| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 257,908 | Δ776 bp | [crl] | [crl] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 257908–258674 | 258683 | 10–776 | 82 [0] | [0] 82 | [crl] | [crl] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 257907 | 0 (0.000) | 82 (1.320) | 73/582 | 0.0 | 100% | intergenic (+8/‑769) | crl/crl | pseudogene, sigma factor‑binding protein, RNA polymerase holoenzyme formation stimulator;regulator; Surface structures; transcriptional regulator of cryptic csgA gene for curli surface fibers/pseudogene, sigma factor‑binding protein, RNA polymerase holoenzyme formation stimulator;regulator; Surface structures; transcriptional regulator of cryptic csgA gene for curli surface fibers |
| ? | NC_000913 | 258684 = | 0 (0.000) | pseudogene (9/331 nt) | crl | pseudogene, sigma factor‑binding protein, RNA polymerase holoenzyme formation stimulator;regulator; Surface structures; transcriptional regulator of cryptic csgA gene for curli surface fibers | |||||
TTGAGGCCAACGCCCATAATGCGGGCTGTTGCCCGGCATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCTGAAGGTAAGTGCAAAGATAATCGATTCTTTTTCGATTGTCTGGCTGTATGCGTCAACGTGAAACCGGCACCGGAAGTGCGTGAATTCTGGGGCTGGTGGATGGAGCTGGAAGCGCAGGAATCCCGTTTTACCTACAGTTACCAGTTTGGTCTGTTCGATAAAGCAGGCGACTGGAAGAGTGTTCCGGTAAAAGACACTGAAGTGGTTGAACGACTGGAGCACACCCTGCGTGAGTTTCACGAGAAGCTGCGTGAACTGCTGACGACGCTGAATCTGAAGCTGGA > NC_000913/258388‑258960 | ctggaagaacgatccgttcagcccggaagaggactcacgcttaatcacctcatcatctgctgacggtaaattattagagatctcatttaacccggggtatcggaattttgacaaagatcttcaggaaatcaccgactggatcgaagaacgcttctgttaaaaatttgctaaattttgccaatttggtaaaacattttcatcaaaacaggagatagcaatgacgttatcgagtgtacacccgaatagcagattgatcaaaacatttaccgcaataggcccgtatatccgtgaatgtaAgtt > 1:348548‑M2/297‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |