| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,646,189 | G→C | A155G (GCA→GGA) | pepP ← | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,646,189 | 0 | G | C | 97.7% | 294.7 / ‑5.5 | 91 | A155G (GCA→GGA) | pepP | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base C (34/52); minor base A (1/1); total (36/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTTTTA > CP000730/1646046‑1646332 | cAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGGCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CTTACttt > 1:1022125/1‑148 (MQ=255) aataatTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCtttt < 2:607319/148‑1 (MQ=255) aataatTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCtttt < 1:41283/148‑1 (MQ=255) taatTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTac < 1:973310/148‑1 (MQ=255) aCTTGCAACACCATGTGGTCATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTaaa < 1:796599/148‑1 (MQ=255) aCTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTaaa < 2:1219804/148‑1 (MQ=255) cTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTaaaa > 1:252023/1‑148 (MQ=255) ttGCCACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAat < 2:118531/148‑1 (MQ=255) acacCATGTGGTAATGCACCTCTATGCCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCACCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATAtt > 1:748089/1‑148 (MQ=255) acacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATAtt > 2:848793/1‑148 (MQ=255) cATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCata > 1:521329/1‑148 (MQ=255) tgGTAATGCCCCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:99260/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATTGTACATCTACCTGTTTTTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:592113/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:898957/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:1106006/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:1064212/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:159755/148‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCCCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt < 1:693954/148‑1 (MQ=255) gTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtc < 1:1251514/148‑1 (MQ=255) gTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTAATG‑AGCCCTTGTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtc < 1:602972/148‑1 (MQ=255) tGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtcatca > 1:425097/1‑148 (MQ=255) tGCACCTCTATCACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtcatca > 1:852155/1‑148 (MQ=255) cACCTCTATGACCAGATGCTACAGTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaac > 1:620960/1‑148 (MQ=255) cACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACCACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaac > 2:488279/1‑148 (MQ=255) aCCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATCTGTTTCATcaaca > 2:49072/1‑148 (MQ=255) aCCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaaca > 2:571658/1‑148 (MQ=255) ccTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATA‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaacaa > 1:956426/1‑148 (MQ=255) ctATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAatat > 1:1083739/1‑148 (MQ=255) gACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgc < 1:492015/148‑1 (MQ=255) aGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTCATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctgct < 2:414180/148‑1 (MQ=255) gATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtt < 1:1117247/148‑1 (MQ=255) gATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATGTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTGCATCAACAATATTAGCTGCtt < 2:853979/148‑1 (MQ=255) aaTGCTCCAATCGTATCGAATGATGGGCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtt < 1:1117228/147‑1 (MQ=255) tACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTCGAATTTTGCTTTATCATATAGCTTACAGTTGTTCTTCAGTGGTGTCATGC‑TGAACCACTGATAGAATGGTTGCGTATGTGTCATCAACGATAGGAGCTGCTTTTTGa > 2:1235511/1‑148 (MQ=255) tACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCTTTTTTT‑TCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATGCCTTTGAACAAGACTATTCACTGCttattta > 2:311810/1‑146 (MQ=255) tACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGa > 2:1117979/1‑148 (MQ=255) tACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGa > 2:1104251/1‑148 (MQ=255) aCAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGaa < 1:1156414/148‑1 (MQ=255) cAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTAATG‑ACTCCTTTTACAAAAGTTAAAATATATTCATATGTTTAATCACTAATATTAGATGATTTTTAAAt > 2:824481/1‑148 (MQ=255) tATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGc < 1:940129/148‑1 (MQ=255) tATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGc < 2:999173/148‑1 (MQ=255) gAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAAtt > 1:1149025/1‑148 (MQ=255) gAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCGCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAGGCAAtt < 1:784268/148‑1 (MQ=255) aaTGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAAttt < 1:452276/148‑1 (MQ=255) tCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCa > 1:1014803/1‑148 (MQ=255) tgcgtcTAATTCCTGTATTTTGCTTTCTAATATCGTCTTTAATTCTTTGTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAGTTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTg < 2:698072/143‑1 (MQ=255) tCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACg > 1:1120813/1‑148 (MQ=255) cTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTGTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtc < 2:492479/148‑1 (MQ=255) tAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTTTTTTTTTCTATTTCGTCAGCTTCTTTGACGtct > 2:1006578/1‑148 (MQ=255) ttCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTa < 1:130626/148‑1 (MQ=255) ttCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTa < 1:1180695/148‑1 (MQ=255) tCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTaa < 1:1127895/148‑1 (MQ=255) tCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTaa < 1:495401/148‑1 (MQ=255) tAGCATTTTGCTTTCTTATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtt < 2:253426/148‑1 (MQ=255) tAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtt < 1:321589/148‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtttt > 2:426478/1‑148 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtttt < 1:634559/148‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAATAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTa < 1:831681/148‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTa < 1:594788/148‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTa < 1:226197/148‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTa < 1:679169/148‑1 (MQ=255) tttGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCt < 2:710572/148‑1 (MQ=255) tGCTTTCTAATATTGCCTTTCATTCTTCTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTAc < 1:1160639/148‑1 (MQ=255) tCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGACTTAAAGCAATTTCGTCAGAATCTTTGACTTCGCTAATTTTATCTACAGTAt > 2:969763/1‑148 (MQ=255) tCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAt > 1:1124278/1‑148 (MQ=255) atTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGTCAGCATCTTTAACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGaaa > 2:736092/1‑148 (MQ=255) ccTTTTATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCt < 1:605980/148‑1 (MQ=255) ccTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCt < 1:507136/148‑1 (MQ=255) cTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCtt > 1:1058569/1‑148 (MQ=255) cTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATACtt > 1:770111/1‑148 (MQ=255) tatttCTTTTTCAGACATG‑ATTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCCTATGTTTCATTAACATTCTTAGCTGCTTTTTGTATTAAAGAACTTTAGTCAGCATCTTTAGAGTTTCTAATATCAGCTACAGTATTAGGAATGCttatt > 2:1135368/4‑148 (MQ=255) tAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTCCAGTATTAGAAATGCttatt > 1:1193431/1‑148 (MQ=255) tAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 2:664866/1‑148 (MQ=255) tAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATAAGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 2:680051/1‑148 (MQ=255) aTTTTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTATCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTaa < 1:824481/148‑1 (MQ=255) tCTTTGTCAGTCATG‑CCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATg < 2:996920/148‑1 (MQ=255) cTTTTTCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAACAGCTTATTAATGa > 2:104994/1‑148 (MQ=255) tttttCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat > 1:195927/1‑148 (MQ=255) tttttCAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat > 1:431032/1‑148 (MQ=255) cAGTCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACg > 2:173245/1‑148 (MQ=255) tgTCATG‑CCTTCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACgg < 2:1234158/147‑1 (MQ=255) tCATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCt < 2:219324/148‑1 (MQ=255) cATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCtt < 2:425097/148‑1 (MQ=255) cATG‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAAGATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATTCTTATTAATGATATACGGCtt < 2:852155/148‑1 (MQ=255) cATG‑CCTACTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCtt < 2:1019621/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATCTGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 1:372632/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 2:495202/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 1:268518/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 2:984188/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 1:1237386/148‑1 (MQ=255) g‑CCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTttta < 1:391971/148‑1 (MQ=255) | CAATAATTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATG‑CCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATACGGCTTTTA > CP000730/1646046‑1646332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |