New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4503437 = | 88 (1.380) | 4 (0.060) | 4/576 | 8.7 | 4.5% | noncoding (79/1426 nt) | IS4 | repeat region |
? | NC_000913 | 4503467 = | 85 (1.380) | noncoding (49/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
CGCTGGCGGGCCTGAATAACGGCACTGGGGGCAACGAAGGGGCGATTGCCCGGCAGCATGATGTCCAGGCGATTCACAATCTGGTGAAGAGGTTCTTTACGCTCAAGCGCCATGCCAACAATACACCAGACCATCATTTCGAGGGGAAGACGGCGCTTGCGTAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATACTGCAAAGGAAAACAGCTATAACGTAAGCTAAAGTAATAACCTCTCAGTCTTTCCTCATTTGACGAAGG > NC_000913/4503139‑4503733 | cgcTGGCGGGCCTGAATAACGGCACTGGGGGCAACGAAGGGGCGATTGCCCGGCAGCATGATGTCCAGGCGATTCACAATCTGGTGAAGAGGTTCTTTACGCTCAAGCGCCATGCCAACAATACACCAGACCATCATTTCGAGGGGAAGACGGCGCTTGCGTAGCGTTACAGTACCTGATTCGGCAAGGCAACGAGAGATGAGTTCGGGGTCGAGGTAATCCCCCAGAGAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAAt < 2:226348/301‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |