aaaTGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTAt > 1:246803/1‑141 (MQ=255) aaTGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTAtt > 1:534657/1‑141 (MQ=255) tGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGc < 1:480288/141‑1 (MQ=255) aaCGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGCAt > 1:58361/1‑141 (MQ=255) gTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGCATAAAt < 1:144460/141‑1 (MQ=255) tttAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGCATAAATg < 2:62406/141‑1 (MQ=255) | CTTGTATAAATCGATTATTAAAAACGATTCATTATCTGGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATATTTTAATACCTTATTCAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAAGAAAGAGCCTAGGACATAAATCAATGTCTCGCGACCACAGCTTAATTTTTGGTGTTCATTCATGACTTTAAAAAATCCTTATTGCATAAATG > CP000730/79309‑79588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |