| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 798,594 | T→C | 5.8% | L181L (TTA→CTA) | recQ → | possible glycine betaine/carnitine/choline ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 798,594 | 0 | T | C | 5.8% | 214.4 / 3.5 | 69 | L181L (TTA→CTA) | recQ | possible glycine betaine/carnitine/choline ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/30); new base C (2/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
AATGCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCGCTATTCC > CP000730/798455‑798733 | aaTGCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGAtatt < 2:450867/141‑1 (MQ=255) aTGCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGAtatta > 2:348338/1‑141 (MQ=255) gCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATattatt > 2:592311/1‑141 (MQ=255) ccTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATAttatta > 1:650189/1‑141 (MQ=255) tGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAgg > 2:308477/1‑141 (MQ=255) ttATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTg > 1:736876/1‑141 (MQ=255) aTGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAAtt < 2:97195/141‑1 (MQ=255) tGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTc > 1:742237/1‑141 (MQ=255) cTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCcag > 1:660585/1‑141 (MQ=255) tGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCcagc < 1:711109/141‑1 (MQ=255) ggTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCcagca > 2:450767/1‑141 (MQ=255) tgtAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAAGACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCagcagc > 1:415440/1‑141 (MQ=255) aaCGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTAtt > 1:529354/1‑141 (MQ=255) aaCGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTAtt < 1:783326/141‑1 (MQ=255) aaCGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTAtt > 2:156696/1‑141 (MQ=255) tATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAAt > 1:505581/1‑141 (MQ=255) tATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAAt < 2:469968/141‑1 (MQ=255) tGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATta > 1:430078/1‑141 (MQ=255) attaattaTAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATAtt < 1:666665/141‑1 (MQ=255) ttaattaTAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATAttt > 2:739496/1‑141 (MQ=255) ttaattaTAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATAttt < 1:530524/141‑1 (MQ=255) ttaattaTAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATAttt < 2:638835/141‑1 (MQ=255) ataGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATACTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTa > 1:614482/1‑141 (MQ=255) ataGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATACTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTa > 1:614404/1‑141 (MQ=255) taGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTaa < 2:531554/141‑1 (MQ=255) cAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTaa < 2:266420/141‑1 (MQ=255) aaCACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGAtt < 1:161526/141‑1 (MQ=255) cacTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTTTATTTGATTTAATTTTAATATTTa > 2:148576/1‑141 (MQ=255) cacTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTa > 2:730102/1‑141 (MQ=255) cacTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTa > 2:713993/1‑141 (MQ=255) cTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATg > 2:474134/1‑141 (MQ=255) gcagcaTTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCt > 1:33379/1‑141 (MQ=255) aaTTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATc < 1:739496/141‑1 (MQ=255) aTTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCt < 1:132584/141‑1 (MQ=255) aTTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCt < 1:140202/141‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTta < 1:350888/141‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTta < 1:530466/141‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTta < 1:530510/141‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTtat > 1:89702/1‑141 (MQ=255) tGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATaa < 1:706368/141‑1 (MQ=255) aGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATaaaaa > 2:283437/1‑141 (MQ=255) ggCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAg > 2:149137/1‑141 (MQ=255) cGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGtt < 1:550602/141‑1 (MQ=255) cGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATACTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGtt < 2:614404/141‑1 (MQ=255) cGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATACTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATAAAATTATAAAAAGtt < 2:614482/141‑1 (MQ=255) gACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTAt > 2:759981/1‑141 (MQ=255) aCTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTAtt > 1:733508/1‑141 (MQ=255) aCTAGGAGATTTAATTTTATTACGTATAGACCGTAAGAATGCATCGTTGATATGATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTAtt < 1:350658/141‑1 (MQ=255) cTAGGAGATTTAATTTTAGTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATtg > 2:359947/1‑141 (MQ=255) gagaTTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATtgatga < 2:604858/141‑1 (MQ=255) ttttATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGgtg > 2:769285/1‑141 (MQ=255) tttATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGgtgt < 2:164779/141‑1 (MQ=255) ttaGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTtata > 1:720852/1‑141 (MQ=255) taGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAg < 1:770538/141‑1 (MQ=255) aGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGt < 2:450420/141‑1 (MQ=255) aGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGt < 1:713993/141‑1 (MQ=255) taGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGtgatga < 1:428854/141‑1 (MQ=255) aCCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGatta > 2:671387/1‑141 (MQ=255) ccGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGattat < 2:367816/141‑1 (MQ=255) gTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTTCAATTCCGGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGAttatta > 2:234494/1‑141 (MQ=255) gTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGTCGTTGGGGGTTATAGTGATGattattt > 1:71768/1‑140 (MQ=255) gTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGATATTGATGACGTTAGGTGTAAGAGTTATGagtatgg > 1:71764/1‑139 (MQ=255) tAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATtattat < 1:81986/141‑1 (MQ=255) tAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATtattat > 2:675943/1‑141 (MQ=255) aaCAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATtata > 2:505274/1‑141 (MQ=255) tGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGc < 2:334387/141‑1 (MQ=255) gCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCt > 2:770217/1‑141 (MQ=255) gCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCt > 2:392871/1‑141 (MQ=255) cATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTa < 2:102864/141‑1 (MQ=255) tCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATc > 1:340693/1‑141 (MQ=255) cGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCg > 2:270724/1‑141 (MQ=255) tGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCGCTa > 1:308436/1‑141 (MQ=255) tGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCGCTa < 2:323793/141‑1 (MQ=255) attattAGGTGCAATTNCAGCAGCCTTATNGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCGCTATTcc > 1:752575/1‑141 (MQ=255) | AATGCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCGTTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTATCTTATAAAAAGTTATTGATGACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCTATCGCTATTCC > CP000730/798455‑798733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |