Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 1,761,889 | C→A | D388Y (GAT→TAT) | folC ← | tetrahydrofolate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 1,761,889 | 0 | C | A | 98.9% | 301.3 / NA | 95 | D388Y (GAT→TAT) | folC | tetrahydrofolate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (55/38); total (57/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TAAATAGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATCTACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTCCGTTTA > CP000730/1761744‑1762032 | tAAATAGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCAtata > 2:1022475/1‑148 (MQ=255) tAAATAGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCAtata > 1:912154/1‑148 (MQ=255) aTAGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATatacta > 1:720378/1‑148 (MQ=255) aGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAAt > 1:1137559/1‑148 (MQ=255) aTTCTTCATTGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTg < 1:651571/148‑1 (MQ=255) ttcttcATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCCTATACTAATTGt > 1:523171/1‑148 (MQ=255) cATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTATCTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTtc > 1:1177255/1‑148 (MQ=255) cATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTtc > 1:21505/1‑148 (MQ=255) cATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTtc > 1:249988/1‑148 (MQ=255) aTGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTtca < 1:11677/148‑1 (MQ=255) aTTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCAttt < 1:248714/148‑1 (MQ=255) ttagttttagttTTATCCTGCGCAAAATGCTAATTGTGATTTAACGTCACTTATGAAAGACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCa < 2:1192589/148‑1 (MQ=255) ttagttttagttTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAATTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCa < 2:258796/148‑1 (MQ=255) ttagttttagttTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCa < 2:402865/148‑1 (MQ=255) ttagttttagttTTATAATGCATCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCAtttcaa < 1:710494/148‑4 (MQ=255) ttagttttaggtTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCa < 2:22905/148‑1 (MQ=255) tagttttagtttTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCaa < 1:191306/148‑1 (MQ=255) ttttagttttaTAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAAtac < 1:705835/148‑1 (MQ=255) ttttagttttaTAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAAtac < 1:559034/148‑1 (MQ=255) ttttagttttaTAATGCTTCAAAGTCTAATTATGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATGGAATTTCATCATTTTCAAtac > 1:795411/1‑148 (MQ=255) ttagttttaTAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAAtacta < 2:983915/148‑1 (MQ=255) agttttaTAATACTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCAATTATGAAATAAAGACTAACGGTTATTACTAATATATCACCAAGATAATATTTAATTACTTCAACGTAGTCATATATCAATTGTATTTCATCATTTTAAATGcaacc > 2:445556/1‑148 (MQ=255) aaaTGGTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACGTATGAAAGACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAAtt < 2:650738/147‑1 (MQ=255) aaaTGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGTCTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAAtt < 2:172678/147‑1 (MQ=255) aaTGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATTATTTATTCGTAGTCATAAACTAATTGTATTTCATCATTTTCTATACTTCGTACAAttt > 2:716813/1‑148 (MQ=255) aaTGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTCTTTCATCATTTTCAAtactactgccaatgt > 1:1221892/1‑139 (MQ=255) tGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATttct > 1:1048624/1‑148 (MQ=255) gCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTAACGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATttctt > 1:1179633/1‑148 (MQ=255) cTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCCATACTCCCTACAATttcttc > 1:255077/1‑148 (MQ=255) ttCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGACATACACTAATTGTATTTCATCATTTTCATTACTACCTTCAATTtcttct > 2:303297/1‑148 (MQ=255) ttCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTtcttct > 1:1044271/1‑148 (MQ=255) cAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCttt > 1:362240/1‑148 (MQ=255) cAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCttt > 2:413593/1‑148 (MQ=255) cAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCttt < 2:507216/148‑1 (MQ=255) cAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACATACAATTTCTTCttt > 1:779938/1‑148 (MQ=255) cAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCAGCATTTTCAATACTTCCTACAATTTCTTCttt > 1:46513/1‑148 (MQ=255) aGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCg < 1:493253/148‑1 (MQ=255) tttAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTCATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTATTTTTTTCGTAACGGttcgcga > 2:426686/1‑143 (MQ=255) tAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGaaa > 1:1091485/1‑148 (MQ=255) tAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGaaa > 1:445967/1‑148 (MQ=255) aaCTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTCCCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGataa > 2:722959/1‑148 (MQ=255) ttCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATGACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCa > 2:665928/1‑148 (MQ=255) tCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTCCCTAAAATTTCATCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCaa > 1:962187/1‑148 (MQ=255) tCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCaa > 1:55405/1‑148 (MQ=255) tCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCaa > 1:836632/1‑148 (MQ=255) cACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCaaa < 1:1022475/148‑1 (MQ=255) cTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAAtt > 2:938396/1‑148 (MQ=255) aTGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAg < 2:934762/148‑1 (MQ=255) gAAATACAGACTACCGGTAATTACTATTGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTGCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGCAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGtt < 1:755394/148‑1 (MQ=255) gAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGtt < 1:683578/148‑1 (MQ=255) aaaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAATCATTTTGGAACATCAAATTCAGTTg > 2:360924/1‑148 (MQ=255) aaaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTg < 1:883978/148‑1 (MQ=255) aaaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTg > 1:1141375/1‑148 (MQ=255) aaaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTg > 1:886909/1‑148 (MQ=255) aaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGc < 2:912154/148‑1 (MQ=255) aaTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGAGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGc > 2:293076/1‑148 (MQ=255) aTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAACTTCAACGTAGCCAGCTACTAATTGTAGTTGAGCAGTTTCAATCCTACCTGCAATCTCTTCTTTGCCTAAAGCTTTCGGACACTCAAACTCAGTTGcc > 2:542/1‑147 (MQ=255) aTACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTTTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAAAGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCa > 2:39854/1‑148 (MQ=255) aCAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTCTAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATa > 1:858919/1‑148 (MQ=255) aCAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTTCATa > 2:163248/1‑148 (MQ=255) aCAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATa > 1:1073932/1‑148 (MQ=255) taGACTGCCGGACAGTACAAATGTATTACTTTGAAAATTTTTTATAAGTTAAAGATAGTCATTTACTAACTGTATTTCATTATTTTCCATAATACATAAAATATCTTCTATGCGTATCGCTTTCTGAAAATCAAATTCAGTTGCATaa > 2:461399/2‑148 (MQ=255) gACTACCGGTAATTCCTAATGTATCACATTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATAGTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATaaaa > 1:786505/1‑148 (MQ=255) aCTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAAc < 2:989478/148‑1 (MQ=255) ccGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAATTTCTACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTAt > 2:338619/1‑148 (MQ=255) aCTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTa < 2:506796/148‑1 (MQ=255) aCTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTa < 2:658787/148‑1 (MQ=255) aCTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTa < 2:924153/148‑1 (MQ=255) aCTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTa < 2:502449/148‑1 (MQ=255) tAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTaaa > 1:1067014/1‑148 (MQ=255) aaTGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTaaaa > 2:292687/1‑147 (MQ=255) aaTGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAAc < 1:1054126/148‑1 (MQ=255) tGTATCACCTTGATAATTTTTTATTAATTTTTCGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACTTATACGCAATTAAACtt > 2:96471/1‑148 (MQ=255) tGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAGTTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACtt > 2:694522/1‑148 (MQ=255) tGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACtt > 2:1162929/1‑148 (MQ=255) cACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGGATGCGCAATTAAACTTAAATg > 1:605756/1‑148 (MQ=255) ttGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATTATTTTCAATACTGCCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGTGCAATTAAACTTAAATGTTTg < 2:853007/148‑1 (MQ=255) tGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGa < 2:798696/148‑1 (MQ=255) aTTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTATTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTAAGTTTCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCAtc > 2:50149/1‑148 (MQ=255) tttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCAtctc > 2:550357/1‑148 (MQ=255) tttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCAtctc < 2:431177/148‑1 (MQ=255) ttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCg > 1:480590/1‑148 (MQ=255) ttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCg < 2:21505/148‑1 (MQ=255) ttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCg < 2:1177255/148‑1 (MQ=255) ttttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACATATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCg < 2:249988/148‑1 (MQ=255) ttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGtt > 1:9822/1‑148 (MQ=255) ttATAAATTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAAATCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGtt > 1:906482/1‑148 (MQ=255) aTTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCgg > 2:398665/1‑148 (MQ=255) aTTCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTAAACATTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCTGAAAATTAAATTCTGTTGCATAATACGTATTCGCATTTAAACTTATATATTTGACCATTTCATTAATctg > 2:572934/1‑146 (MQ=255) tCAACGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATCAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGtt > 1:233645/1‑148 (MQ=255) aaCGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGtttt > 1:872073/1‑148 (MQ=255) aCGTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTc > 1:1061461/1‑148 (MQ=255) gTAGTCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAAACAACCGACCTAGCATCTTGGGTTTGCGCAACCAAACTTAAACCTTTGACCATCTCGTTAATCGTTTTTCCg < 2:568120/148‑1 (MQ=255) ctAGTCATACACTAATTGAATCTCATCATTTACAATACTACCTACAATTTCTTCTTAGCGTAACGCTTTCGGAAAAGCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGGTAATCGGTTTTCCg < 2:223713/147‑1 (MQ=255) tAGTCATATACTAATTGTATTTCATCCTTTTCAATACTACCTACCATTTCTTCTTTACGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTGGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTCCGt < 2:724223/148‑1 (MQ=255) tAGCCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTCCGt < 2:230125/148‑1 (MQ=255) tCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTCCGtttt > 2:897188/1‑147 (MQ=255) tCATATACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCGCGTTAATCGGTTTTCCGTTTa > 2:116968/1‑148 (MQ=255) | TAAATAGATTCTTCATGGCTATTTTAGTTTTAGTTTTATAATGCTTCAAAGTCTAATTTTGATTTAACTTCACTTATGAAATACAGACTACCGGTAATTACTAATGTATCACCTTGATAATTTTTTATAAATTCAACGTAGTCATCTACTAATTGTATTTCATCATTTTCAATACTACCTACAATTTCTTCTTTGCGTAACGCTTTCGGAAAATCAAATTCAGTTGCATAAAACGTATGCGCAATTAAACTTAAATGTTTGACCATCTCGTTAATCGGTTTTCCGTTTA > CP000730/1761744‑1762032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |