| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,166,794 | T→C | 6.0% | F139F (TTT→TTC) | USA300HOU_1093 → | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,166,794 | 0 | T | C | 6.0% | 207.6 / 2.9 | 67 | F139F (TTT→TTC) | USA300HOU_1093 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/34); new base C (2/2); total (31/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
ATGTCGATTTGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTCAAATGGTGTCTTT > CP000730/1166658‑1166932 | aTGTCGATTTGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACg > 1:235627/1‑141 (MQ=255) tCGATTTGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACgtgt > 1:139223/1‑141 (MQ=255) tCGATTTGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACgtgt < 2:504337/141‑1 (MQ=255) ttGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAAt < 2:283740/141‑1 (MQ=255) tGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAAAGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAAtt < 2:183374/141‑1 (MQ=255) cAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGa > 2:413813/1‑141 (MQ=255) cAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGa > 2:177578/1‑141 (MQ=255) agagGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGaa > 1:241882/1‑141 (MQ=255) tGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGt < 2:538076/141‑1 (MQ=255) ttttAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATG‑AAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCt < 1:332873/141‑1 (MQ=255) ttAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTCGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTa > 1:702821/1‑141 (MQ=255) ttAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTCGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTa > 1:702795/1‑141 (MQ=255) agagCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTAcc < 2:563828/141‑1 (MQ=255) gagCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCa < 2:185625/141‑1 (MQ=255) gagCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCa > 1:123689/1‑141 (MQ=255) agCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCGATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCaa > 2:98323/1‑141 (MQ=255) aTTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGt > 1:80582/1‑141 (MQ=255) aTTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATc < 1:470243/141‑1 (MQ=255) aTGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAg > 2:425603/1‑141 (MQ=255) ttAGTTTACTTTGCGATCTATCACGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTc < 2:354539/141‑1 (MQ=255) aGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTCAATGACAAAATCGACATTACTGATATAACTCTCGACACTTTCCAACCCGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcac < 1:664512/141‑1 (MQ=255) aGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcac < 1:754868/141‑1 (MQ=255) aGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcac < 1:656497/141‑1 (MQ=255) aGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcac < 2:490811/141‑1 (MQ=255) aGTTTACTTTGCGATCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcac < 2:757407/141‑1 (MQ=255) gTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTcaca > 2:192601/1‑141 (MQ=255) gCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAAc < 1:413813/141‑1 (MQ=255) cGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACt > 1:232076/1‑141 (MQ=255) cGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACt > 1:350635/1‑141 (MQ=255) cGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACt > 1:109836/1‑141 (MQ=255) aTCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACtat < 1:97932/141‑1 (MQ=255) cTATCAAGCAGAAAAAAAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAg < 2:76663/141‑1 (MQ=255) aTCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGaa < 1:249646/141‑1 (MQ=255) aaaTGCAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTAAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTa > 2:307226/1‑141 (MQ=255) aaaTGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTa > 2:51639/1‑141 (MQ=255) tGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACaa < 1:37506/141‑1 (MQ=255) tGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACaa > 1:302727/1‑141 (MQ=255) tGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACaa < 1:92799/141‑1 (MQ=255) gAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACaaa < 2:39878/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTACTCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAAt < 1:303979/141‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAAt > 1:659345/1‑141 (MQ=255) aaaaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACTTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATATAATGAGAAGTTACAAATa > 2:190353/1‑141 (MQ=255) aaaaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATa < 2:721193/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGGACATTAATGATATTAATAGCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTGAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTAGAAATa > 1:509585/1‑141 (MQ=255) aaaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATaa > 1:476153/1‑141 (MQ=255) aaaTGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATaaa < 1:549900/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCt < 2:401308/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCt < 1:84343/141‑1 (MQ=255) gACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTa < 2:581893/141‑1 (MQ=255) gACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTa > 1:591131/1‑141 (MQ=255) cATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATg < 1:420020/141‑1 (MQ=255) cATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATg > 2:186123/1‑141 (MQ=255) aTTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATga < 2:147432/141‑1 (MQ=255) gATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATtat > 2:352167/1‑141 (MQ=255) gATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATACTACCAACGTTAATCATTAGCTGGCTCACAACATTTCACGCTAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATtat > 1:272170/1‑141 (MQ=255) atcatTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATtat > 2:177494/4‑141 (MQ=255) atatTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTCGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATtata < 2:702795/141‑1 (MQ=255) atatTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTCGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATtata < 2:702821/141‑1 (MQ=255) atTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATAcc > 1:368279/1‑141 (MQ=255) ttAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCt < 1:450832/141‑1 (MQ=255) tatCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAg > 1:485155/1‑141 (MQ=255) ggctaccttgttacTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAAc < 1:321734/128‑1 (MQ=255) tCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACAtt > 2:601069/1‑141 (MQ=255) cTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCatttgaatgttg < 1:371400/141‑12 (MQ=255) cTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCatttgaatgttg < 1:371216/141‑12 (MQ=255) gTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAAGGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTAAAATGgt > 2:305573/1‑141 (MQ=255) tCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTCAAATGgtg < 1:620950/141‑1 (MQ=255) ttttttGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTCAAATGGTGTc < 1:138243/141‑1 (MQ=255) tttGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTCAAATGGTGTCttt < 1:195426/141‑1 (MQ=255) | ATGTCGATTTGACAGAGGTTGTCGTTTTAGAGCATTTAATTCAATGGTTCTTAGTTTACTTTGCGATCTATCAAGCAGTAAATGAAAAAATGGACATTAATGATATTAATATCGACAATTTCCAATCTGTCTTTTTTGACGTGTCTAATTTGAATTTAGTAATTCTACCAACGTTAATCATTAGCTGGGTCACAATATTTAACTATAGAATGAGAAGTTACAAATAAAATCTATGAGATTATACCTTCAGACACCAACATTCAAATGGTGTCTTT > CP000730/1166658‑1166932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |