| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,414,991 | 1 | .→G | 1.1% | 0.5 0.0 ‑0.1 | 182 | coding (717/1626 nt) | aidB | DNA alkylation damage repair protein; flavin‑containing DNA binding protein, weak isovaleryl CoA dehydrogenase |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/1): ref base (93/87): total (94/88) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.46e-01 | ||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCG > NC_000913/4414694‑4415287 | ccaTTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTTATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGAGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCACAGCGATGCTCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCc‑gcgtt > 1:421936/1‑299 (MQ=255) gttgttACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGGGGGGCATAAATGGTTTTTCCCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCCTGCGTttttt > 1:1012557/1‑301 (MQ=255) tgttACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGcc < 2:947655/301‑1 (MQ=255) gttACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTGTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGc > 1:643828/1‑299 (MQ=255) ttACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAACGCGATGCGCATCTGGTTCTGGCGCATACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCtt > 1:585843/1‑300 (MQ=255) ttACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGCTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGGTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGTTTCCGCAAAGCGACGCGCATCGGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑TCGCTTTTTGc > 1:520864/1‑298 (MQ=255) gATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGCTGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCCTCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGGCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACggg > 1:314955/1‑301 (MQ=255) gATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACggg > 2:341346/1‑301 (MQ=255) ccccGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGgcaacgc < 2:548504/300‑1 (MQ=255) gTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAACGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGAtt > 1:254628/1‑301 (MQ=255) tttCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGAATCTGGTGCTGGGGCAGCCCGCGGGTGGTCGGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTTCCTGAAGGGGCAAGCAACGCGAtt > 1:540708/1‑300 (MQ=255) tttCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGATTTTCTCGGTTCCGCAAGGCGCTGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGGCCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTCATGGGACACGCAACGCGAtgt > 1:566277/1‑299 (MQ=255) ggACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGCCGGGCAACGCAACGCGATTCGCCt > 1:483867/1‑300 (MQ=255) cgcTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGTC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGa < 1:978907/301‑1 (MQ=255) cgcTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGa < 1:328441/301‑1 (MQ=255) cTATGGAGCGATCGCTACGAGTCTCATTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATGGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGGTTTTCGCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCGGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGAt < 1:994477/300‑1 (MQ=255) aTTGAGCGTTCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGCAAGATaaa > 2:611523/1‑300 (MQ=255) aTTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGGGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACTCAACGCATTTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGAtcaa > 1:795788/1‑298 (MQ=255) aTTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCAGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAACGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAACCCATGCGCATCTGGTGCTGGCGCACACCGCGGGTGGTCGCTCCTTCTTTCTT‑TTACG‑CCCCTGTTTGCCTGACGTGCCATGCCACGACCTTCACATCGACAGGCTTAAAGCTaaa > 1:779320/1‑300 (MQ=255) 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cTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGGTAAGCTGGGTAATCg > 2:985940/1‑300 (MQ=255) gATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑‑CGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTaa > 2:203429/1‑301 (MQ=255) aTTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGAGGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGTTGGGCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTGTGCCGGCTGAAAGATAAGCCGGGTAATCGgtctca > 1:294117/1‑299 (MQ=255) 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tATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTg < 2:666719/301‑1 (MQ=255) tGCCAGGTGGGCAAAACCGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGa < 1:150464/301‑1 (MQ=255) cAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCCCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTGCAGCGGCTGAAAGCTAAGCTGGGTACTCGGTCTCACGCCCGTTGCGaggg > 1:565285/1‑298 (MQ=255) 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ggtggtCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGGAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATc < 2:294123/300‑1 (MQ=255) ggtggtCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATc < 2:320685/300‑1 (MQ=255) ggtggtCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTGTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATc < 1:352016/300‑1 (MQ=255) ttCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCGGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGccc < 2:324132/300‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGcc > 2:522956/1‑300 (MQ=255) cTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGATGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATg < 2:69406/301‑1 (MQ=255) cTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATg < 2:730856/301‑1 (MQ=255) cTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTAGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTAt < 2:730620/300‑1 (MQ=255) tttttt‑G‑GCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCg < 1:505393/301‑1 (MQ=255) | CGCCACGCCATTGTTGTTACAGATGTTACCCGCGCCGTTTCAGGACTGGACCACGCCGCTATTGAGCGATCGCTACGATTCTCACTTATTGCCAGGTGGGCAAAAACGCGGTTTGTTGATTGGCATGGGAATGACGGAAAAGCAGGGCGGTTCCGATGTTATGAGCAACACCACCCGTGCAGAGCGTCTGGAAGATGGCTCTTATCGGCTGGTGGGGCATAAATGGTTTTTCTCGGTTCCGCAAAGCGATGCGCATCTGGTGCTGGCGCAGACCGCGGGTGGTCTGTCCTGCTTTTTT‑GTGCC‑GCGCTTTTTGCCTGACGGGCAACGCAACGCGATTCGCCTCGAGCGGCTGAAAGATAAGCTGGGTAATCGCTCTAACGCCAGTTGCGAAGTGGAGTTTCAGGATGCCATTGGTTGGTTGTTGGGGCTGGAAGGGGAAGGAATTCGTCTGATCC‑TGAAAATGGGTGGGATGACGCGTTTTGATTGCGCCCTGGGTAGCCATGCCATGATGCGCCGTGCATTTTCGCTGGCGATTTATCATGCACATCAACGCCATGTTTTTGGTAATCCATTGATCCAACAGCCCCTTATGCG > NC_000913/4414694‑4415287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |