| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2904386 = | 292 (1.090) | 11 (0.040) | 10/536 | 31.4 | 3.7% | intergenic (+1012/+361) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| ? | NC_000913 | 2904404 = | 288 (1.110) | intergenic (+1030/+343) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATACAAACTAAAATCTACCAAACTTTACCGCAATAATTTTCACTCCAGCGAAAAATTAATGCCACAGAATTTGTAGAGAATGCTAATGATTAGCCCTGGATGGGTAAAATGGAGGAGTTTTCAGAGGCGACAAACAATATAAATGAGTA > NC_000913/2904107‑2904699 | ggagttacgtcttgggctgtgccgacgtCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAAACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGGGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGATCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAacac < 1:1235165/274‑1 (MQ=255) taggatatatatgggctacgcgtaagcGGGTTATCCGCGCCGGGGCGGAGAACAAGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTCTCGGCTCTGTGTATCCCCGCTGGGGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACAGTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACAct < 2:509339/274‑1 (MQ=255) gCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTGTCTCCGCTGGCGCGGGGGACAcgct > 1:601594/1‑300 (MQ=255) ggtgttacgtttttcTATTCGGGTTTGCCCCGATGGCGCGGGGAAAGCGGGCGACCGGAATACAAGTCCGTTTGTCTGATCGGTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCGGCAACAGCAGCACCCAGGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACa < 2:1367084/286‑1 (MQ=255) gtccttttGCTATTCGTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAAcc < 2:1021720/294‑1 (MQ=255) tGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAAACCAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTCTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCCGGCGCGGGGAAGACCCTCAACATACACTattatt > 2:900105/1‑300 (MQ=255) gCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACCCTCTAAACATAACCTAttatta > 1:1995188/1‑300 (MQ=255) cGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACCCGAAATGCTGGTTAGCGTTCTTGCCTCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCACAGTACGCCTGTTTGCGACTGCCCGGCTTTTGCCGCTTTACCACCCCTGCCGCGTGGAccacacgtcggtcgcgcgtctgttcggtgacc > 2:1234802/1‑273 (MQ=255) ggTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAACCTCTACACATAACCTATTATtaattaatt > 2:1693414/1‑299 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATtaattaat < 1:526431/292‑1 (MQ=255) 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gggAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTCTCCCCGCTGGCTCGGGGAACACTTGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCACGAAATGCTGGTCAGCGTTAATGCTGCCAACACAGGCTTATCCCCGCTTGCGCGGGGAAAACAATACGCCTTATTGCGCATGCCCCATTTTCGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACCATCTCAACATCTTCTGTACTTCATTTAAGCTTTTTTAATCCACTCTCAAt > 1:2055788/1‑301 (MQ=255) caccccgcttttccgatctatcccaaGCGGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAAt < 2:1215184/277‑1 (MQ=255) atcccacGGGACCACGGAATACAAAGCCGTGTCTCTTCTCGGTTTATCCCCGCGGGCGCGCGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGAACACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAGATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCATTGTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATc < 2:1041807/297‑1 (MQ=255) aaCACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACa > 1:445392/1‑257 (MQ=255) acacGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGGTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTGTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGTACCCTCTAAACATCACCTATTATTAATTCATGATTTTTTAAGCTAGTCACAATCTa > 1:93930/1‑300 (MQ=255) cacGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTAcc < 1:1693924/301‑1 (MQ=255) 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tATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCAGGAAAACGTCGGTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGCCGCCGGGAACACTCTCAACATCACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTAACACacaaaaaaaa > 2:1832561/1‑298 (MQ=255) tGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTACACATACCCTAGTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAAAAAaacaaa > 1:285119/1‑298 (MQ=255) ggccggtttcagcccGCGGGGGCGGGGAACACTGGCGCTGCAACAGCAGCACCACTGACCACTGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGCGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACAt < 2:2076829/286‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |