| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,757,920 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (‑93/+94) | yiaY ← / ← selB | L‑threonine dehydrogenase/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3757920 = | 0 (0.000) | intergenic (‑93/+97) | yiaY/selB | L‑threonine dehydrogenase/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 107 (1.240) | 86/600 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3757923 | 0 (0.000) | intergenic (‑96/+94) | yiaY/selB | L‑threonine dehydrogenase/selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289815‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTATGATGGCAC < NC_000913/3757923‑3757625 tcttccgatcTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 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GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGC < 1:404917/300‑1 CTTGTTCGCACCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTTATCATATTTTCGAATGAACCTCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCACTGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTCCCTTAATTGTCTCTGACAATTTGTTAACGAACTTAGGTATGGCGGGCGATGTTCAAAAAGCACCGGAAGACCGCAATATTTTTAGCGTT > 2:330972/1‑301 ttctCCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTAT < 2:408732/297‑1 aaCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTATGAT < 2:599926/299‑1 CCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTATagat > 1:408734/1‑297 CCTTCCTTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTAAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTATGATG < 2:188711/301‑1 CATCGCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289815‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGATTAATTTTGATAATCAATAATACTGATCATATTTTCGAATGAAAATCCTCAGTAAGCTGCCCGCCCTTTTTTACACTTTCAGGAGTGTGTTATGGCAGCTTCAACGTTCTTTATTCCTTCTGTGAATGTCATCGGCGCTGATTCATTGACTGATGCAATGAATATGATGGCAGATTATGGATTTACCCGTACCTTAATTGTCACTGACAATATGTTAACGAAATTAGGTATGGCGGGCGATGTGCAAAAAGCACTGGAAGAACGCAATATTTTTAGCGTTATTTATGATGGCAC < NC_000913/3757923‑3757625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |