| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2900306 = | 90 (1.470) | 6 (0.100) | 6/540 | 6.3 | 6.7% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2900346 = | 83 (1.440) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
GCAGCGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTACTTTTCTCTTTTTTTTGTCTATTACAAATGGGAATACGATATGCAACACAACTCA > NC_000913/2900014‑2900606 | gcagcGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGTATAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAT‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAATGAAAGGt > 1:312350/1‑300 (MQ=255) agcGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCCTTGAAAACGCATTGAGAGATTCGTTTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTCAGGA‑AAAAAAaaaaaaagaaaa > 2:410314/1‑296 (MQ=255) ggatcatctctggcggcgCTCCTTCTACGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTAAACCCCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACtt < 2:325910/289‑1 (MQ=255) cGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAATATATTTTCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGAAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCAACCGTTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGTAGAAAAAATCCAGTGAGCACGCATGGAGAGATTGAATTGAACAT‑G‑TAAGACCCAATTTACGTAAGGA‑AACAAAaaagaaatgaaaatt > 2:378174/1‑293 (MQ=255) cGATAATCTTCTGCGGCGCGCCTTCTGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAAAAAGGTAAcct > 2:229124/1‑299 (MQ=255) tGCGGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTAAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAGCTAGGAATAAAGATATTTCCGCAAGCTTTGGCCAACGCCATGCCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACATTTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGGGAGATTCGATTG‑ACTTAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGGAAATTTCCCCGA‑GAGAGGGACGTGAGCttt > 2:423090/1‑301 (MQ=255) gTGATACCCCCCTGCATGAATTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTTGTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCa < 1:229188/301‑1 (MQ=255) cATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTAACCTTTCCCAATATTTCTGGTaa > 2:244823/1‑300 (MQ=255) tGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAACGAAAGGTAACTTCCCCCGA‑GAGAGGGAATGTACCTTTCTAATTTTCTCTGGTAACtt > 2:243036/1‑300 (MQ=255) accccccctgatctctctctctttttCACTCCTGTTCTTGGTTTGTCCGTTATAGTTGAAGAAAATATGGATAAAGAATTTTGAGCCAGATTTGGACAACGACAATGGAAATTCCTGTCCTCAACCGTTCTGGCCATCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGTAGAAAAAATCCAATGAGAACGCACTGAGAGATTCGTTTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑‑AAAAAAAAGAAAGGTGACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGga < 2:297754/280‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACACGGTTTTTCAATCATTACCTTGTTTTCGCCGTTAGGTTTGACGAAACTAGGAACAAAGAGATTTGCGCCAGATTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAAACGCCATTCCCACCTGTAAGAAGTGCGGTTTTACCTGTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAAATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTACCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATa < 2:201431/301‑1 (MQ=255) ccACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCTATTTCCGTAAGGC‑AAAAACAAAGAAAGGAAACTTCTCTCTC‑GCGGGGGACGTTACCTTtcttttttttttcctttcggtactttg > 1:42647/1‑277 (MQ=255) cccAACACCCGTTTTTTCATTCATTTCCTTTTTTTCTCCGTTATTTTTGAAGAAATGAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCGTGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAAttt < 2:395377/299‑1 (MQ=255) accacCCCTTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCGTTGACGAAACTAGGAATAAAGAGATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTa < 1:558436/299‑1 (MQ=255) acCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTAACTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGc > 1:34203/1‑300 (MQ=255) cccTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGCACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTCGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGAAAATTCCCCCGC‑GAGAGGAAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGCTAACTGGAGATAATTTTTAGCAt > 1:517340/1‑301 (MQ=255) ttttCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCTCTC‑GCGGGGGAAGTTACCTTtctttttttttgcc < 1:385989/271‑12 (MQ=255) ttttCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTG‑ACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCTCAC‑CAGGGGGAAGGTACCtttttttttttttgcc > 2:385898/1‑258 (MQ=255) cATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATCGAGAACGCATTGAGAGATTAGATCG‑ACCAAG‑TTAGATCTAATTTCAGTAAGTC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTATCTCGC‑GAGAGGGAAGTTAACTTGCTCATTATATTTGTTAACTGAAGATAATTTTTAGCATTAGAGAATAACTgt > 2:126901/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |