Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,679,869 | A→T | 6.6% | I105F (ATC→TTC) | ydgI → | putative arginine/ornithine antiporter transporter |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 1,679,869 | 0 | A→T | 6.6% | 2.3 0.0 ‑0.0 | 93 | I105F (ATC→TTC) | ydgI | putative arginine/ornithine antiporter transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/3): ref base (44/39): total (51/42) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.98e-01 |
CTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGT‑GTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGC‑GGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATT‑CGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGGGTTTGGCGAGCTAATCGGCTTTTGTTCCGCATGGGGATACTGGCTGTGCGCAGTCATCGCCAAC‑GTCTCCTATCTG‑GTGATCGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGTAATACCTGGCAATCGATAGTCGGTGCATCGGCTTTATTGTGGATTGTTCACTTTTTGATCCTGCGCGGGGTGCAAACCGCTGCCAGCA‑TTAACCTGGTGGCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCGGACTTGCACTTGGCGTACCCGTTTGGGAACAGGTGAAAAACAC > NC_000913/1679569‑1680164 | aaggcccTGAGCGCCATCACCGAGCTGGTATAAAGCTCAAGGGTGGGCGCGCGT‑GGTTTCAGGCTGCCGGAAAATAGGGC‑GGCAGTGGCGCGCCCGGCCGCACGGCTCATCGGCTGGGGTAGTACTGGCGCGGGCAGTTTATTGCTGGCCGTTGCCATGCTGATCCTAACGCGCATT‑CGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTGTACCTATGCCCGCGAAGGGTTGGGCGAGCTAATCGGCTTTTGTTCCGCAGGGGGATACTGGCTGTGCGCAGTTATCGCCAAC‑GTCTCCTATCTG‑GTGa < 2:465889/295‑1 (MQ=255) 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gtG‑GTGATGGTGTTTTCCGCGTGAAGCTTTTTGACGGAAAAGGTGGAATTGCGATGGTTGGGGGATGGGAATACCTGGCAATCGATAGTCGGGGCATGGGCTTTATTGTGGATTGTGCACTTTTTGATCCTGCGCGGGGTGCAAACCGCTGCCAGCA‑TTAACCTGGTGGCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCGGACTTGCACTTGGCGTACCCGTTTGGGAACAGGTGAAAAac < 1:416034/299‑1 (MQ=255) tG‑GTGATCGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGTAATACCTGGCAATCGATAGTCGGTGCATCGGCTTTATTGTGGATTGTTCACTTTTTGATCCTGCGCGGGGTGCAAACCGCTGCCAGCA‑TTAACCTGGTGGCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCGGACTTGCACTTGGCGTACCCGTTTGGGAACAGGTGAAAAacac < 1:241531/301‑1 (MQ=255) | CTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGT‑GTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGC‑GGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATT‑CGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGGGTTTGGCGAGCTAATCGGCTTTTGTTCCGCATGGGGATACTGGCTGTGCGCAGTCATCGCCAAC‑GTCTCCTATCTG‑GTGATCGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGTAATACCTGGCAATCGATAGTCGGTGCATCGGCTTTATTGTGGATTGTTCACTTTTTGATCCTGCGCGGGGTGCAAACCGCTGCCAGCA‑TTAACCTGGTGGCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCGGACTTGCACTTGGCGTACCCGTTTGGGAACAGGTGAAAAACAC > NC_000913/1679569‑1680164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |