| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,799,877 | T→A | 7.6% | G91G (GGA→GGT) | icd ← | isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,799,877 | 0 | T | A | 7.6% | 242.4 / 8.9 | 79 | G91G (GGA→GGT) | icd | isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/36); new base A (4/2); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
CAACATCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTTCTCAA > CP000730/1799738‑1800016 | cAACATCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTCATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTc > 2:167139/1‑141 (MQ=255)cAACATCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTc > 1:19910/1‑141 (MQ=255)cAACATCTTGTGGACGTTTAACAGGGGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCATGGAAATAAATCTAATTCTTGGCCGAAAGCCACATTTAATGATCTAATAACACAACTAATTGGTGTTATTAAAGGtt > 2:208915/1‑140 (MQ=255) cATCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCtt > 2:161402/1‑141 (MQ=255) aTCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAAAACAACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCttt < 2:234469/141‑1 (MQ=255) tCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTa > 2:32123/1‑141 (MQ=255) tCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAAGCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTa > 1:33032/1‑141 (MQ=255) cTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGCTGTTAAAGGACCTTTaa < 2:80957/141‑1 (MQ=255) tgGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGc < 1:688903/141‑1 (MQ=255) gTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTa > 1:334298/1‑141 (MQ=255) gTTGAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGTTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTAGTATTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTa < 2:493284/141‑1 (MQ=255) tttAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTaa > 1:490558/1‑141 (MQ=255) aaCAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCGATTAAata > 1:647768/1‑141 (MQ=255) aaCAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAata > 1:71307/1‑141 (MQ=255) aCAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAatat < 1:408660/141‑1 (MQ=255) cAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATAtt > 2:633712/1‑141 (MQ=255) cAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATAtt > 1:444487/1‑141 (MQ=255) tGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCttt > 2:481711/1‑141 (MQ=255) tGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAAt > 2:660297/1‑141 (MQ=255) tGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAAt < 1:435125/141‑1 (MQ=255) tACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGt < 2:463516/141‑1 (MQ=255) aCTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTa > 2:395115/1‑141 (MQ=255) tCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATc < 2:107982/141‑1 (MQ=255) tAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAgtg > 1:260044/1‑141 (MQ=255) tAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAACCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAgtg < 1:20373/141‑1 (MQ=255) ccAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTc < 1:558301/141‑1 (MQ=255) ccAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTc > 2:402799/1‑141 (MQ=255) ccAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATGAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTc > 1:50108/1‑141 (MQ=255) ccAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAAGTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTc < 2:448405/141‑1 (MQ=255) cAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCt < 2:547310/141‑1 (MQ=255) aaCGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCtt > 2:454405/1‑141 (MQ=255) aaCGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCtt > 2:316300/1‑141 (MQ=255) ggTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAAc > 2:604761/1‑141 (MQ=255) tCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCa > 1:57995/1‑141 (MQ=255) aaGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGACCtt < 1:477112/85‑1 (MQ=255) aaGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGACCtt > 2:477112/1‑85 (MQ=255) aGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCAc > 2:731935/1‑141 (MQ=255) cAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACAATTAACCa > 1:199884/1‑141 (MQ=255) taaataaaTCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTg < 2:345083/141‑1 (MQ=255) aaataaatCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGt < 1:275183/141‑1 (MQ=255) aatCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCaa < 1:638609/141‑1 (MQ=255) aatCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCaa < 1:465787/141‑1 (MQ=255) tCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAAt > 2:565086/1‑141 (MQ=255) tCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAAt < 1:222432/141‑1 (MQ=255) tCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAACACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAAt > 1:566399/1‑141 (MQ=255) aaTTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCt > 2:781095/1‑141 (MQ=255) ttCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCttt < 2:294597/141‑1 (MQ=255) tCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCtttt < 1:108820/141‑1 (MQ=255) tCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCtttt < 1:167106/141‑1 (MQ=255) tCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCtttt < 1:182537/141‑1 (MQ=255) tCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCtttt < 1:96305/141‑1 (MQ=255) tGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTgg > 1:405219/1‑141 (MQ=255) ggCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGc < 1:454405/141‑1 (MQ=255) tAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGc > 1:329741/1‑141 (MQ=255) aGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAg > 2:503162/1‑141 (MQ=255) aGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAg > 2:779432/1‑141 (MQ=255) ccACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCa < 1:77453/141‑1 (MQ=255) cacaTTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTCATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCAc > 1:393161/1‑141 (MQ=255) taTCTAATACCATCACTAATTTGTTTTGTTAAAGGTTCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCAt < 2:297660/140‑1 (MQ=255) gATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCAt > 2:251891/1‑141 (MQ=255) tCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTc < 1:156804/141‑1 (MQ=255) tAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCaa < 1:737272/141‑1 (MQ=255) aTACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAGTg < 2:295943/141‑1 (MQ=255) tACCACCACCAATTGGTGTGGTGAAAGGGCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGc < 2:195047/141‑1 (MQ=255) accaccaccAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCg < 2:674649/141‑1 (MQ=255) accaccaccAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCg > 1:316711/1‑141 (MQ=255) ccaccaATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGtttt < 2:490558/141‑1 (MQ=255) caccaATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGttttt > 2:191788/1‑141 (MQ=255) ttGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCAt > 2:147250/1‑141 (MQ=255) taattgctgttAAAGGACCTTTAACAACAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAACTGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCAt > 1:315445/8‑141 (MQ=255) taattgctgttAAAGGACCTTTAACAACAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCAt > 1:147088/8‑141 (MQ=255) ggTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTCTCTAAGTTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATta < 1:410261/141‑1 (MQ=255) tgttgtTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATtata < 1:563621/141‑1 (MQ=255) tgttgtTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATtata < 1:660297/141‑1 (MQ=255) ttgttAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAgg < 1:731935/141‑1 (MQ=255) gttAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCt < 1:506557/141‑1 (MQ=255) aaGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGCCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTtct > 1:681595/1‑141 (MQ=255) aaGGACCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTtct > 2:499632/1‑141 (MQ=255) aGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTtctc < 2:19910/141‑1 (MQ=255) gTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTTCTCaa < 1:757123/141‑1 (MQ=255) | CAACATCTTGTGGACGTTTAACAGGTGATGGTACTCCTTTAAACCAACGTACCGGTCTTAAGCAAGTAAATAAATCTAATTCTTGGCGTAAAGCCACATTTAATGATCTAATACCACCACCAATTGGTGTTGTTAAAGGTCCTTTAACAGCAATTAAATATTCTTTAATTGTATCAAGTGTTTCTTGAGGTAACCATTCACCAGTTGTATCAAATGCTTTTTGGCCAGCTAGCACTTCTTTCCATTCAATGCGTTTTTCGCCATTATAGGCTTTCTCAA > CP000730/1799738‑1800016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |