Read alignment evidence... | ||||||||||
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Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/1): ref base (93/78): total (94/79) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
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Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
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cccAGTTCATAC‑ACAGCAGCTTTAACAGTCTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGATCCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCg < 1:302464/300‑1 (MQ=255) cccAGGTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGGTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCgt < 2:484179/301‑1 (MQ=255) gTTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATTCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTCCTCACCACCGTTGATGGTGTTCATCATCGGAACCGGCATAGGTTATTTGCCCGGAGTACCattcag > 1:268294/1‑301 (MQ=255) gTTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCgttcag > 1:99398/1‑301 (MQ=255) gTTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCgttcag > 2:204308/1‑301 (MQ=255) gTTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCgttcag > 2:545542/1‑301 (MQ=255) | CCTTTTTCGATACCTTCTTTCAGGATCTTGGTGTTGGTTACGAACAGGTCGTCACCAACCAGCTGGATTTTGTCGCCCAGAACTTTGGTCTGGTATGCGAAACCGTCCCAGTCAGATTCGTCCAGACCGTCTTCGATAGAAACGATCGGGTACTGTTTGGTCAGTTCTTCCAGGAAGTGAGTGAATTCTTCAGAGGTGAACGCTTTGTTGCCTTCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAA‑CCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCGCGCCAACCGGCTGAATCATGAATTCCTGGATATCAACGTTGTTGTCAGCGTGCTCACCACCGTTGATGATGTTCATCATCGGAACCGGCATAGAGTATTTGCCCGGAGTACCGTTCAG > NC_000913/2906941‑2907533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |