Read alignment evidence... | ||||||||||
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Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
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ttACCGATCAAAAGGTTTTGACGAT‑AACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGG‑CTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGTCTGACCACTtctc < 1:81818/301‑1 (MQ=255) ccgcccaaaggtcgttGACGAT‑AACCTTGGCCTGCTCATCGACCTGCTTCTCGCCAGCCAACCGCGGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCAGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGG‑CTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGTCTGACCACTTCTCtat < 2:205461/287‑1 (MQ=255) ttgcaaaGGTTTTAACGAT‑CAACGTGGTCTTCTCATCGAACTGCTGCTCGCCAGACAATCGCCTGCAGAATGTTGCGTAGAATCCCGACTCGACTATGAAAGCCGCAGCATGGACAGACCGTCCCATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCACCTCTCCTGG‑CTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTTCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGTCTGACCACTTCTCtattat < 2:378837/297‑1 (MQ=255) cTCAAAAGGTTTTGACGAT‑AACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGGAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCCGCTCTCCTGG‑CTCACACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTTAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGGCCTTTGTTATACCGTCTCTTCGTTTTTAGTTCTCTTCCCCCTTCTCtattat > 1:63667/1‑301 (MQ=255) aaaaaGGTTTAGCTGGA‑AACCGTGCGCAGGGCATCGACATGCTGACCTCCGGCCAACCCATGGGTGAATTTGGCGGAGAAACCGGCATAGACGATTGAAGCCGCAGCAGGGAAAAGCCGTCCGATCACGCCCCCGTGTGGGCGACCTGCCGCCGCTAATTTAGGAGCTCTCCTGG‑CTCAAACTGGGTCATGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGGCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGTCTGACCACTTCTCTATTATCa < 2:723185/300‑1 (MQ=255) | GCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAG‑ATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGAT‑AACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGG‑CTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCGTCTCTGCGTTTTTAGTTGTCTGACCACTTCTCTATTATCAAGTTTGATAT > NC_000913/1832797‑1833387 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |