New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 806479 | 115 (1.000) | 3 (0.030) | 3/284 | 10.2 | 2.4% | coding (324/867 nt) | USA300HOU_0753 | DMT superfamily drug/metabolite transporter |
? | CP000730 | = 806506 | 132 (1.190) | coding (297/867 nt) | USA300HOU_0753 | DMT superfamily drug/metabolite transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AAATACCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCTGCCAAA > CP000730/806334‑806625 | aaaTACCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTtaataa < 2:533956/148‑1 (MQ=255) aCCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGTTACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTACTAAAAta > 1:1138962/1‑147 (MQ=255) aCCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGAAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCGTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATGAAATc > 1:812190/1‑148 (MQ=255) gCCAGCTAATGATGGAAACATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGa > 1:906481/1‑148 (MQ=255) cAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGAtt < 1:836965/148‑1 (MQ=255) cAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTCTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGAtt < 1:1064812/148‑1 (MQ=255) tAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGt < 1:273709/148‑1 (MQ=255) tgatgGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTc > 2:920323/1‑148 (MQ=255) tgatgGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTc > 2:21427/1‑148 (MQ=255) gatgGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCa < 2:956619/148‑1 (MQ=255) gatgGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAAAAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGAATTGATTTTCa > 2:587046/1‑148 (MQ=255) gAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTaa < 1:192796/148‑1 (MQ=255) gAATAATAGATGATGAAAATGCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTaa < 1:120415/148‑1 (MQ=255) aaTCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGGGGTTCATTAAt > 2:241680/1‑148 (MQ=255) aaTCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAAt > 1:744516/1‑148 (MQ=255) aTAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAACTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAATTCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAAt > 2:417355/1‑148 (MQ=255) aTAGATGATGAAAATTACGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAAt > 2:273321/1‑148 (MQ=255) tAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATAGCTAAAAGAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTGTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATc < 2:357108/148‑1 (MQ=255) tAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATc > 2:1089184/1‑148 (MQ=255) tAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATc > 1:565229/1‑148 (MQ=255) tAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCACAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATc < 1:662477/148‑1 (MQ=255) gatgatGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCgg < 1:357056/148‑1 (MQ=255) gaggatgaAAATTCAGGTTTCACTAATAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTCCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCgg < 1:291265/145‑1 (MQ=255) aatgatgAAAATTCAGGTTTCACTTGTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATCATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTGTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGACTGAGTTTCATTAATGAATCgg < 2:673346/147‑1 (MQ=255) tgatgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCAAGAAAGGATTGAGATTCATTAATAAATCggga > 2:922614/1‑146 (MQ=255) tgatgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATGGCTGTAATTTGATACTTCCTTGCCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTTCACAAAGGATTGAGTATCAATAATGACACGGCa > 2:649872/1‑148 (MQ=255) acgaAAACTCAGATTTCACTATTACAAACATACCTAAAACAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATCTTTCCTTCCCTGTTCTTGTAAGAAAACAATGTTTAATAAAATCGTCAAGAAACAATTCATGTTCATTAATTTATCTGCATc < 2:456483/146‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGGATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 1:362843/148‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCCATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTGTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 1:172776/148‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 1:392479/148‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 2:229868/148‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 1:614110/148‑1 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa > 1:1120901/1‑148 (MQ=255) tgaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 2:1188229/148‑1 (MQ=255) agaAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGCGTTTCATTAATGAATCGGCATCa < 1:183307/147‑1 (MQ=255) aaaaTTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACt > 1:393081/1‑148 (MQ=255) aaaTTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTa < 2:75729/148‑1 (MQ=255) tCAGGTTTCACTATTAAAGGCATACCTACACTAGCAATGATCATTGCCGTAATTTGATACTTCCTTACCGTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAAGAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTa < 2:627568/148‑1 (MQ=255) tCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTa > 2:1255075/1‑148 (MQ=255) tCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTa > 1:684805/1‑148 (MQ=255) ttCTCTTTTAAAAGCATACTCAAACTAGCACTTATAATCGCTGTAATTTTATACTTTCTTACCTCTTCATGTAAGAAACCATTGCTTAATAATAACGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATAACTATGCAcctgat < 2:392952/148‑5 (MQ=255) cACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGTAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGACAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGTAAGGATTGTTTACCATTAATGAATCGGCATCACTTAGTACCATATGa < 1:918369/148‑1 (MQ=255) cTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATc > 1:1068549/1‑148 (MQ=255) tttAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACCATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCaa < 1:399107/147‑1 (MQ=255) tAAAAGCATACCGAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCTCTAAGTACCATATGATCAATg < 1:689623/148‑1 (MQ=255) aaaaGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATgg < 1:69593/148‑1 (MQ=255) aaaGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGGACCTTATAGTCAATGGc > 2:139715/1‑148 (MQ=255) aaGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATCTGATCAATGGCa > 1:1159623/1‑148 (MQ=255) aaGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCa > 2:798209/1‑148 (MQ=255) aaGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGACa > 1:848319/1‑148 (MQ=255) cATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATaa < 1:1181665/148‑1 (MQ=255) atgccTAACATAGCAATTATCATTGCTGTAATGTGATACTTCCTCACCATTCCAGGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATaaa < 2:740711/145‑1 (MQ=255) aTACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATaaa < 1:326216/148‑1 (MQ=255) aTACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATaaa < 2:428234/148‑1 (MQ=255) ccTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAatat < 2:404928/148‑1 (MQ=255) tAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATAttt > 2:384652/1‑148 (MQ=255) aaacaTAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATAttt < 1:734415/144‑1 (MQ=255) aaaaaTAGCAATAAACAATGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCTGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATAttt < 2:7683/147‑1 (MQ=255) actagtgtcgttgccATGGCTTTAGTTTGATACTTCCTTACGTGTTCAAGTAAGAATACATTCCGTAATAAAATCGTCCACACAGGATTGAGTTTCATTACTGAATCTGCCTCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTa < 2:436652/134‑1 (MQ=255) aaaaTAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACGATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTGAGGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTa < 2:109215/148‑1 (MQ=255) aaaaTAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTa < 2:710765/148‑1 (MQ=255) aTAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACa > 1:97716/1‑148 (MQ=255) ttATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACAcc < 2:2258/148‑1 (MQ=255) ttATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACAcc < 2:797823/148‑1 (MQ=255) taacATTGATGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCCGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCa < 2:667545/145‑1 (MQ=255) tATCGTTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATGGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCa < 2:159409/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGTAATTTGATACTTCCGTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATaa > 1:929404/1‑148 (MQ=255) ttGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCCGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAg > 2:1156970/1‑148 (MQ=255) tGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCa < 2:924658/148‑1 (MQ=255) gTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGACAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCaa > 1:488027/1‑148 (MQ=255) tAATTTAAAACTTCCATACCTTTTCATGTAAGAAAACAGTGCTTAATAAAATCGACCAGAAAGGATTTACTTTCATTATTAAATCTTCATCACAAAATAAAATAAGATAAATGACATAAATATTTAACAATAAACCAATAAGTCCAAg > 2:313611/1‑148 (MQ=255) tAATATGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAACTCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGCATCGGCATCCCTAAGTCCAATATGATCAATGGCATAAATATTACACAATACACCAATAAGTCCAAg > 2:20331/1‑148 (MQ=255) aaTTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAgt < 1:1255075/148‑1 (MQ=255) aTTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCTGAACGGATTGCGTTTCATTAATGAATCGGAATAACTCAGTACCGTCTGATCGATCCCCTCAATATTTCACACTACACCACTAAGTCCCAgtg > 1:560069/1‑148 (MQ=255) aTTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAAAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCAAATGATCAATGCCATAAATATTTAACAATACACCACTAAGTCCAAgtg > 1:375285/1‑148 (MQ=255) tGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTg < 1:21427/148‑1 (MQ=255) gATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGa > 1:438158/1‑148 (MQ=255) tACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATc < 1:133081/148‑1 (MQ=255) ccTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCg < 2:229490/147‑1 (MQ=255) ctgccgtACCTATTCATGTAAGAAAAAAATCCTTACTAAAAGCGTCCAGAAAGTAATGAGTTTCATTAATGAATCGGAATCACTAAGTACCATAGGATCAATCGCATAAATATTAAACAATATACCAATAAGTCCAAGTGTGGATCgt < 2:953242/142‑1 (MQ=255) cTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCgt < 2:246956/148‑1 (MQ=255) ttCCTTACCATTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCGTTACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGCCCAAGTGTTGATCgtg > 1:1234437/1‑148 (MQ=255) ccTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGtt < 1:204031/148‑1 (MQ=255) cTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGATTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGtta < 2:407229/148‑1 (MQ=255) cTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGtta < 2:601212/148‑1 (MQ=255) cTTACCGTTTCATGTAAGAAAGCAATGCCTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGtta < 1:823647/148‑1 (MQ=255) tACCTTTTCATGGAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGttatt < 2:915641/148‑1 (MQ=255) tCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTATTAAgg > 2:350250/1‑148 (MQ=255) tGTAATAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAAACGGCATCACTAAGTACCAGATAATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGtt < 1:170670/148‑1 (MQ=255) tGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGtt < 2:1236797/148‑1 (MQ=255) tGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGtt < 2:1033630/148‑1 (MQ=255) tGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGtt < 2:538633/148‑1 (MQ=255) gTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTg > 2:671331/1‑148 (MQ=255) aaGAAAACAATGCTTAATAAAAGCGTCCGGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATGTGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGAc > 1:925074/1‑148 (MQ=255) gAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACCCCAATAAGTACAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACtt > 2:564879/1‑148 (MQ=255) aaaCAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGAGCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGa > 1:458394/1‑148 (MQ=255) aaTGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGt < 2:393081/148‑1 (MQ=255) tGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCt > 1:983537/1‑148 (MQ=255) tGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCt > 1:987418/1‑148 (MQ=255) aataaAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCTGCCaa < 1:55311/148‑1 (MQ=255) | AAATACCTGAGAATAAGCCAGCTAATGATGGAATCATAGATGATGAAAATTCAGGTTTCACTATTAAAAGCATACCTAAAATAGCAATTATCATTGCTGTAATTTGATACTTCCTTACCTTTTCATGTAAGAAAACAATGCTTAATAAAATCGTCCAGAAAGGATTGAGTTTCATTAATGAATCGGCATCACTAAGTACCATATGATCAATGGCATAAATATTTAACAATACACCAATAAGTCCAAGTGTTGATCGTGTTATTAATAAGGGTTGACTTGAAAGTCTGCCAAA > CP000730/806334‑806625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |