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acccGGAAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCGTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGGATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATATATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACa < 1:841302/299‑1 (MQ=255) gTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatatat < 2:660350/191‑1 (MQ=255) gTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatatat > 1:660327/1‑191 (MQ=255) gTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGAt < 2:172800/44‑1 (MQ=255) gTGAATATGTCGATGCATATTATATGACGCGGGTGAAGTAAGAt > 1:172798/1‑44 (MQ=255) aaGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatata > 1:369958/1‑94 (MQ=255) aaGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACatata < 2:369964/94‑1 (MQ=255) | CCATCTCACCATTGACGTGCAACAGCGCCCACGCCGCAGTCATGTTGCCGATTTTGGTATCTGTGTCGACTCTCGTTGGAAGAACCGCGGCGTCGCCAGCGCCCTGATGCGAGAGATGATTGAAATGTGCGACAACTGGTTGCGGGTAGATCGCATTGAACTAACCGTGTTTGTCGATAACGCCCCGGCAATTAAGGTCTATAAAAAATACGGCTTTGAAATTGAAGGGACTGGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATATATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACA > NC_000913/3581329‑3581810 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |