Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA CP000730 536,926 C→A 6.0% intergenic (+119/‑192) rplY → / → pth ribosomal protein L25/aminoacyl‑tRNA hydrolase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730536,9260CA 6.0% 225.2 / 3.2 67intergenic (+119/‑192)rplY/pthribosomal protein L25/aminoacyl‑tRNA hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (31/32);  new base A (2/2);  total (33/34)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01

CGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGATGGCAATGGCGGAAAATG  >  CP000730/536786‑537065
                                                                                                                                            |                                                                                                                                           
cGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTAc                                                                                                                                             >  1:742620/1‑141 (MQ=255)
        aaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGttt                                                                                                                                     <  2:639210/141‑1 (MQ=255)
        aaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGttt                                                                                                                                     <  1:486158/141‑1 (MQ=255)
          aCTGAAGATTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTAGACTTTGTCTAGCAAGAACTGTGCTTATATTAATATAAGCATGGTGCTGTTTGTGTTATTATAAAGATTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa                                                                                                                                   <  2:281225/141‑1 (MQ=255)
          aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa                                                                                                                                   >  1:193002/1‑141 (MQ=255)
          aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa                                                                                                                                   >  1:12291/1‑141 (MQ=255)
          aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa                                                                                                                                   <  2:682239/141‑1 (MQ=255)
           cTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaat                                                                                                                                  <  1:528686/141‑1 (MQ=255)
           cTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTAGTACAAAGTAATAAAGTttaat                                                                                                                                  <  2:452293/141‑1 (MQ=38)
              aaGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaattaa                                                                                                                               <  1:438466/141‑1 (MQ=255)
              aaGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaattaa                                                                                                                               <  1:769746/141‑1 (MQ=255)
                gagTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTaattaatt                                                                                                                             >  1:652896/1‑141 (MQ=255)
                    aaTTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAg                                                                                                                         >  2:550838/1‑141 (MQ=255)
                    aaTTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAg                                                                                                                         <  2:489042/141‑1 (MQ=255)
                     aTTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGGGCTTTTTGTTTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGt                                                                                                                        >  1:744622/1‑141 (MQ=255)
                         tAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGt                                                                                                                    >  1:232575/1‑141 (MQ=255)
                             cTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTaaaa                                                                                                                <  1:308001/141‑1 (MQ=255)
                               gTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGa                                                                                                              <  1:285623/141‑1 (MQ=255)
                               gTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGa                                                                                                              <  2:454779/141‑1 (MQ=255)
                                ttACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGAc                                                                                                             >  2:557105/1‑141 (MQ=255)
                                      tAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTaaa                                                                                                       <  1:43609/141‑1 (MQ=255)
                                       aaaGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAAc                                                                                                      >  2:402656/1‑141 (MQ=255)
                                           tttttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTcaa                                                                                                  >  1:448162/1‑141 (MQ=255)
                                             tttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTcaaca                                                                                                >  2:124829/1‑141 (MQ=255)
                                             tttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTcaaca                                                                                                <  2:17937/141‑1 (MQ=255)
                                               tataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAAt                                                                                              >  2:96579/1‑141 (MQ=255)
                                               tataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAAt                                                                                              >  2:726241/1‑141 (MQ=255)
                                                ataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATg                                                                                             >  1:19879/1‑141 (MQ=255)
                                                  aCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGAt                                                                                           <  2:535072/141‑1 (MQ=255)
                                                   cTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATa                                                                                          >  1:429182/1‑141 (MQ=255)
                                                     ttGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATAca                                                                                        >  1:557412/1‑141 (MQ=255)
                                                          tAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATa                                                                                   <  2:19628/141‑1 (MQ=255)
                                                             cAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATaaaa                                                                                >  2:531020/1‑141 (MQ=255)
                                                                  accatgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAAtttt                                                                           >  2:159913/5‑141 (MQ=255)
                                                                      tgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATg                                                                       <  1:62720/141‑1 (MQ=255)
                                                                      tgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGCACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATg                                                                       <  2:293053/141‑1 (MQ=255)
                                                                            ttttAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTTTTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCg                                                                 >  2:465701/1‑141 (MQ=255)
                                                                              ttAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGAt                                                               >  1:44253/1‑141 (MQ=255)
                                                                              ttAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGAt                                                               >  2:669445/1‑141 (MQ=255)
                                                                              ttAATATAAGCATGGTGCTGTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGAt                                                               <  1:205321/141‑1 (MQ=255)
                                                                                 atatAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGAtttt                                                            <  1:531020/141‑1 (MQ=255)
                                                                                  tataAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTa                                                           >  2:536375/1‑141 (MQ=255)
                                                                                     aaGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTaaaa                                                        <  1:467771/141‑1 (MQ=255)
                                                                                     aaGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTaaaa                                                        >  1:704784/1‑141 (MQ=255)
                                                                                      aGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAat                                                       <  2:237434/141‑1 (MQ=255)
                                                                                       gCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAata                                                      >  1:197495/1‑141 (MQ=255)
                                                                                        cATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAatac                                                     <  1:508127/141‑1 (MQ=255)
                                                                                        cATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAatac                                                     <  2:671423/141‑1 (MQ=255)
                                                                                         aTGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAataca                                                    >  1:59950/1‑141 (MQ=255)
                                                                                            gTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAatacatac                                                 >  2:719778/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                tttttGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTTGATTTTAAAATACAtacttac                                             <  1:262956/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                tttttGTGTTATTATAAAGCTCAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACAtacttac                                             >  1:332057/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                      tttactcactaaaattaattaaACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCt                                       <  1:495243/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                           ttatAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGa                                  >  1:104951/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                             ataAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGaat                                <  2:90445/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                             actaaaattaattaaACTTTAGTACAAAGTAATAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGaat                                <  1:56217/134‑1 (MQ=37)
                                                                                                              taAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGaata                               >  2:397956/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                              taAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGaata                               <  1:402656/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                               aaaGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGaataa                              >  2:276197/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                  gCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGa                           <  1:324240/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                  gCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGa                           <  1:588230/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                      aattaaACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTACTTTTAGTGACTAAAAGGCATTAAACATAACAATGATACATCATACAAATTCTAATGTACTCGACTTCAACATACATACTCACTAAGCTTGAGAATAATGATAAt                       >  2:518371/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                      aattaaACTTTAGTACAAAGTAATAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAAt                       >  1:100464/1‑141 (MQ=39)
                                                                                                                        ttaaACTTTAGTACAAAGTAATAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTg                     >  2:408824/1‑141 (MQ=39)
                                                                                                                          aaaCTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGAt                   <  2:526450/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                    aCTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGATGGCAATGGCg         <  2:643980/141‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                           aCTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGATATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGATGGCAATGGCGGAAAAta  <  2:316022/141‑2 (MQ=255)
                                                                                                                                           aCTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGATGGCAATGGCGGAAAATg  >  1:288086/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                            |                                                                                                                                           
CGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTAAAAGACATTAAACTCAACAATGATACATCATAAAAATTTTAATGTACTCGATTTTAAAATACATACTTACTAAGCTAAAGAATAATGATAATTGATGGCAATGGCGGAAAATG  >  CP000730/536786‑537065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑