| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 927,909 | G→A | 7.0% | intergenic (+129/‑128) | gyaR → / → USA300HOU_0891 | dehydrogenase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 927,909 | 0 | G | A | 7.0% | 213.7 / 3.4 | 68 | intergenic (+129/‑128) | gyaR/USA300HOU_0891 | dehydrogenase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/37); new base A (2/3); total (28/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
TAAATTGAAAATAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAACCAATT > CP000730/927773‑928049 | tAAATTGAAAATAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCATCACATTAATAtgac < 1:145933/141‑2 (MQ=255) ttGAAAATAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGt > 1:5622/1‑141 (MQ=255) gAAAATAAGTATGGTTGTGAATGATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATTATTCAGTATCAGTATATACTCGTCATGTTAATGTGATGGGttt < 2:194840/141‑1 (MQ=255) aaaaTAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCATCACATTAATATGACGAGTTTa < 2:317772/141‑1 (MQ=255) aaaTAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTAt > 2:535270/1‑141 (MQ=255) aaTAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTAtt < 2:353416/141‑1 (MQ=255) aTAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTAttt < 1:369395/141‑1 (MQ=255) tAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTg < 2:216951/141‑1 (MQ=255) aaGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCATCACATTAATATGACGAGTTTAtaatg < 2:314131/141‑5 (MQ=38) gTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGTAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGAATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATATGATGAGTTAATTTGaat > 2:217558/1‑139 (MQ=255) tATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGAttt < 1:731670/141‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAAc < 2:274991/141‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAAc < 1:177581/141‑1 (MQ=255) cATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAAc < 1:568332/141‑1 (MQ=255) ttGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACaa < 1:238590/141‑1 (MQ=255) tAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAAtt > 2:246050/1‑141 (MQ=255) aaaaCAAGCAAAGCCATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACaattttg < 1:205649/141‑6 (MQ=255) agcaaagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTtatat > 2:374674/1‑141 (MQ=255) agcaaagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTtatat > 2:502792/1‑141 (MQ=255) gcaaagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTtatata > 1:523213/1‑141 (MQ=255) caaagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAg < 1:345437/141‑1 (MQ=255) caaagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAg < 1:90627/141‑1 (MQ=255) aagcaaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGAc > 2:370719/1‑141 (MQ=255) agcaaTTGCCAAATATGTCCTCCGTGCCTCGCTAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACCCGTCATCTTAATGTCACTAGCTTACCTGATTTCGACGTATCTAACCAAATTGTTATATAGACt < 2:74708/141‑1 (MQ=255) gcaaTTGTTAAATATGTTAGGGTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAATCTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTg < 2:219761/141‑1 (MQ=255) aaTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTa > 1:391756/1‑141 (MQ=255) aTTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTaa < 2:457413/141‑1 (MQ=255) aTTGTTAAATATGTTACGCTTGACTTGCGAAGGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTaa < 1:291879/141‑1 (MQ=255) ttGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAat > 1:120663/1‑141 (MQ=255) tGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAatt < 2:632280/141‑1 (MQ=255) tGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAatt > 1:411211/1‑141 (MQ=255) ttAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAattgt > 1:479451/1‑141 (MQ=255) atGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAattgtttattg < 2:329009/141‑1 (MQ=255) ggtctGCTTGCCTTGCGAATGTATATATGTGCGGTGATGATAATGCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAattgtttattgtt < 2:471827/137‑1 (MQ=255) aTGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTaa < 2:197366/141‑1 (MQ=255) cTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATGATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATa < 1:162640/141‑1 (MQ=255) cTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATa > 1:212598/1‑141 (MQ=255) aCTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCt > 1:672271/1‑141 (MQ=255) cTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCtt < 2:368332/141‑1 (MQ=255) cTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCtt < 2:368398/141‑1 (MQ=255) gCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTaa > 1:458272/1‑141 (MQ=255) gAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTaaaa > 1:5312/1‑141 (MQ=255) aTGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAaatg < 1:591482/141‑1 (MQ=255) tatataTTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAaatgaat > 2:756320/1‑141 (MQ=255) tatataTTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGACTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAaatgaat > 1:737687/1‑141 (MQ=255) tatatTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAatgaatga < 2:592672/141‑1 (MQ=255) atTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATGACCTTTAAAATGAATGATGt < 2:720957/141‑1 (MQ=255) tttGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGtt > 1:199437/1‑141 (MQ=255) ttGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTtc < 1:764819/141‑1 (MQ=255) gcgcTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTtctc < 1:391541/141‑1 (MQ=255) cgcTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTca < 2:120663/141‑1 (MQ=255) gcTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTcaa < 1:330074/141‑1 (MQ=255) cAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCAt > 2:408328/1‑141 (MQ=255) aTAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCAttt > 2:119747/1‑141 (MQ=255) tAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTa > 2:714189/1‑141 (MQ=255) caaacattaAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTAc < 1:79160/134‑1 (MQ=255) aCATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTCTTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACACAGTGTATCATTTACa > 2:130793/1‑141 (MQ=255) aCATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACa > 1:351579/1‑141 (MQ=255) cATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATATGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACaa < 2:225509/141‑1 (MQ=255) ataAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACaataat < 2:148205/141‑1 (MQ=255) ataAACTCATCACATTAATATGACGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACaataat > 2:367589/1‑141 (MQ=255) tCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGtg > 2:604627/1‑141 (MQ=255) cGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGtga > 2:373221/1‑141 (MQ=255) gTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGtgat < 2:523213/141‑1 (MQ=255) tCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGtgatg < 1:346733/141‑1 (MQ=255) cATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGtgatga > 1:321743/1‑141 (MQ=255) tatTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACa < 2:733060/141‑1 (MQ=255) tAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAAcc < 1:253508/141‑1 (MQ=255) tgtgATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAACCAAt < 1:342180/141‑1 (MQ=255) tgtgATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAACCAAt < 1:342144/141‑1 (MQ=255) gtgATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAACCAAtt > 2:692953/1‑141 (MQ=255) | TAAATTGAAAATAAGTATGGTTTTTAATCATTGGTAAAACAAGCAAAGCAATTGTTAAATATGTTATGCTTGACTTGCGAATGTATATATTTGCGCTGATGATAATTCAATAACATTATAAACTCGTCATATTAATGTGATGAGTTTATTTGATTTTGACGTATATAACAAAATTGTTATATAGACTGTAATTGTTTATTGTTTAAATAACCTTTAAAATGAATGATGTTCTCAACAAAGTGTATCATTTACAATAATTGAGTGATGACAACCAATT > CP000730/927773‑928049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |