| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2700550 = | 90 (1.130) | 5 (0.070) | 5/530 | 9.2 | 6.0% | intergenic (‑353/+68) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 |
| ? | NC_000913 | 2700601 = | 73 (0.980) | intergenic (‑404/+17) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
AACTGAACGTGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCATTGAATACTTCAAATTGATTAAACGCCAGACCATTGCGGATCCCGGTGCCAAACGCTTTTGCTGCGGCTTCTTTCACAGCAAAACGCTTCGCC > NC_000913/2700255‑2700849 | aaCTGAACGTGTGAGGTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCGTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTTGAATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTaaaa < 1:668140/301‑1 (MQ=255) tGCGAGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAATTAAACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGTTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGAaaaaac > 1:424433/1‑299 (MQ=255) aattATTGAGGGTGCAGTCTGCACTCCCCACCAGGGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGTAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCg < 2:136615/299‑1 (MQ=255) aGTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCCCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGAAAGTTGCTTGTAAAAGTTAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTGTAGGTTGCATGCTGCACTAATTTAAAGTTAAACAGTattaacaccg > 1:290116/1‑292 (MQ=255) gTTATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCCCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGt > 2:665844/1‑301 (MQ=255) tATTGAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAGTGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGAATGCTGCTCAATATTAAATTTAAAAAGTCAAAccccattcc > 1:653651/1‑296 (MQ=255) ttGAGGGTGCATTCCTCACCCCACCCCAGAGCTTTGACGACAACCATCGTTTTAATGGGGGAATTCTGTTGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAAGCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTcc < 1:686800/300‑1 (MQ=255) gAGGGTGCATGCTGCACTCCACACCAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTCCACTGATCCATACTCGCTGTTGTTAAGGGTGCATGCTGCACAAAATTCAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCtt > 2:259779/1‑300 (MQ=255) ggggTGCATACGGCACTCAACACCAAGACTTTGCCGAAACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGTTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAc < 1:213918/300‑1 (MQ=255) gggTGCATGCTGCACTCCACACCATACGTTTGACGACACCACTCGTTTAAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAcc < 2:125627/301‑1 (MQ=255) 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ccacgacgagattccgatctcaacTCGTTTAAATTGTGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAAGAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACtt < 1:717669/279‑1 (MQ=255) cccAGAGCTTTGACGACACCCATCGTTTAAATTGGGGAATTCTGTGGCATGGTTTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACtttt < 1:120378/300‑1 (MQ=255) ccAGAGCTTTGACGACACCACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCACGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACttttt > 2:468568/1‑301 (MQ=255) 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acTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAATAGAACGGTATTAttt > 2:378379/1‑301 (MQ=255) ttaaaTGGGTTAATTTCGTTGCATTGTGTAAAGCACAGCAAAAACTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATAATGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAAc < 2:394225/297‑1 (MQ=255) ttCAATGGGGGAATTCTGTTGCATTGTTTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAAATGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAAc < 1:126396/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |