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gCGTTGGCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCAGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTTGATAGGCCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTagag < 1:668602/299‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAATTTTGTAGTGTCGTTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATAGCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGAGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTagag < 1:1123985/299‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTagag < 2:165302/299‑1 (MQ=255) 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ttGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATATGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTAGAGATAATAACTTatatat < 1:755891/300‑1 (MQ=255) cTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGAGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTAGAGATAATAACTTatatat < 2:1120386/301‑1 (MQ=255) cGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATTGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTAGAGATAATAACTTATATATTATGt < 2:707432/301‑1 (MQ=255) 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gTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAAc > 1:973623/1‑103 (MQ=255) | AACACTGGCCGGAAGAACACTGGCGAGAATTGATTGGTTTACTGGCTGATTCAGGAATACGGATTAAACTTCCGTGGGGCGCGCCGCATGAGGAAGAACGGGCGAAACGACTGGCGGAAGGATTTGCTTATGTTGAAGTATTGCCGAAGATGAGTCTGGAAGGCGTTGCCCGCGTGCTGGCCGGGGCTAAATTTGTAGTGTCGGTGGATACGGGGTTAAGCCATTTAACGGCGGCACTGGATAGACCCAATATCACGGTTTATGGACCAACCGATCCGGGATTAATTGGTGGGTATGGGAAGAATCAGATGGTATGTAGGGCTCCAAGAGAAAATTTAATTAACCTCAACAGTCAAGCAGTTTTGGAAAAGTTATCATCATTATAAAGGTAAAACATGCTAACATCCTTTAAACTTCATTCATTGAAACCTTACACTCTGAAATCATCAATGATTTTAGAGATAATAACTTATATATTATGTTTTTTTTCAATGATAATTGCATTCGTCGATAATACTTTCAGCATAAAAATATATAATATCACTGCTATAG > NC_000913/3796553‑3797104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |