| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,350,122 | A→T | 6.6% | L514H (CTC→CAC) | dcuS ← | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,350,122 | 0 | A→T | 6.6% | 2.6 ‑1.0 ‑0.0 | 86 | L514H (CTC→CAC) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/3): ref base (48/28): total (52/34) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.66e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.94e-01 | ||||||||||
GGCAGTAAATCGAGCCCGTTCTCTTTTTGCATATAGATATCGAGCAATATCAGGTCGATAGGCGTATCGCTATTGAAGATAATCTCTTTGGCTTTCTCCAGCGTCGAGGCTGTTCCACAGCATTGAAAGCCTGGGATTTGTGCTACGTATCGGCGATTCAGCTCCGCGACCATTGCGTCGTCATCGATAATTAATACATTGATCATCTGTTCGACCTCTCCCCGTCCCAGGGTATCTGGACAAAAAATTGTGTGAAAATCCCGGGTTCCGATTCCACGGCGATGCTGCCGCCGAGATTTTCTACCTGTTGTTTGACAAGTGCTAAACCGACGCCTCGCTCGCTTCCTTTTGTCGAGACACCTTTGTCAAAAATGTGATCGATTTTATCGGGTGCGATCCCCGGTCCATCATCATTAACTTCACAGTGCAGCCAGCCGTGACGGTAGTGCAATGTTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATC > NC_000913/4349829‑4350418 | ggCAGTAAATCGAGCCCGTTCTCTTTTTGCATATAGATATCGAGCAATATCAGGTCGATAGGCGTATCGCTATTGAAGATAATCTCTTTGGCTTTCTCCAGCGTCGAGGCTGTTCCACAGCATTGAAAGCCTGGGATTTGTGCTACGTATCGGCGATTCAGCTCCGCGACCATTGCGTCGTCATCGATAATTAATACATTGATCATCTGTTCGACCTCTCCCCGTCCCAGGGTATCTGGACTAAAAATTGTGTGAAAATCCCGGGTTCCGATTCCACGGGCATGCTGCCTCCGTGAttttt > 2:374760/1‑300 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |