New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4541538 = | 314 (1.180) | 11 (0.040) | 11/536 | 30.7 | 3.4% | coding (582/603 nt) | fimB | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
? | NC_000913 | 4541553 = | 316 (1.220) | coding (597/603 nt) | fimB | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
CCGCATGCTGAGAGCGAGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTA‑AGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTAACCATATCCATACAAAA‑TACAATGGTTTATGTTCTTCAAAATAAATAAACAAAATCATTCATAAATTTACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCA > NC_000913/4541254‑4541852 | gcttcgagCGTGTGGTTATTTTTTACACGTTCGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATCTTATCTCGCCTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATag < 2:1420556/295‑1 (MQ=255) gCTGAGGGCGAGTGGGTATTTTTATAACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATag < 1:2537845/300‑1 (MQ=255) ttccgttcttttttATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATTTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTg < 2:555793/291‑1 (MQ=255) aGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATTTTCGTCATACTTTCTGGTATACCGCCAGCAATGCCGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGTTAGAGCCAGAGGACGACCGCGTTACGCTGTTTTATGTGGATAGTTgcg > 2:883127/1‑299 (MQ=255) aGTGGGTATTTTTATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCCCGCTGGTTTATAGAGATAGtgg > 2:307669/1‑297 (MQ=255) tgtgttttttATCACGTAGGGAGCTTCCGCTTTAGCAGCAACTGTCTTACCATCTCATTTCCACTTACGGTGGTCATTCCGAGTTTGCACTGGAGATTCGTCCGCACATGTTACGACATTCGTGTGGTTTTGCTGTGGCGAATATGGGAATAGAGACGCGACTTATCCAGGATTATCTGGGGCCTCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTGACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGAAGACCGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGAt < 2:1815775/295‑1 (MQ=255) tATTTTTCTCTCGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATAcc < 1:696699/300‑1 (MQ=255) ttttATCACGTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATACCAgg < 1:1013281/300‑1 (MQ=255) gTAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCCTCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGAGTAACGCTGGTTTATAGAGAGGGTTGAGATAACAGGGATGGGGtt > 2:1198309/1‑300 (MQ=255) tAAGGGGAATCCGCTTTCTCGGCAACAGTTTTACCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATCTGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGACTGGTATACCGCCAGCAATGACGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGTGGACGACAGCGTAACGCTGTGTTTTCGAGATAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTa > 2:2422892/1‑300 (MQ=255) 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aCCATATTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCAGGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATACCAGGGATGGTTTTAAACAATACATTATGTTTATGATATATGaaaaa > 2:2107833/1‑300 (MQ=255) atatTATCTCGACTTCCGGTGGTAATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTCGTGTGGTTTTGCTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGCATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACACCATTATTCTTACGATATATACAAAATGa > 2:2233541/1‑300 (MQ=255) ttgctgtccTTCAGGGGGTCATGCCGGGTTGTCACTGGAGATTCATCCGCACATGTTACGCCATTTGTGTTGTTTTTGTTTGGCGAATATGGGAATAGATACGCGACTTATCCAGGATTATCTTGGGGATCGCAATATTCGTCATACTGTCTGGTATACCGCCAGCAATGCAGGGCGTTTTTACGGCATCTGGGATAGAGCCAGAGGACGACAGCGTCACGCTGTTTTATAGAGATAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTaa < 2:2059738/292‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |