Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | ||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.84e-01 |
CATATTCTGAACCAGGTCGAACAACCCACTACTGCCGCTAACGGGCACGCCGTCATTGAGCTGCGCAAGCTGTGCATCACTGGGTGAGAAAACATGCCCTAACACCACTGTGATAAACGCACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCT‑GGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGT‑GGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGATTCTCAATGCAACTTCTAAATTAATCCAGATCAATAAAGGGTGAATTATCATATGTAATGTGATCTATGTAGGATCATTTGTTACTCCAATGTAGGTATATTCG > NC_000913/1313454‑1313986 | cATATTCTGAACCAGGTCGAACAACCCACTACTGCCGCTAACGGGCACGCCGTCATTGAGCTGCGCAAGCTGTGCATCACTGGGTGAGAAAACATGCCCTAACACCACTGTGATAAACGCACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGaaa > 2:211138/1‑301 (MQ=255) 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aCCATGTCGAACAACCCACTACGGACGCTAACGGGCACGCCGGCATTGAGCTGCGCAAGCTGTGAATCACTTGGTTAGAAAACATGCCCTAACACCACTGTGATAAACGGACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCtt < 1:636570/301‑1 (MQ=255) caacCCACTACTGCCGCTAACGGGCACGCCGTCATTGAGCTGCGCAAGCTGTGCATCACTGGGTGAGAAAACATGCCCTAACACCACTGTGATAAACGCACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCggg > 2:630900/1‑300 (MQ=255) ccatgacgcccGCTAACGGGCACGCCGTCATTGAGCTGCGCAAGCTGTGCATCACTGGGTGAGAAAACATGCCCTAACACCACTGTGATAAACGCACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTa < 1:896493/292‑1 (MQ=255) 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ccacTGTGATAAACGCACATAGCAACGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCT‑GGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGT‑GGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAAt > 2:838607/1‑301 (MQ=255) cGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCT‑GGCCTTCAGGCATGGGCAAATCGCGGCAAGT‑GGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGAt < 2:714642/301‑1 (MQ=255) cGATACCAACAGAATGGTCATAAATTGATTACGGAAGAAATTTCCGGTGTCACGGTATACGGACTGCGCCGTGATAGACATGCACTCTCCTTGAGTTTTATGCAGGTGTTAATTAGCGGGCAATTGTACCCTGGTTAAGCCTCGGGTGGCAGCATCAGGTCTTGTATGGAAAAGCATATCTTTGTAAAGCGGAGGTAATTGCT‑GGCCTTCAGGAATGGGCAAATCGCGGCAAGT‑GGCGACCGAGTTAATATTTGCGTAGCGAAAATATTTAAAAATTGATTTAAATCACATTAACCAGGAt < 2:81615/301‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |